mRNA-seq (NGS) – ಡಿ ನೊವೊ

mRNA ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ mRNA ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವಾಗಿದೆ. BMKCloud De novo mRNA-seq ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಅನ್ನು ಯಾವುದೇ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಲಭ್ಯವಿಲ್ಲದಿದ್ದಾಗ ಪಾಲಿ-ಎ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮ ಗ್ರಂಥಾಲಯಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣದೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ, ನಂತರಹೊಸದುಪ್ರತಿಲಿಪಿ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಏಕಜೀನ್ ಸೆಟ್ ಆಯ್ಕೆ. ಏಕಜೀನ್ ರಚನೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮ (CDS) ಮತ್ತು ಸರಳ ಅನುಕ್ರಮ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು (SSR) ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ತರುವಾಯ, ಭೇದಾತ್ಮಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು (DEGs) ಕಂಡುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಜೈವಿಕ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು DEGs ನ ಪುಷ್ಟೀಕರಣವನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.