-
ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ChIP-seq)
ChIP-Seq ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡು, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ DNA-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳಿಗಾಗಿ DNA ಗುರಿಗಳ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೊಟೀನ್-ಡಿಎನ್‌ಎ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಮರುಪಡೆಯಲು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಇಮ್ಯುನೊ-ಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್‌ನ (ಚಿಪ್) ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ, ಮರುಪಡೆಯಲಾದ ಡಿಎನ್‌ಎಯ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಮುಂದಿನ ಪೀಳಿಗೆಯ ಅನುಕ್ರಮದ (ಎನ್‌ಜಿಎಸ್) ಶಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ.ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್-ಡಿಎನ್‌ಎ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಜೀವಂತ ಕೋಶಗಳಿಂದ ಮರುಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ವಿಭಿನ್ನ ಕೋಶ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಮತ್ತು ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ವಿಭಿನ್ನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೋಲಿಸಬಹುದು.ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್‌ಗಳು ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ನಿಯಂತ್ರಣದಿಂದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಮಾರ್ಗಗಳವರೆಗೆ ರೋಗದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೂ ಮೀರಿದವರೆಗೆ ಇರುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ 6000
-
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮ
ಸೈಟೋಸಿನ್ (5-mC) ನಲ್ಲಿ ಐದನೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣವು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಮೂಲಭೂತ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ಅಸಹಜ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಮಾದರಿಗಳು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್‌ನಂತಹ ಹಲವಾರು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ.ಒಂದೇ ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು WGBS ಚಿನ್ನದ ಮಾನದಂಡವಾಗಿದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ NovaSeq6000
-
ಹೈ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ATAC-seq) ಜೊತೆಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸೇಸ್-ಆಕ್ಸೆಸ್ಬಲ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್‌ಗಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ATAC-seq ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರವೇಶದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಜಾಗತಿಕ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕೆ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ.ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ Tn5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸೇಸ್ ಮೂಲಕ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅಡಾಪ್ಟರುಗಳನ್ನು ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಪಿಸಿಆರ್ ವರ್ಧನೆಯ ನಂತರ, ಅನುಕ್ರಮ ಗ್ರಂಥಾಲಯವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ.ಎಲ್ಲಾ ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳ-ಸಮಯದ ಸ್ಥಿತಿಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಪಡೆಯಬಹುದು, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳಿಗೆ ಅಥವಾ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಪ್ರದೇಶಕ್ಕೆ ಮಾತ್ರ ಸೀಮಿತವಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ.
-
ಕಡಿಮೆಯಾದ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (RRBS)
ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಯಾವಾಗಲೂ ರೋಗದ ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ ಬಿಸಿ ವಿಷಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಫಿನೋ-ಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ.ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಆರ್‌ಆರ್‌ಬಿಎಸ್ ನಿಖರ, ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಮತ್ತು ಆರ್ಥಿಕ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ.ಬಿಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಜೊತೆಗೆ ಎಂಜೈಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಕ್ಲೀವೇಜ್ (Msp I) ಮೂಲಕ ಪ್ರವರ್ತಕ ಮತ್ತು CpG ದ್ವೀಪ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣವು ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪತ್ತೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ 6000
