-
ಸಸ್ಯ/ಪ್ರಾಣಿ ಡಿ ನೋವೋ ಜಿನೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಡಿ ನೋವೊಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಎನ್ನುವುದು ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಜೀನೋಮ್‌ನ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜಾತಿಯ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ನ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್, ಎನ್‌ಜಿಎಸ್, ಇತ್ಯಾದಿ.ಮೂರನೇ ತಲೆಮಾರಿನ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಓದುವ ಉದ್ದದಲ್ಲಿನ ಗಮನಾರ್ಹ ಸುಧಾರಣೆಯು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಲ್ಲಿ ಹೊಸ ಅವಕಾಶಗಳನ್ನು ತಂದಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೆಟೆರೋಜೈಗೋಸಿಟಿ, ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಪಾತ, ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್‌ಗಳು, ಇತ್ಯಾದಿ. ಹತ್ತಾರು ಕಿಲೋಬೇಸ್‌ಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಓದುವ ಉದ್ದದೊಂದಿಗೆ, ಈ ಅನುಕ್ರಮ ಓದುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅಂಶಗಳ ಪರಿಹಾರ, ಅಸಹಜ ಜಿಸಿ ವಿಷಯಗಳಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣ ಪ್ರದೇಶಗಳು.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ ಸೀಕ್ವೆಲ್ II / ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ ಪಿ 48/ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ 6000
-
ಹೈ-ಸಿ ಆಧಾರಿತ ಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
ಹೈ-ಸಿ ಎನ್ನುವುದು ಪ್ರೋಬಿಂಗ್ ಸಾಮೀಪ್ಯ-ಆಧಾರಿತ ಸಂವಹನಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಕಾನ್ಫಿಗರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ.ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ತೀವ್ರತೆಯು ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಮೇಲಿನ ಭೌತಿಕ ಅಂತರದೊಂದಿಗೆ ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ.ಆದ್ದರಿಂದ, ಹೈ-ಸಿ ಡೇಟಾವು ಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್, ಆರ್ಡರ್ ಮತ್ತು ಓರಿಯೆಂಟಿಂಗ್ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಲಂಗರು ಹಾಕುತ್ತದೆ.ಈ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಜನಸಂಖ್ಯೆ-ಆಧಾರಿತ ಆನುವಂಶಿಕ ನಕ್ಷೆಯ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ.ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೈ-ಸಿ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ 6000 / ಡಿಎನ್‌ಬಿಎಸ್‌ಇಕ್ಯೂ
-
ವಿಕಸನೀಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್
ಎವಲ್ಯೂಷನರಿ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಎನ್ನುವುದು SNP ಗಳು, InDels, SV ಗಳು ಮತ್ತು CNV ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಆನುವಂಶಿಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ನೀಡಿದ ವಸ್ತುಗಳ ವಿಕಸನೀಯ ಮಾಹಿತಿಯ ಮೇಲೆ ಸಮಗ್ರ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ಯಾಕ್ಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯಾಗಿದೆ.ಇದು ವಿಕಸನೀಯ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಆನುವಂಶಿಕ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಮೂಲಭೂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆ, ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆ, ಫೈಲೋಜೆನಿ ಸಂಬಂಧಗಳು, ಇತ್ಯಾದಿ. ಇದು ಜೀನ್ ಹರಿವಿನ ಮೇಲಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಗಾತ್ರ, ಭಿನ್ನತೆಯ ಸಮಯವನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್
ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಎಂದರೆ ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸುವುದು.ಈ ಶಿಸ್ತು ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅಥವಾ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಅನುಕ್ರಮ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಂಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಮೂಲಕ ಜೀನೋಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಜಾತಿಯ ವಿಕಸನ, ಜೀನ್ ಕಾರ್ಯ, ಜೀನ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಅಧ್ಯಯನವು ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬ, ವಿಕಸನೀಯ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ನಕಲು, ಆಯ್ದ ಒತ್ತಡ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
-
ಬಲ್ಕ್ಡ್ ಸೆಗ್ರೆಗಂಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಬಲ್ಕ್ಡ್ ಸೆಗ್ರೆಗಂಟ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ (BSA) ಎನ್ನುವುದು ಫಿನೋಟೈಪ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸುವ ಒಂದು ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ.BSA ಯ ಮುಖ್ಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು ಅತ್ಯಂತ ವಿರುದ್ಧವಾದ ಫಿನೋಟೈಪ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡುತ್ತದೆ, ಎಲ್ಲಾ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ DNA ಅನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸಿ ಎರಡು ಬೃಹತ್ DNA ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಎರಡು ಪೂಲ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ.ಸಸ್ಯ/ಪ್ರಾಣಿ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಉದ್ದೇಶಿತ ಜೀನ್‌ಗಳಿಂದ ಬಲವಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿತವಾಗಿರುವ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವಲ್ಲಿ ಈ ತಂತ್ರವನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ.
