ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಟಿಜಿಎಸ್
ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಬೆಳೆಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಬೆಳೆಸಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಶಾಟ್ಗನ್ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮದ ಆಗಮನವು ಕ್ಷೇತ್ರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಿದೆ. ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಕೆಳಮುಖ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ, ಹೆಚ್ಚು ನಿರಂತರ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೋಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಕೀರ್ಣ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಉತ್ಪಾದಿಸಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ (ಮಾಸ್, ಇಎಲ್, ಮತ್ತು ಇತರರು, ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್, 2020). ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ರೀಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುವುದರಿಂದ ದೋಷ ತಿದ್ದುಪಡಿಗೆ ಒಂದು ಕಾರ್ಯತಂತ್ರದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ನ ಅಂತರ್ಗತ ಕಡಿಮೆ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ತಗ್ಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಿನರ್ಜಿಸ್ಟಿಕ್ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಪ್ರತಿ ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಭಾವ್ಯ ಮಿತಿಗಳನ್ನು ನಿವಾರಿಸಲು ಮತ್ತು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ದೃಢವಾದ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ 48, ಇಲ್ಯುಮಿಯಾ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ P48 (10Kb ಲೈಬ್ರರಿ); ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ (8Kb ಲೈಬ್ರರಿ) ನಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘ ಓದುವ ಅನುಕ್ರಮ.
● ದೋಷ-ತಿದ್ದುಪಡಿ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ (PE150 ಲೈಬ್ರರಿ) ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ:ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿರಂತರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕಡಿಮೆ ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳೊಂದಿಗೆ.
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ:ಜಾತಿಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ.
● ● ದಶಾಸುಧಾರಿತ ಜೋಡಣೆ: ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ ಮತ್ತು ತುಲನಾತ್ಮಕ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುವುದು.
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:ನಮ್ಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ವರ್ಗೀಕರಣದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೇಲೆ ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ ಸಮುದಾಯದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೇಲೂ ಕೇಂದ್ರೀಕೃತವಾಗಿದೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವ: ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ, ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಬಹು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಮುಚ್ಚಿದ ಮತ್ತು 200,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ | ಪಿಇ150 | 6 ಜಿಬಿ |
| ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ P48 | 10 ಕೆಬಿ | 6/10 ಜಿಬಿ |
| ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ | 8 ಕೆಬಿ | 10/20 ಜಿಬಿ |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಪ್ರಮಾಣ (µg) | ವಾಲ್ಯೂಮ್ (μL) | |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 ಲೈಬ್ರರಿ | ≥1 | ≥0.03 | ≥20 |
| ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ 10 ಕೆಬಿ ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ≥40 | ≥2 | ≥20 |
| ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ 8 ಕೆಬಿ ಲೈಬ್ರರಿ | ≥50 | 10 µg/ಕೋಶ | ≥20 |
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● ಮೆಟಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
● ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
● ವರ್ಗೀಕರಣ ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಸಮುದಾಯದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಜೈವಿಕ ಕಾರ್ಯ, ಚಯಾಪಚಯ, ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧ
● ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ವರ್ಗೀಕರಣ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಎರಡರ ಕುರಿತಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಅಂತರ-ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೊರಗಿನ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
ಅನಗತ್ಯ ಜೀನ್ ಸೆಟ್ ವಿತರಣೆ:
ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ: KEGG ಮಾರ್ಗ
ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ: eggNOG
ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ: CAZY ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್ಗಳು
ಜಾತಿಗಳ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಜಾಲ:
ಈ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಪೂರ್ಣ ಪ್ರಕಟಣೆಯೊಂದಿಗೆ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ + ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಜೊತೆಗಿನ BMKGene ನ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ:
ಜಿನ್, ಹೆಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಇನ್ನರ್ ಮಂಗೋಲಿಯನ್ನರ ಮಾನವ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಸಂಕಲನ', ನೇಚರ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯಾಲಜಿ 2023 8:1, 8(1), ಪುಟಗಳು 150–161. doi: 10.1038/s41564-022-01270-1.
