ಪ್ಯಾಕ್ಬಿಯೊ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ
ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್, ಐಸೋಸೆಕ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳ ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಡೆನಿಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಮೇಲೆ ಬೆಳಕು ಚೆಲ್ಲುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. BMKCloud PacBio ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಪೈಪ್ಲೈನ್ ಅನ್ನು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮ (CCS) ಮೋಡ್ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾದ cDNA ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ನಾನ್-ಕೈಮೆರಿಕ್ (FLNC) ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಅವುಗಳನ್ನು ಅನಗತ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳಾಗಿ ಸಮೂಹಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಂತರದ BUSCO ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯ ಸಂಪೂರ್ಣತೆಯನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸುತ್ತದೆ. ಜೋಡಿಸಲಾದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ನಿಂದ, ಬಹು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ: ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್, ಸರಳ ಅನುಕ್ರಮ ಪುನರಾವರ್ತನೆ (SSR), lncRNA ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಗುರಿ ಜೀನ್ಗಳ ಭವಿಷ್ಯ, ಕಾದಂಬರಿ ಜೀನ್ಗಳ ಭವಿಷ್ಯ, ಜೀನ್ ಕುಟುಂಬ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ.
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್