-
ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ 16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಯೋಜನಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS) ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣೀಕೃತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು. ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
-
ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ (ಉಲ್ಲೇಖೇತರ)
ಪೆಸಿಫಿಕ್ ಬಯೋಸೈನ್ಸ್ (ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ) ಐಸೊಫಾರ್ಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಂಡು, ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ಗಳನ್ನು (ಜೋಡಣೆ ಇಲ್ಲದೆ) ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನ್ಗಳು, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಿಂದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳನ್ನು ಆಪ್ಟಿಮೈಸ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ mRNA ರಚನೆಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು. NGS ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಪರಿಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಡೌನ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
ಟೂಲ್ಕಿಟ್ಗಳು
BMKCloud ಎಂಬುದು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದ್ದು, ವೈದ್ಯಕೀಯ, ಕೃಷಿ, ಪರಿಸರ, ಇತ್ಯಾದಿ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಶೋಧಕರು ಇದನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ನಂಬುತ್ತಾರೆ. ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಕರಗಳು, ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳು, ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ಆನ್ಲೈನ್ ಕೋರ್ಸ್ಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಸಂಯೋಜಿತ, ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಸೇವೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲು BMKCloud ಬದ್ಧವಾಗಿದೆ. BMKCloud ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ, ವಿಕಸನೀಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಪರಿಕರಗಳು, ncRNA, ದತ್ತಾಂಶ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ, ಜೋಡಣೆ, ಜೋಡಣೆ, ದತ್ತಾಂಶ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ, ರೂಪಾಂತರಗಳು, ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು, ಫಿಗರ್ ಜನರೇಟರ್, ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಆಗಾಗ್ಗೆ ಬಳಸುವ ವಿವಿಧ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
-
ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎ
ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು miRNA, siRNA ಮತ್ತು piRNA ಸೇರಿದಂತೆ ಸರಾಸರಿ 18-30 nt ಉದ್ದವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಣ್ಣ ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರಕಾರವಾಗಿದೆ. ಈ ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು mRNA ಅವನತಿ, ಅನುವಾದ ಪ್ರತಿಬಂಧ, ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆ, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ವಿವಿಧ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರಾಣಿ/ಸಸ್ಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ, ರೋಗ, ವೈರಸ್ ಇತ್ಯಾದಿಗಳ ಮೇಲಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ಮಾಲ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯು ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಮುಂದುವರಿದ ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. RNA-seq ಡೇಟಾದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು miRNA ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಮುನ್ಸೂಚನೆ, miRNA ಗುರಿ ಜೀನ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ, ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು. ಸುಧಾರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ miRNA ಹುಡುಕಾಟ ಮತ್ತು ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ, ವೆನ್ ರೇಖಾಚಿತ್ರ ಉತ್ಪಾದನೆ, miRNA ಮತ್ತು ಗುರಿ ಜೀನ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
NGS-WGS (ಇಲ್ಯುಮಿನಾ/BGI)
NGS-WGS ಒಂದು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳಲ್ಲಿನ ಶ್ರೀಮಂತ ಅನುಭವದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬಳಸಲು ಸುಲಭವಾದ ಈ ವೇದಿಕೆಯು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಮತ್ತು BGI ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ DNA ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾಗೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ಕೆಲವು ಮೂಲಭೂತ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹವನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಸಲ್ಲಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಈ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಸರ್ವರ್ನಲ್ಲಿ ನಿಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಬಹಳ ಸೀಮಿತ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ರೂಪಾಂತರಿತ ಜೀನ್ ಪ್ರಶ್ನೆ, PCR ಪ್ರೈಮರ್ ವಿನ್ಯಾಸ, ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
-
mRNA(ಉಲ್ಲೇಖ)
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾಹಿತಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಕ್ರಿಯೆಯ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ ನಡುವಿನ ಕೊಂಡಿಯಾಗಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನಲ್ ಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣವು ಜೀವಿಗಳ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಮುಖ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾದ ನಿಯಂತ್ರಣ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಯಾವುದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ, ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ಗೆ ನಿಖರವಾದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ನೊಂದಿಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಇದು ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ, ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಅಪರೂಪದ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮಾದರಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ರಸ್ತುತ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಕೃಷಿಶಾಸ್ತ್ರ, ಔಷಧ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ನಿಯಂತ್ರಣ, ಪರಿಸರ ರೂಪಾಂತರ, ರೋಗನಿರೋಧಕ ಸಂವಹನ, ಜೀನ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣ, ಜಾತಿಗಳ ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಗೆಡ್ಡೆ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕ ರೋಗ ಪತ್ತೆ ಸೇರಿದಂತೆ ಇತರ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ.
-
ಮೆಟಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ (NGS)
ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಶಾಟ್ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ದತ್ತಾಂಶ ಸಂಸ್ಕರಣೆ, ಜಾತಿ-ಮಟ್ಟದ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಜೀನ್ ಕಾರ್ಯ-ಮಟ್ಟದ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಮೆಟಾಜೆನೊಮ್ ಬಿನ್ನಿಂಗ್ ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ವಿವಿಧ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಂಯೋಜಿತ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಜೀನ್ ಮತ್ತು ಜಾತಿಗಳ ಪ್ರಶ್ನೆ, ನಿಯತಾಂಕ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್, ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ಅಂಕಿ ಉತ್ಪಾದನೆ ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹದ ಮೇಲೆ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯ ಪರಿಕರಗಳು ಲಭ್ಯವಿದೆ.
-
ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎ
ಲಾಂಗ್ ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು (ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳು) 200 ಎನ್ಟಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉದ್ದವಿರುವ ಒಂದು ರೀತಿಯ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳಾಗಿದ್ದು, ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಎಂದು ಸಂಚಿತ ಪುರಾವೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಹೈ-ಥ್ರೂಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಪರಿಕರಗಳು ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಾನಿಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ನಮಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ಣಾಯಕ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ನಮಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ವೇಗವಾದ, ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ನಮ್ಮ ಗ್ರಾಹಕರಿಗೆ ಎಲ್ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಬಿಎಂಕೆಕ್ಲೌಡ್ ಹೆಮ್ಮೆಪಡುತ್ತದೆ.
-
ಗ್ವಾಸ್
ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಸ್ಟಡಿ (GWAS) ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ (ಫಿನೋಟೈಪ್) ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು (ಜಿನೋಟೈಪ್) ಗುರುತಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. GWA ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ದಾಟುವ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮೂಲಕ ಜೀನೋಟೈಪ್-ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತವೆ. ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಎಲ್ಲಾ ಜೆನೆಟಿಕ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಬಹುದು. ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ, GWAS ಅನ್ನು ಫಿನೋಟೈಪ್ ಸಂಬಂಧಿತ SNP ಗಳು, QTL ಗಳು ಮತ್ತು ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಂಸ್ಕರಿಸಬಹುದು, ಇದು ಆಧುನಿಕ ಪ್ರಾಣಿ/ಸಸ್ಯ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಯನ್ನು ಬಲವಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. SLAF ಸ್ವಯಂ-ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಸರಳೀಕೃತ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಜಿನೋಮ್-ವೈಡ್ ಡಿಸ್ಟ್ರಿಬ್ಯೂಟೆಡ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳು, SNP ಅನ್ನು ಕಂಡುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ SNP ಗಳನ್ನು, ಆಣ್ವಿಕ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳಾಗಿ, ಉದ್ದೇಶಿತ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಸಂಸ್ಕರಿಸಬಹುದು. ಇದು ಸಂಕೀರ್ಣ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೆನೆಟಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವಲ್ಲಿ ವೆಚ್ಚ-ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ.
-
ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು
ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಮತ್ತು ವೇರಿಯಬಲ್ ಪರ್ಯಾಯ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ಆನುವಂಶಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳಾಗಿವೆ. ಪ್ರತಿಲಿಪಿ ರಚನೆಗಳ ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮಾದರಿಗಳ ಆಳವಾದ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಆಧಾರವಾಗಿದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಯು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಐಸೋಫಾರ್ಮ್-ಮಟ್ಟಕ್ಕೆ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ತಂದಿದೆ. ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ವೇದಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೀಕ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಜೀನ್ ಮಟ್ಟ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲಿಪಿ ಮಟ್ಟ ಎರಡರಲ್ಲೂ ಗುಣಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಸರ್ಕ್-ಆರ್ಎನ್ಎ
ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎ (circRNA) ಒಂದು ರೀತಿಯ ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ, ಪರಿಸರ ಪ್ರತಿರೋಧ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ನಿಯಂತ್ರಕ ಜಾಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ರೇಖೀಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿ, ಉದಾ. mRNA, lncRNA, circRNA ಯ 3′ ಮತ್ತು 5′ ತುದಿಗಳು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಸೇರಿ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಎಕ್ಸೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ನ ಜೀರ್ಣಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ರೇಖೀಯ ಆರ್ಎನ್ಎಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ CircRNA ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. CircRNA ceRNA ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು, ಇದು miRNA ಅನ್ನು ಸ್ಪರ್ಧಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು miRNA ಸ್ಪಾಂಜ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. CircRNA ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯು circRNA ರಚನೆ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಗುರಿ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ಇತರ ರೀತಿಯ RNA ಅಣುಗಳೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಬಲಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಬಿಎಸ್ಎ
ಬಲ್ಕ್ಡ್ ಸೆಗ್ರೆಗಂಟ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಒಂದು-ಹಂತದ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ಪ್ಯಾರಾಮೀಟರ್ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ನೊಂದಿಗೆ ಮುಂದುವರಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. BSA ಎಂಬುದು ಫಿನೋಟೈಪ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸುವ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ. BSA ಯ ಮುಖ್ಯ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹವು ಇವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: 1. ಅತ್ಯಂತ ವಿರುದ್ಧ ಫಿನೋಟೈಪ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುವುದು; 2. ಎಲ್ಲಾ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ DNA, RNA ಅಥವಾ SLAF-seq (ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ನಿಂದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ) ಅನ್ನು ಎರಡು ಬೃಹತ್ DNA ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವುದು; 3. ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಅಥವಾ ನಡುವೆ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು, 4. ED ಮತ್ತು SNP-ಸೂಚ್ಯಂಕ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಮೂಲಕ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಲಿಂಕ್ಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುವುದು; 5. ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿನ ಜೀನ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪುಷ್ಟೀಕರಣ, ಇತ್ಯಾದಿ. ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೈಮರ್ ವಿನ್ಯಾಸ ಸೇರಿದಂತೆ ಡೇಟಾದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಮುಂದುವರಿದ ಗಣಿಗಾರಿಕೆ ಸಹ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
-
ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS)
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಯೋಜನಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS) ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣೀಕೃತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು. ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
