BMKCloud Log in
条形ಬ್ಯಾನರ್-03

ಉತ್ಪನ್ನಗಳು

DNA/RNA ಅನುಕ್ರಮ -PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸರ್

PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಮೂರನೇ ತಲೆಮಾರಿನ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (TGS) ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ.ಕೋರ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ, ಏಕ-ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ ರಿಯಲ್-ಟೈಮ್ (SMRT), ಹತ್ತಾರು ಕಿಲೋ-ಬೇಸ್ ಉದ್ದದೊಂದಿಗೆ ಓದುವಿಕೆಗಳ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಸಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ."ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಬೈ-ಸಿಂಥೆಸಿಸ್" ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಅನ್ನು ಶೂನ್ಯ-ಮೋಡ್ ವೇವ್‌ಗೈಡ್ (ZMW) ಮೂಲಕ ಸಾಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಕೆಳಭಾಗದಲ್ಲಿ (ಅಣುಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸೈಟ್) ಸೀಮಿತ ಪರಿಮಾಣವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಬೆಳಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಜೊತೆಗೆ, SMRT ಅನುಕ್ರಮವು NGS ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪಕ್ಷಪಾತವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ PCR ವರ್ಧನೆಯ ಹಂತಗಳು ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲ.

 

ವೇದಿಕೆ: ಸೀಕ್ವೆಲ್ II, ರೆವಿಯೊ


ಸೇವೆಯ ವಿವರಗಳು

ಡೆಮೊ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು

ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು

PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸರ್‌ನಲ್ಲಿ ಎರಡು ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನಗಳು: ನಿರಂತರ ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆ (CLR) ಮತ್ತು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಒಮ್ಮತದ ಓದುವಿಕೆ (CCS)

ಅನುಕ್ರಮ ಮೋಡ್ ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ಗಾತ್ರ ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಡೇಟಾಇಳುವರಿ (ಪ್ರತಿ ಸೆಲ್‌ಗೆ) ಏಕ-ಬೇಸ್ನಿಖರತೆ ಅರ್ಜಿಗಳನ್ನು
CLR 20 ಕೆಬಿ, 30 ಕೆಬಿ, ಇತ್ಯಾದಿ. 80 Gb ನಿಂದ 130 Gb ಅಂದಾಜು85% ಡಿ ನೋವೊ, SV ಕರೆ ಮಾಡುವಿಕೆ, ಇತ್ಯಾದಿ.
CCS 15-20 ಕೆಬಿ

14 ರಿಂದ 40 ಜಿಬಿ/ಸೆಲ್ (ಸೀಕ್ವೆಲ್ II)

70 ರಿಂದ 110 Gb/ಸೆಲ್ (Revio)

ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ

ಅಂದಾಜು99% ಡಿ ನೋವೊ, SNP/Indel/SV ಕಾಲಿಂಗ್, Iso-Seq,

Revio ಮತ್ತು ಸೀಕ್ವೆಲ್ II ರ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆ ಮತ್ತು ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ಹೋಲಿಕೆ

ನಿಯಮಗಳು

ಸೀಕ್ವೆಲ್ II ವ್ಯವಸ್ಥೆ

ರೆವಿಯೊ ವ್ಯವಸ್ಥೆ

ಹೆಚ್ಚಿಸಿ

ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರತೆ

8 ಮಿಲಿಯನ್ ZMW ಗಳು

25 ಮಿಲಿಯನ್ ZMW ಗಳು

3x

ಸ್ವತಂತ್ರ ಹಂತಗಳು

1

4

4x

ಕಡಿಮೆ ರನ್ ಸಮಯ

30 ಗಂಟೆಗಳು

24 ಗಂಟೆಗಳು

1.25x

30X HiFi ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು / ವರ್ಷ

88

1,300

1ಒಟ್ಟಾರೆ 5x

ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು

● ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಾವಿರಾರು ಮುಚ್ಚಿದ ಯೋಜನೆಗಳೊಂದಿಗೆ PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನಲ್ಲಿ 8 ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವ.

● ಇತ್ತೀಚಿನ PacBio ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸಜ್ಜುಗೊಂಡಿದೆ, ಸಾಕಷ್ಟು ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನ್ನು ಖಾತರಿಪಡಿಸಲು Revio.

● ವೇಗವಾಗಿ ತಿರುಗುವ ಸಮಯ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಡೇಟಾ ಇಳುವರಿ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಡೇಟಾ.

● ನೂರಾರು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಭಾವದ PacBio-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಲಾಗಿದೆ.

ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು


ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ ಮೊತ್ತ ಏಕಾಗ್ರತೆ (Qubit®) ಸಂಪುಟ ಶುದ್ಧತೆ ಇತರರು
ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ ಡೇಟಾ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
260 nm ನಲ್ಲಿ ಶಿಖರವನ್ನು ತೆರವುಗೊಳಿಸಿ,ಯಾವುದೇ ಮಾಲಿನ್ಯಗಳಿಲ್ಲ
ಕ್ವಿಟ್ ಮತ್ತು ಕ್ವಿಟ್/ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ = 0.8-2.5 ಮೂಲಕ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಅಗತ್ಯವಿದೆ
ಒಟ್ಟು RNA ≥1.2μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;ಯಾವುದೇ ಮಾಲಿನ್ಯಗಳಿಲ್ಲ

RIN ಮೌಲ್ಯ ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

ಸೇವೆಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು

ಮಾದರಿ ಸಿದ್ಧತೆ

ಮಾದರಿ ಸಿದ್ಧತೆ

ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ತಯಾರಿ

ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ

ಅನುಕ್ರಮ

ಅನುಕ್ರಮ

ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಮಾದರಿ QC

ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವಿತರಣೆ


  • ಹಿಂದಿನ:
  • ಮುಂದೆ:

  • 1.ಇನ್-ಹೌಸ್ ಡೇಟಾ ಇಳುವರಿ

    63 CCS ಕೋಶಗಳಿಂದ (26 ಜಾತಿಗಳಿಂದ) ಡೇಟಾವನ್ನು ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ

    ಡೇಟಾ-PacBio-CCS-15 Kb ಸರಾಸರಿ ಗರಿಷ್ಠ ಕನಿಷ್ಠ ಮಧ್ಯಮ
    ಇಳುವರಿ - ಉಪವಿಭಾಗಗಳು (ಜಿಬಿ) 421.12 544.27 221.38 426.58
    ಯಿಲ್ಡ್ - CCS(Gb) 25.93 38.59 10.86 25.43
    ಪಾಲಿಮರೇಸ್ N50 145,651 175,430 118,118 144,689
    ಉಪವಿಭಾಗಗಳು N50 17,509 23,924 12,485 17,584
    CCS N50 14,490 19,034 9,876 14,747
    ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ-ಪಾಲಿಮರೇಸ್ 67,995 89,379 49,664 66,433
    ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ-ಉಪರೆಡ್ಗಳು 15,866 21,036 11,657 16,012
    ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ-CCS 14,489 19,074 8,575 14,655

    16 CLR ಕೋಶಗಳಿಂದ (76 ಜಾತಿಗಳಿಂದ) ಡೇಟಾವನ್ನು ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ

    DATA-PacBio-CLR-30Kb ಸರಾಸರಿ ಗರಿಷ್ಠ ಕನಿಷ್ಠ ಮಧ್ಯಮ
    ಇಳುವರಿ - ಉಪವಿಭಾಗಗಳು (ಜಿಬಿ) 142.20 291.40 50.55 142.49
    ಪಾಲಿಮರೇಸ್ N50 39,456 121,191 15,389 35,231
    ಉಪವಿಭಾಗಗಳು N50 28,490 41,012 14,430 29,063
    ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ-ಪಾಲಿಮರೇಸ್ 22,063 48,886 8,747 21,555
    ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ-ಉಪರೆಡ್ಗಳು 17,720 27,225 8,293 17,779

    2.ಡೇಟಾ ಕ್ಯೂಸಿ - ಡೆಮೊಡೇಟಾ ಇಳುವರಿಯಲ್ಲಿ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು

    ಮಾದರಿ

    ccs ಸಂಖ್ಯೆ ಓದುತ್ತದೆ

    ಒಟ್ಟು ccs ಬೇಸ್‌ಗಳು (bp)

    ccs ಓದುತ್ತದೆ N50 (bp)

    ccs ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ (bp)

    ccs ಲಾಂಗೆಸ್ಟ್ ರೀಡ್ (bp)

    ಉಪಪಾಠಗಳ ಆಧಾರಗಳು (bp)

    ccs ದರ(%)

    PB_BMKxxx

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    ಒಂದು ಉಲ್ಲೇಖ ಪಡೆಯಲು

    ನಿಮ್ಮ ಸಂದೇಶವನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಬರೆಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ನಮಗೆ ಕಳುಹಿಸಿ

    ನಿಮ್ಮ ಸಂದೇಶವನ್ನು ನಮಗೆ ಕಳುಹಿಸಿ: