ಸಸ್ಯ/ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
ಡಿ ನೊವೊ
ಈ ತಂತ್ರವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಹೆಟೆರೋಜೈಗೋಸಿಟಿ, ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳು, ಪಾಲಿಪೋಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳು, ಅಸಹಜ CG ವಿಷಯಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಸವಾಲಿನ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ.
ನಮ್ಮ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರವು ಸಂಯೋಜಿತ ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಡಿ ನೊವೊ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾದೊಂದಿಗಿನ ಆರಂಭಿಕ ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆಯು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯ ಅಂದಾಜುಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಹೈಫೈ ಜೊತೆ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮದ ಮುಂದಿನ ಹಂತಕ್ಕೆ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ನೀಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ನಂತರಹೊಸದುಕಾಂಟಿಗ್ಗಳ ಜೋಡಣೆ. ನಂತರದ ಹೈಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯ ಬಳಕೆಯು ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಲಂಗರು ಹಾಕಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಜೀನ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಸಣ್ಣ ಮತ್ತು ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ಗಳನ್ನು ಆಶ್ರಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
-- ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ಸೇವೆಗಳನ್ನು ಒಂದೇ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಏಕೀಕೃತ ಪರಿಹಾರವಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿಸುವುದು.ನಿರ್ಮಾಣದ ನವೀನತೆಗೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ಸೇವೆ
-- ಆಸಕ್ತಿಯ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಅಥವಾ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಸುಧಾರಣೆ.
ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆ
-- ಗ್ರಂಥಾಲಯ ಸಿದ್ಧತೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಅಥವಾ PCR-ಮುಕ್ತವಾಗಿರಬಹುದು.
-- 4 ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್, ಎಂಜಿಐ ಟಿ 7, ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ ಪಿ 48 ಅಥವಾ ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ.
-- ರೂಪಾಂತರ ಕರೆ ಮಾಡುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: SNP, InDel, SV ಮತ್ತು CNV
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆ: ಫಾರ್ಹೊಸದುಸೇವೆಗಳೊಂದಿಗೆ, ಡಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಮತ್ತು ಅಲೋಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಪ್ರಭೇದಗಳ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜಾತಿಗಳ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿ ನಾವು ಬೃಹತ್ ಅನುಭವವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ್ದೇವೆ. 2018 ರಿಂದ, ನಾವು 300 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುವ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳಿಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 20+ ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾಗಿವೆ. ಜೀನೋಮ್ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮೀಕರಣದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ನಾವು 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ್ದೇವೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ 5000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಚಿತ ಪ್ರಭಾವದ ಅಂಶದೊಂದಿಗೆ 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಕಟಿತ ಪ್ರಕರಣಗಳು ಕಂಡುಬಂದವು.
● ● ದಶಾಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರ: ಆನ್ಹೊಸದುಅನುಕ್ರಮಣಿಕೆಯಲ್ಲಿ, ನಮ್ಮ ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಧಾನವು ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಗ್ಗೂಡಿಸುವ ಕೆಲಸದ ಹರಿವಿನೊಳಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾನಿಮ್ಮ ಅಗತ್ಯಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ: ನಮ್ಮ ಸೇವಾ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹವು ಗ್ರಾಹಕೀಯಗೊಳಿಸಬಹುದಾದದ್ದು, ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಶೋಧನಾ ಅಗತ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ತಂಡ: ಅದು ಇರಲಿಹೊಸದುಅನುಕ್ರಮ ಅಥವಾ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಯೋಜನೆಯ ಯಶಸ್ಸನ್ನು ಖಾತರಿಪಡಿಸಲು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ಪರಿಕರಗಳು ಮತ್ತು ಜ್ಞಾನವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದನ್ನು ಅವರು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಪೇಟೆಂಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಹಕ್ಕುಸ್ವಾಮ್ಯಗಳ ಸರಣಿಯಿಂದ ದೃಢೀಕರಿಸಬಹುದು.
● ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಕರೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಸೇರಿದಂತೆ.
● ● ದಶಾಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ: ಗುರುತಿಸಲಾದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ನಾವು ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ, ನಿಮ್ಮ ಸಂಶೋಧನಾ ಯೋಜನೆಗಳ ಕುರಿತು ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗುರುತಿಸಬೇಕಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳು | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಆಳ |
| SNP ಮತ್ತು InDel | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ PE150 ಅಥವಾ MGI T7 | 10x |
| SV ಮತ್ತು CNV (ಕಡಿಮೆ ನಿಖರತೆ) | 30x | |
| SV ಮತ್ತು CNV (ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರ) | ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರಾಮ್ P48 | 20x |
| SNPಗಳು, ಇಂಡೆಲ್ಗಳು, SV ಮತ್ತು CNV | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ | 10x |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ/ಎಂಜಿಐ | ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ
| ||
| ಪ್ರಾಣಿ ವಿಸ್ಸೆರಾ | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ | ≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಪ್ರಾಣಿ ಸ್ನಾಯು | ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| |||
| ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ | 1.5 ಮಿ.ಲೀ. | ≥ 0.5 ಮಿ.ಲೀ.
| ≥ 5 ಮಿ.ಲೀ.
| ||
| ಕೋಳಿ/ಮೀನಿನ ರಕ್ತ | ≥ 0.1 ಮಿ.ಲೀ.
| ≥ 0.5 ಮಿ.ಲೀ.
| |||
| ಸಸ್ಯ- ತಾಜಾ ಎಲೆ | 1-2 ಗ್ರಾಂ | ≥ 2 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಕಲ್ಚರ್ಡ್ ಕೋಶಗಳು |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| ಕೀಟ ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ವೈಯಕ್ತಿಕ | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ | ≥ 1 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 3 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಡಿಎನ್ಎ
| ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 1 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ: ≥ 30 ng ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ
| ಏಕಾಗ್ರತೆ ಮೊತ್ತ
ಒಡಿ260/280
ಒಡಿ260/230
ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ
| ≥ 40 ng/ μL 4 µg/ಹರಿವಿನ ಕೋಶ/ಮಾದರಿ
೧.೭-೨.೨
≥1.5 | ಏಕಾಗ್ರತೆ ಮೊತ್ತ
ಒಡಿ260/280
ಒಡಿ260/230
ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ | ≥ 50 ng/ μL 10 µg/ಹರಿವಿನ ಕೋಶ/ಮಾದರಿ
೧.೭-೨.೨
1.8-2.5 |
| ಪಿಸಿಆರ್-ಮುಕ್ತ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿ: ಸಾಂದ್ರತೆ≥ 40 ng/ µL ಪ್ರಮಾಣ≥ 500 ng | |||||
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಡಿಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಡೇಟಾ ವಿತರಣೆ
ಡಿ ನೊವೊಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪೈಪ್ಲೈನ್
ನಮ್ಮ ವಿವಿಧ ಜೋಡಣೆ ಪೈಪ್ಲೈನ್ಗಳ ಅವಲೋಕನವನ್ನು ನೀವು ನೋಡಲು ಬಯಸಿದರೆ:
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, 4 ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ:
1. NGS ರೀಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ k-mer ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಜೀನೋಮ್ ಸಮೀಕ್ಷೆ.ಇದು ನಮಗೆ ಇದರ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ:
- ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದ ಅಂದಾಜು
- ಹೆಟೆರೋಜೈಗೋಸಿಟಿಯ ಅಂದಾಜು
- ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಅಂದಾಜು
2. ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಹೈಫೈ ಜೊತೆಗೆ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ.ದೀರ್ಘ ಓದುಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದರಿಂದ ನಮಗೆ ಸಿಗುತ್ತದೆ:
- ಡಿ ನೊವೊಜೋಡಣೆ
- ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ: ಜೀನೋಮ್ ಸಂಪೂರ್ಣತೆಗಾಗಿ BUSCO ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು NGS ಮತ್ತು PacBio ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಬ್ಯಾಕ್ ಸೇರಿದಂತೆ.
3. ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ.ಒಮ್ಮೆ ನಾವು ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ ನಂತರ, ಜೀನೋಮ್ 3D ರಚನೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದು ಜ್ಞಾನವನ್ನು ಆಳಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಾವು ನಿರ್ಮಿಸುತ್ತಿರುವ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಕೃಷ್ಟಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
- ಮಾನ್ಯವಾದ ಹೈ-ಸಿ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ಹೈ-ಸಿ ಲೈಬ್ರರಿ ಕ್ಯೂಸಿ.
- ಹೈ-ಸಿ ಜೋಡಣೆ. ನಾವು ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ, ನಂತರ ಪ್ರತಿ ಗುಂಪಿನೊಳಗೆ ಕಾಂಟಿಗ್ ಅನ್ನು ಕ್ರಮಗೊಳಿಸುತ್ತೇವೆ ಮತ್ತು ಕಾಂಟಿಗ್ ಓರಿಯಂಟೇಶನ್ ಅನ್ನು ನಿಯೋಜಿಸುತ್ತೇವೆ.
- ಹೈ-ಸಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
4. ಜೀನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ:
- ಸಂಕೇತಿಸದ RNA ಭವಿಷ್ಯ
- ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಟಂಡೆಮ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳು)
- ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
- ಡಿ ನೊವೊ: ಆರಂಭಿಕ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು
- ಹೋಮೋಲಜಿಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ
- ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, ದೀರ್ಘ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಓದುಗಳೊಂದಿಗೆ: ಓದುಗಳುಹೊಸದುಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ
- ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಊಹಿಸಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಮರು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪೈಪ್ಲೈನ್
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
- ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
- ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಜೋಡಣೆಯ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
- ರೂಪಾಂತರ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ: SNP, InDel, SV ಮತ್ತು CNV
- ರೂಪಾಂತರಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು
ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಜೋಡಣೆಯ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು - ಆಳ ವಿತರಣೆಯ ಅನುಕ್ರಮ
ಬಹು ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ SNP ಕರೆ ಮಾಡುವಿಕೆ
ಇನ್ಡೆಲ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ - ಸಿಡಿಎಸ್ ಪ್ರದೇಶ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿನ ಇನ್ಡೆಲ್ ಉದ್ದದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
ಜೀನೋಮ್ನಾದ್ಯಂತ ರೂಪಾಂತರ ವಿತರಣೆ - ಸರ್ಕೋಸ್ ಕಥಾವಸ್ತು
ಗುರುತಿಸಲಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ - ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ
ಚಾಯ್, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಹತ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಆಂಥೋಸಯಾನಿನ್ ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಗ್ಲುಟಾಥಿಯೋನ್ ಎಸ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ GhTT19 ಹೂವಿನ ದಳದ ವರ್ಣದ್ರವ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ',ಸಸ್ಯ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಜರ್ನಲ್, 21(2), ಪು. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
ಚೆಂಗ್, ಹೆಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಕಾಡು ಹೆವಿಯಾ ಬ್ರೆಸಿಲಿಯೆನ್ಸಿಸ್ ಜೀನೋಮ್ ಜೀನೋಮಿಕ್-ನೆರವಿನ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಗೆ ಹೊಸ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರಬ್ಬರ್ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಸ್ಥಳಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ',ಸಸ್ಯ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಜರ್ನಲ್, 21(5), ಪುಟಗಳು 1058–1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
ಲಿ, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2021) 'ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರಸರಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಕುದುರೆ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿ ಒಮ್ಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ',ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್, 12(1). ಡಿಒಐ: 10.1038/S41467-021-21379-X.
ಲಿ, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ದೊಡ್ಡ-ಪ್ರಮಾಣದ ವರ್ಣತಂತು ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಗಾಯಲ್ (ಬಾಸ್ ಫ್ರಂಟಾಲಿಸ್) ನಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳು, ಪರಿಸರ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮತ್ತು ವಿಶೇಷಣಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ',ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ವಿಕಸನ, 40(1). doi: 10.1093/MOLBEV/MSAD006.
ಟಿಯಾನ್, ಟಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಪ್ರಮುಖ ಬರ-ನಿರೋಧಕ ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ಜರ್ಮ್ಪ್ಲಾಸಂನ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಭಜನೆ',ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ 202355:3, 55(3), ಪುಟಗಳು 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
ಜಾಂಗ್, ಎಫ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಸೋಲನೇಸಿ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿನ ಎರಡು ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಟ್ರೋಪೇನ್ ಆಲ್ಕಲಾಯ್ಡ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಕಾಸವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವುದು',ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್2023 14:1, 14(1), ಪುಟಗಳು 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ಝೆಂಗ್, ಟಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಕಾಲಕ್ರಮೇಣ ಚೀನೀ ಸ್ಥಳೀಯ ಕೋಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಮತ್ತು ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಜಾತಿಗಳ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ',ಸಂವಹನ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, 5(1), ಪುಟಗಳು 1–12. ಡಿಒಐ: 10.1038/s42003-022-03907-7.
ಸವಾಲಿನ ಪ್ರಕರಣ ಅಧ್ಯಯನಗಳು:
ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೋಡಣೆ:ಫೂ, ಎ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಕಹಿ ಕಲ್ಲಂಗಡಿಯ ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ (ಮೊಮೊರ್ಡಿಕಾ ಚರಂತಿಯಾ ಎಲ್. ವರ್. ಅಬ್ರೆವಿಯಾಟಾ ಸೆರ್.) ಹಣ್ಣಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಮಾಗಿದ ಆನುವಂಶಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ',ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 10(1). doi: 10.1093/HR/UHAC228.
ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ:ಹು, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2021) 'ಆಲೀಲ್-ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿತ ಜೀನೋಮ್ ಕ್ಯಾಸವ ವಿಕಾಸದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬೈಯಾಲೆಲಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ',ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ, 14(6), ಪುಟಗಳು. 851–854. doi: 10.1016/j.molp.2021.04.009.
ದೈತ್ಯ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ:ಯುವಾನ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಗಿಗಾ-ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆಧಾರ ಮತ್ತು ಮರದ ಪಿಯೋನಿ ಪಿಯೋನಿಯಾ ಒಸ್ಟಿಯ ಗಿಗಾ-ಜೀನೋಮ್',ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್2022 13:1, 13(1), ಪುಟಗಳು 1–16. doi: 10.1038/s41467-022-35063-1.
ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ:ಜಾಂಗ್, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಆಟೋಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಕಬ್ಬಿನ ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಣತಂತು ಕಡಿತದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು ಸ್ಯಾಕರಮ್ ಸ್ಪಾಂಟೇನಿಯಂ',ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ 202254:6, 54(6), ಪುಟಗಳು 885–896. doi: 10.1038/s41588-022-01084-1.
