-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ -NGS
ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಒಟ್ಟು ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಬೆಳೆಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಬೆಳೆಸಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. NGS ನೊಂದಿಗೆ ಶಾಟ್ಗನ್ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ವರ್ಗೀಕರಣದ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಜಾತಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆ, ಸಮೃದ್ಧಿ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ವರ್ಗೀಕರಣದ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಮೀರಿ, ಶಾಟ್ಗನ್ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಪರಿಶೋಧನೆ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಜಾಲಗಳ ಸ್ಥಾಪನೆಯು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪರಿಸರ ಹಿನ್ನೆಲೆಯ ನಡುವಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಸಮಗ್ರ ತಿಳುವಳಿಕೆಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ, ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಜಟಿಲತೆಗಳನ್ನು ಬಿಚ್ಚಿಡಲು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ನಿಂತಿದೆ, ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದ ನಡುವಿನ ಬಹುಮುಖಿ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಬೆಳಗಿಸುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆಗಳು: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಮತ್ತು DNBSEQ-T7
-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಟಿಜಿಎಸ್
ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಬೆಳೆಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಬೆಳೆಸಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಶಾಟ್ಗನ್ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮದ ಆಗಮನವು ಕ್ಷೇತ್ರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಿದೆ. ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಕೆಳಮುಖ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ, ಹೆಚ್ಚು ನಿರಂತರ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೋಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಕೀರ್ಣ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಉತ್ಪಾದಿಸಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ (ಮಾಸ್, ಇಎಲ್, ಮತ್ತು ಇತರರು, ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್, 2020). ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ರೀಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುವುದರಿಂದ ದೋಷ ತಿದ್ದುಪಡಿಗೆ ಒಂದು ಕಾರ್ಯತಂತ್ರದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ನ ಅಂತರ್ಗತ ಕಡಿಮೆ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ತಗ್ಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಿನರ್ಜಿಸ್ಟಿಕ್ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಪ್ರತಿ ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಭಾವ್ಯ ಮಿತಿಗಳನ್ನು ನಿವಾರಿಸಲು ಮತ್ತು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ದೃಢವಾದ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ 48, ಇಲ್ಯುಮಿಯಾ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ
16S ಮತ್ತು 18S rRNA ಜೀನ್ಗಳು, ಇಂಟರ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರೈಬ್ಡ್ ಸ್ಪೇಸರ್ (ITS) ಪ್ರದೇಶದೊಂದಿಗೆ, ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮತ್ತು ಹೈಪರ್-ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯಿಂದಾಗಿ ಪ್ರಮುಖ ಆಣ್ವಿಕ ಫಿಂಗರ್ಪ್ರಿಂಟಿಂಗ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಸಾಧನಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವರ್ಧನೆ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮವು ವಿವಿಧ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ವಿಧಾನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಅನುಕ್ರಮವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 16S ಮತ್ತು ITS1 ನ V3-V4 ನಂತಹ ಸಣ್ಣ ಹೈಪರ್ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಿಕೊಂಡರೆ, 16S, 18S ಮತ್ತು ITS ನ ಪೂರ್ಣ ಉದ್ದವನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಉನ್ನತ ವರ್ಗೀಕರಣ ಟಿಪ್ಪಣಿಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಸಮಗ್ರ ವಿಧಾನವು ನಿಖರವಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶೇಕಡಾವಾರುಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಜಾತಿಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗೆ ವಿಸ್ತರಿಸುವ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋದ ಏಕ-ಆಣ್ವಿಕ ರಿಯಲ್-ಟೈಮ್ (SMRT) ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆಯು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಅನುಕ್ರಮದ ನಿಖರತೆಗೆ ಪ್ರತಿಸ್ಪರ್ಧಿಯಾಗಿ, ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುವ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆಗಳನ್ನು (ಹೈಫೈ) ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಎದ್ದು ಕಾಣುತ್ತದೆ. ಈ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅನುಪಮ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ - ಆನುವಂಶಿಕ ಭೂದೃಶ್ಯದ ವಿಹಂಗಮ ನೋಟ. ವಿಸ್ತೃತ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯು ಜಾತಿಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿಯಲ್ಲಿ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಥವಾ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸಮುದಾಯಗಳಲ್ಲಿ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಅನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಜಟಿಲತೆಗಳ ಆಳವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದೊಂದಿಗೆ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮವು, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ 16S, 18S ಮತ್ತು ITS ಆನುವಂಶಿಕ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಿಕೊಂಡು, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳಲ್ಲಿನ ಫೈಲೋಜೆನಿ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ ಮತ್ತು ಜಾತಿಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಬಿಚ್ಚಿಡಲು ಒಂದು ಪ್ರಬಲ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು ಹೌಸ್ಕೀಪಿಂಗ್ ಆನುವಂಶಿಕ ಗುರುತುಗಳ ಹೈಪರ್ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಮೂಲತಃ ಆಣ್ವಿಕ ಬೆರಳಚ್ಚು ಎಂದು ಪರಿಚಯಿಸಲಾಯಿತುವೋಸೆಸ್ ಮತ್ತು ಇತರರು1977 ರಲ್ಲಿ, ಈ ತಂತ್ರವು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಕ್ರಾಂತಿಯನ್ನುಂಟು ಮಾಡಿದೆ. 16S (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ), 18S (ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಮತ್ತು ಆಂತರಿಕ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೆಡ್ ಸ್ಪೇಸರ್ (ITS, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಅನುಕ್ರಮದ ಮೂಲಕ, ಸಂಶೋಧಕರು ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ ಅಪರೂಪದ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸಲಾಗದ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಸಹ ಗುರುತಿಸಬಹುದು. ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಮಾನವ ಬಾಯಿ, ಕರುಳುಗಳು, ಮಲ ಮತ್ತು ಅದರಾಚೆಗಿನ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪರಿಸರಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ವಿವೇಚಿಸುವಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸಿದೆ.
-
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮೀಕರಣ
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಮುನ್ನಡೆಸಲು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮ ಯೋಜನೆಗಳು ಪ್ರಮುಖವಾಗಿವೆ. ಇದು ಹುದುಗುವಿಕೆ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್, ಕೈಗಾರಿಕಾ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ದ್ವಿತೀಯಕ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಅನ್ವೇಷಣೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮವು ಪರಿಸರ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ತಳಿಗಳನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಲು ಮತ್ತು ಔಷಧ, ಕೃಷಿ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ವಿಶಾಲ ಪರಿಣಾಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಕಾಸದ ಚಲನಶೀಲತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆ.
-
ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳೊಳಗಿನ ಎಲ್ಲಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಸಮಗ್ರ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಬಲಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಅತ್ಯಾಧುನಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಪ್ರಬಲ ಸಾಧನವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳು, ಜೀನ್ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂಲಭೂತ ಸಂಶೋಧನೆ, ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಡಯಾಗ್ನೋಸ್ಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಔಷಧ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಜಟಿಲತೆಗಳ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ನಮ್ಮ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆಯನ್ನು ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಸವಕಳಿ ಮತ್ತು ದಿಕ್ಕಿನ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.
-
ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, BMKGENE ನ ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯು ಮಣ್ಣು, ನೀರು, ಸಮುದ್ರ, ಮಲ ಮತ್ತು ಕರುಳಿನಂತಹ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಪರಿಸರಗಳಲ್ಲಿ ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್ಗಳಿಂದ ಪ್ರೊಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ವೈರಸ್ಗಳಿಗೆ ವ್ಯಾಪಿಸಿರುವ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ನಮ್ಮ ಸಮಗ್ರ ಸೇವೆಯು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ. ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಹೊರತಾಗಿ, ನಮ್ಮ ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪುಷ್ಟೀಕರಣದ ಪರಿಶೋಧನೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪಾತ್ರಗಳ ಮೇಲೆ ಬೆಳಕು ಚೆಲ್ಲುತ್ತದೆ. ಈ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪರಿಸರ ಗೂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ, ವರ್ಗೀಕರಣ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳನ್ನು ನೀವು ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡುವಾಗ ಜೈವಿಕ ಒಳನೋಟಗಳ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿ.
-
ಡಿ ನೋವೋ ಫಂಗಲ್ ಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
BMKGENE ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಬಹುಮುಖ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸಂಶೋಧನಾ ಅಗತ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಅಪೇಕ್ಷಿತ ಜೀನೋಮ್ ಸಂಪೂರ್ಣತೆಯನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತದೆ. ಶಾರ್ಟ್-ರೀಡ್ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ಬಳಸುವುದರಿಂದ ಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಅಥವಾ ಪ್ಯಾಕ್ಬಿಯೊ ಬಳಸಿ ಶಾರ್ಟ್-ರೀಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಲಾಂಗ್-ರೀಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಉದ್ದವಾದ ಕಾಂಟಿಗ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀನೋಮ್ಗಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
-
ಡಿ ನೋವೋ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
ನಾವು ಸಂಪೂರ್ಣ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಸೇವೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ, 0 ಅಂತರವನ್ನು ಖಾತರಿಪಡಿಸುತ್ತೇವೆ. ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಾಗಿ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋದಂತಹ ದೀರ್ಘ-ಓದಿದ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ONT ರೀಡ್ಗಳ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮೌಲ್ಯೀಕರಣ ಮತ್ತು ದೋಷ ತಿದ್ದುಪಡಿಗಾಗಿ ಇಲ್ಯುಮಿನಾದೊಂದಿಗೆ ಶಾರ್ಟ್-ರೀಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಇದು ಸಾಧ್ಯ. ನಮ್ಮ ಸೇವೆಯು ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಸುಧಾರಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಶೋಧನಾ ಗುರಿಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸೇವೆಯು ವಿವಿಧ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ನಿಖರವಾದ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಇದು ಸ್ಟ್ರೈನ್ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್, ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯಂತಹ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಒಳನೋಟಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ನಾವೀನ್ಯತೆಯನ್ನು ಮುಂದುವರಿಸಲು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾದ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಮತ್ತು ಅಂತರ-ಮುಕ್ತ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
