ಸಸ್ಯ/ಪ್ರಾಣಿ ಡಿ ನೊವೊ ಜಿನೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಡಿ ನೋವೋಅನುಕ್ರಮವು ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಇಲ್ಲದಿರುವಾಗ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಒಂದು ಜಾತಿಯ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ನ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ದೀರ್ಘ ಓದುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಮೂರನೇ ತಲೆಮಾರಿನ ಅನುಕ್ರಮದ ಪರಿಚಯ ಮತ್ತು ವ್ಯಾಪಕ ಅಳವಡಿಕೆಯು ಓದುಗಳ ನಡುವಿನ ಅತಿಕ್ರಮಣವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಮೂಲಕ ಜಿನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿಸಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೆಟೆರೋಜೈಗೋಸಿಟಿ, ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಪಾತ, ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳು, ಅಸಹಜ ಜಿಸಿ ವಿಷಯಗಳು ಅಥವಾ ಕಡಿಮೆ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕಳಪೆಯಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವಂತಹ ಸವಾಲಿನ ಜೀನೋಮ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯವಹರಿಸುವಾಗ ಈ ವರ್ಧನೆಯು ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತುತವಾಗಿದೆ.
ನಮ್ಮ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರವು ಸಂಯೋಜಿತ ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಡಿ ನೊವೊ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾದೊಂದಿಗಿನ ಆರಂಭಿಕ ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆಯು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯ ಅಂದಾಜುಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಹೈಫೈ ಜೊತೆ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮದ ಮುಂದಿನ ಹಂತಕ್ಕೆ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ನೀಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ನಂತರಹೊಸದುಕಾಂಟಿಗ್ಗಳ ಜೋಡಣೆ. ನಂತರದ ಹೈಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯ ಬಳಕೆಯು ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಲಂಗರು ಹಾಕಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಜೀನ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಸಣ್ಣ ಮತ್ತು ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ಗಳನ್ನು ಆಶ್ರಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ಸೇವೆಗಳನ್ನು ಒಂದೇ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಏಕೀಕರಣಗೊಳಿಸುವುದು:
ಜಿನೋಮ್ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ನಂತರದ ಹಂತಗಳಿಗೆ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ನೀಡಲು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಜೊತೆ ಜಿನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ;
ದೀರ್ಘ ಓದುವ ಅನುಕ್ರಮಹೊಸದುಕಾಂಟಿಗ್ಗಳ ಜೋಡಣೆ;
ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಆಂಕರ್ ಮಾಡಲು ಹೈ-ಸಿ ಅನುಕ್ರಮ;
ಜೀನ್ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಾಗಿ mRNA ಅನುಕ್ರಮ;
ಸಭೆಯ ಊರ್ಜಿತಗೊಳಿಸುವಿಕೆ.
● ಆಸಕ್ತಿಯ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಹೊಸ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಅಥವಾ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಸುಧಾರಣೆಗೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ಸೇವೆ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಗಳು ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಹೊಸದುಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ
(ಅಮರಸಿಂಘೆ ಎಸ್ಎಲ್ ಮತ್ತು ಇತರರು,ಜೀನೋಮ್ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, 2020)
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆ: ಡಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಮತ್ತು ಅಲೋಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿ BMKGene ಬೃಹತ್ ಅನುಭವವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದೆ. 2018 ರಿಂದ, ನಾವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ್ದೇವೆ300 ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುವ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳು, ಮತ್ತು ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 20+ ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾಗಿವೆ..
● ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರ: ನಮ್ಮ ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಧಾನವು ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಗ್ಗೂಡಿಸುವ ಕೆಲಸದ ಹರಿವಿನೊಳಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾನಿಮ್ಮ ಅಗತ್ಯಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ: ನಮ್ಮ ಸೇವಾ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹವು ಗ್ರಾಹಕೀಯಗೊಳಿಸಬಹುದಾದದ್ದು, ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಶೋಧನಾ ಅಗತ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ದೈತ್ಯ ಜೀನೋಮ್ಗಳು, ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳು, ಹೆಚ್ಚು ಹೆಟೆರೋಜೈಗಸ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ತಂಡ: ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಳು ಮತ್ತು ಪೇಟೆಂಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಹಕ್ಕುಸ್ವಾಮ್ಯಗಳ ಸರಣಿಯ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಎರಡರಲ್ಲೂ ಉತ್ತಮ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ.
● ● ದಶಾಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ | ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ | ವರ್ಣತಂತು-ಮಟ್ಟ | ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ |
| 50X ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ PE150
| 30X ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಸಿಸಿಎಸ್ ಹೈಫೈ ಓದುವಿಕೆಗಳು | 100X ಹೈ-ಸಿ | RNA-seq ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 10 Gb + (ಐಚ್ಛಿಕ) ಪೂರ್ಣ ಉದ್ದದ RNA-seq PacBio 40 Gb ಅಥವಾ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ 12 ಜಿಬಿ |
ಸೇವಾ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ, ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಾಗಿ:
| ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು | ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಜೊತೆ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ | ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ |
| ಪ್ರಾಣಿ ವಿಸ್ಸೆರಾ | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ | ≥2 ಗ್ರಾಂ |
| ಪ್ರಾಣಿ ಸ್ನಾಯು | ≥ 5 ಗ್ರಾಂ | ||
| ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ | 1.5 ಮಿ.ಲೀ.
| ≥ 5 ಮಿ.ಲೀ. | ≥2 ಮಿಲಿ |
| ಕೋಳಿ/ಮೀನಿನ ರಕ್ತ | ≥ 0.5 ಮಿ.ಲೀ. | ||
| ಸಸ್ಯ- ತಾಜಾ ಎಲೆ | 1-2 ಗ್ರಾಂ | ≥ 5 ಗ್ರಾಂ | ≥ 4 ಗ್ರಾಂ |
| ಕಲ್ಚರ್ಡ್ ಕೋಶಗಳು |
| ≥ 1x108 | ≥ 1x107 |
| ಕೀಟ | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ | ≥ 3 ಗ್ರಾಂ | ≥ 2 ಗ್ರಾಂ |
| ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಡಿಎನ್ಎ | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥1 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ ≥ 30 ng ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 50 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ: 10 µg/ಹರಿವಿನ ಕೋಶ/ಮಾದರಿ ಓಡಿ260/280=1.7-2.2 ಓಡಿ260/230=1.8-2.5 ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ |
-
|
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಾಗಿ:
| ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ | ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ |
| ಸಸ್ಯ- ಬೇರು/ಕಾಂಡ/ದಳ | 450 ಮಿಗ್ರಾಂ | 600 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಸಸ್ಯ - ಎಲೆ/ಬೀಜ | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಸಸ್ಯ - ಹಣ್ಣು | 1.2 ಗ್ರಾಂ | 1.2 ಗ್ರಾಂ | |
| ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಹೃದಯ/ಕರುಳು | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಒಳಾಂಗಗಳು/ಮೆದುಳು | 240 ಮಿಗ್ರಾಂ | 240 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಪ್ರಾಣಿ ಸ್ನಾಯು | 450 ಮಿಗ್ರಾಂ | 450 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಮೂಳೆಗಳು/ಕೂದಲು/ಚರ್ಮ | 1 ಗ್ರಾಂ | 1 ಗ್ರಾಂ | |
| ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ - ಕೀಟ | 6 | 6 | |
| ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ - ಕ್ರುಸ್ಟಾಸಿಯಾ | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | 300 ಮಿಗ್ರಾಂ | |
| ಸಂಪೂರ್ಣ ರಕ್ತ | 1 ಟ್ಯೂಬ್ | 1 ಟ್ಯೂಬ್ | |
| ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಆರ್ಎನ್ಎ | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 20 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ ≥ 0.3 µg ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಆರ್ಐಎನ್≥ 6 5≥28ಸೆ/18ಸೆ≥1 | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 100 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ ≥ 0.75 µg ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಆರ್ಐಎನ್≥ 8 5≥28ಸೆ/18ಸೆ≥1 | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 100 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ ≥ 0.75 µg ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಆರ್ಐಎನ್≥ 7.5 5≥28ಸೆ/18ಸೆ≥1 |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೇನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ)
(ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು, ಎಥೆನಾಲ್ನಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸದಂತೆ ನಾವು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಬೇಕು ಮತ್ತು ಸಲ್ಲಿಸಿದ ಮಾದರಿ ಮಾಹಿತಿ ನಮೂನೆಗೆ ಹೋಲಬೇಕು.
ಸಾಗಣೆ: ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಿ ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಡಿಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, 4 ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ:
1) NGS ಜೊತೆಗಿನ k-mer ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆಯು ಹೀಗೆ ಹೇಳುತ್ತದೆ:
ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ ಅಂದಾಜು
ಹೆಟೆರೋಜೈಗೋಸಿಟಿಯ ಅಂದಾಜು
ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಅಂದಾಜು
2) ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಹೈಫೈ ಜೊತೆ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ:
ಡಿ ನೊವೊಜೋಡಣೆ
ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ: ಜೀನೋಮ್ ಸಂಪೂರ್ಣತೆಗಾಗಿ BUSCO ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು NGS ಮತ್ತು PacBio ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಬ್ಯಾಕ್ ಸೇರಿದಂತೆ.
3) ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ:
ಹೈ-ಸಿ ಲೈಬ್ರರಿ ಕ್ಯೂಸಿ: ಮಾನ್ಯ ಹೈ-ಸಿ ಸಂವಹನಗಳ ಅಂದಾಜು
ಹೈ-ಸಿ ಜೋಡಣೆ: ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್, ನಂತರ ಪ್ರತಿ ಗುಂಪಿನೊಳಗೆ ಕಾಂಟಿಗ್ ಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಕಾಂಟಿಗ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ನಿಯೋಜಿಸುವುದು.
ಹೈ-ಸಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
4) ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ:
ಸಂಕೇತಿಸದ RNA ಭವಿಷ್ಯ
ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಟಂಡೆಮ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳು)
ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
§ಡಿ ನೊವೊ: ಆರಂಭಿಕ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು
§ ಹೋಮೋಲಜಿಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿ
§ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, ದೀರ್ಘ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಓದುಗಳೊಂದಿಗೆ: ಓದುಗಳುಹೊಸದುಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ
§ ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಊಹಿಸಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ
1) ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ- ಕೆ-ಮರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
2) ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
2) ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ - ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಹೈಫೈ ಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗೆ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಓದುತ್ತದೆ
2) ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ - ಹೈ-ಸಿ ಮಾನ್ಯ ಸಂವಹನ ಜೋಡಿಗಳ ಅಂದಾಜು
3) ಹೈ-ಸಿ ನಂತರದ ಜೋಡಣೆ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
4) ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ - ಊಹಿಸಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಏಕೀಕರಣ
4) ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ - ಊಹಿಸಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ
BMKGene ನ ಡಿ ನೊವೊ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ:
ಲಿ, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2021) 'ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರಸರಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ', ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್, 12(1). doi: 10.1038/S41467-021-21379-X.
ಲಿ, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ದೊಡ್ಡ-ಪ್ರಮಾಣದ ವರ್ಣತಂತು ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಗಾಯಲ್ (ಬಾಸ್ ಫ್ರಂಟಾಲಿಸ್) ನಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳು, ಪರಿಸರ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮತ್ತು ವಿಶೇಷಣಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ', ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ವಿಕಸನ, 40(1). doi: 10.1093/MOLBEV/MSAD006.
ಟಿಯಾನ್, ಟಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಪ್ರಮುಖ ಬರ-ನಿರೋಧಕ ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ಜರ್ಮ್ಪ್ಲಾಸಂನ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಡಿಸೆಕ್ಷನ್', ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ 2023 55:3, 55(3), ಪುಟಗಳು 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
ಜಾಂಗ್, ಎಫ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಸೋಲನೇಸಿ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿನ ಎರಡು ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಟ್ರೋಪೇನ್ ಆಲ್ಕಲಾಯ್ಡ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಕಾಸವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವುದು', ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್ 2023 14:1, 14(1), ಪುಟಗಳು 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ಸವಾಲಿನ ಪ್ರಕರಣ ಅಧ್ಯಯನಗಳು:
ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೋಡಣೆ:ಫೂ, ಎ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಕಹಿ ಕಲ್ಲಂಗಡಿಯ ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ (ಮೊಮೊರ್ಡಿಕಾ ಚರಂತಿಯಾ ಎಲ್. ವರ್. ಅಬ್ರೆವಿಯಾಟಾ ಸೆರ್.) ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಮಾಗಿದ ಆನುವಂಶಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ', ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 10(1). doi: 10.1093/HR/UHAC228.
ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ:ಹು, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2021) 'ಆಲೀಲ್-ಡಿಫೈನ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ ಕ್ಯಾಸವ ವಿಕಾಸದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬೈಯಾಲೆಲಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ', ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಪ್ಲಾಂಟ್, 14(6), ಪುಟಗಳು 851–854. doi: 10.1016/j.molp.2021.04.009.
ದೈತ್ಯ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ:ಯುವಾನ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಗಿಗಾ-ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆಧಾರ ಮತ್ತು ಮರದ ಪಿಯೋನಿ ಪಿಯೋನಿಯಾ ಓಸ್ಟಿಯ ಗಿಗಾ-ಜೀನೋಮ್', ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್ 2022 13:1, 13(1), ಪುಟಗಳು 1–16. doi: 10.1038/s41467-022-35063-1.
ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ:ಜಾಂಗ್, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಆಟೋಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಕಬ್ಬಿನ ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಣತಂತು ಕಡಿತದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು ಸ್ಯಾಕರಮ್ ಸ್ಪಾಂಟೇನಿಯಂ', ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ 2022 54:6, 54(6), ಪುಟಗಳು 885–896. doi: 10.1038/s41588-022-01084-1.
