ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ 2+3 ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಪರಿಹಾರ
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸ:
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಜೊತೆ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಮಾದರಿ.
ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಮಾದರಿಗಳು (ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳು ಮತ್ತು ಪರೀಕ್ಷಿಸಬೇಕಾದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು) ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿಪ್ರತಿಲಿಪಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪರಿಮಾಣೀಕರಿಸಲು NGS
● CCS ಮೋಡ್ನಲ್ಲಿ PacBio ಅನುಕ್ರಮ, ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವುದು
● ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮ
● ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು
● ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಜೀನ್ ಮತ್ತು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ lncRNA, ಜೀನ್ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳು, ಪಾಲಿ-ಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
ಅನುಕೂಲಗಳು
● ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ: ಹೈಫೈ ನಿಖರತೆ >99.9% (Q30) ನೊಂದಿಗೆ ಓದುತ್ತದೆ, NGS ಗೆ ಹೋಲಿಸಬಹುದು
● ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದರಿಂದ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
● ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಮತ್ತು ಎನ್ಜಿಎಸ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳ ಸಂಯೋಜನೆ: ಇದು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಪರಿಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇಡೀ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವಾಗ ಮರೆಮಾಡಬಹುದಾದ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
● ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ನಾವು 2300 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ್ದೇವೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
● ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ: ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| PolyA ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ mRNA CCS ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಸೀಕ್ವೆಲ್ II ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ | 20/40 ಜಿಬಿ 5/10 ಎಂ ಸಿಸಿಎಸ್ | ಕ್ಯೂ30≥85% |
| ಪಾಲಿ ಎ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 | 6-10 ಜಿಬಿ | ಕ್ಯೂ30≥85% |
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು
|
| ಒಟ್ಟು (ng/μl) | ಪ್ರಮಾಣ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ≥ 10 | ≥ 0.2 | ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್ ಮೇಲೆ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯ ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥4.0; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥4.5; 5.0≥28ಎಸ್/18ಎಸ್≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಮೂಲ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
| ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ≥ 100 | ≥ 1.0 | ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್ ಮೇಲೆ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯ ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳು: RIN≥7.5 ಪ್ರಾಣಿಗಳು: RIN≥8.0 5.0≥28ಎಸ್/18ಎಸ್≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಮೂಲ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೇನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ಸಾಗಣೆ:
1. ಡ್ರೈ-ಐಸ್:ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಿ ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2. ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೆಬಿಲೈಸೇಶನ್ ಟ್ಯೂಬ್ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾ ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
- ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ
- ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
- ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (APA)
- ಸಮ್ಮಿಳನ ಪ್ರತಿಲಿಪಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಬೆಂಚ್ಮಾರ್ಕಿಂಗ್ ಯೂನಿವರ್ಸಲ್ ಸಿಂಗಲ್-ಕಾಪಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ (BUSCO) ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಕಾದಂಬರಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಭವಿಷ್ಯ (CDS) ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
- lncRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: lncRNA ಮತ್ತು ಗುರಿಗಳ ಭವಿಷ್ಯ
- ಮೈಕ್ರೋಸ್ಯಾಟಲೈಟ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (SSR)
- ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ (DETs) ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳ (DEGs) ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- DEG ಗಳು ಮತ್ತು DET ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು
ಬುಸ್ಕೋ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಅಡೆನಿಲೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (APA)
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳು (DEG ಗಳು) ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳು (DETs9 ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು)
DET ಗಳು ಮತ್ತು DEG ಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ ಜಾಲಗಳು
BMKGene ನ PacBio 2+3 ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಅನುಕ್ರಮವು ಸುಗಮಗೊಳಿಸಿದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಚಾವೊ, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2019) 'ಪಾಪ್ಯುಲಸ್ ಕಾಂಡದ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ',ಸಸ್ಯ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಜರ್ನಲ್, 17(1), ಪುಟಗಳು 206–219. doi: 10.1111/PBI.12958.
ಡೆಂಗ್, ಹೆಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಆಕ್ಟಿನಿಡಿಯಾ ಲ್ಯಾಟಿಫೋಲಿಯಾ (ಆಸ್ಕೋರ್ಬೇಟ್-ಸಮೃದ್ಧ ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳೆ) ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಹಣ್ಣಾಗುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಆಸ್ಕೋರ್ಬಿಕ್ ಆಮ್ಲದ ಅಂಶದಲ್ಲಿನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು',ಅಂತರರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್ ಜರ್ನಲ್, 23(10), ಪು. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
ಹುವಾ, ಎಕ್ಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಪ್ಯಾರಿಸ್ ಪಾಲಿಫಿಲ್ಲಾದಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಸಕ್ರಿಯ ಪಾಲಿಫಿಲಿನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಮಾರ್ಗ ಜೀನ್ಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಭವಿಷ್ಯ',ಸಂವಹನ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ2022 5:1, 5(1), ಪುಟಗಳು 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ಲಿಯು, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಟುಟಾ ಅಬ್ಸೊಲುಟಾ (ಮೇರಿಕ್) ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಕ್ರೋಮ್ P450 ಜೀನ್ಗಳ ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಐಸೊ-ಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ',ಕೀಟಗಳು, 14(4), ಪುಟ 363. doi: 10.3390/INESCTS14040363/S1.
ವಾಂಗ್, ಲಿಜುನ್ ಮತ್ತು ಇತರರು (2019) 'ರಿಸಿನಸ್ ಕಮ್ಯುನಿಸ್ನಲ್ಲಿ ರಿಕಿನೋಲಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಗಾಗಿ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಏಕ-ಅಣು ನೈಜ-ಸಮಯದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯ ಸಮೀಕ್ಷೆ',BMC ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 20(1), ಪುಟಗಳು 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9/FIGURES/7.
