ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್, PE150
ಲೈಬ್ರರಿ ಪ್ರಕಾರ: 350bp ಇನ್ಸರ್ಟ್ cDNA ಲೈಬ್ರರಿ (ಗರಿಷ್ಠ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ)
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ: ಜೋಡಿ-ಅಂತ್ಯ 150 ಬಿಪಿ
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಿದ ಡೇಟಾ ಪ್ರಮಾಣ: 2 Gb ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ/ಮಾದರಿ
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
(1) ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ: ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿತರಣೆ, ಮೂಲ ಗುಣಮಟ್ಟದ ವಿತರಣೆ, rRNA ಅನುಪಾತ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ;
(2) ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಜೋಡಣೆ ಫಲಿತಾಂಶದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು, ಅನುಕ್ರಮದ ಶುದ್ಧತ್ವ, ಅನುಕ್ರಮದ ವ್ಯಾಪ್ತಿ;
(3) ಉಲ್ಲೇಖ ಜಿನೋಮ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ (NR, ಸ್ವಿಸ್-ಪ್ರೊಟ್, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿತರಣೆ (ಎರಡು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾದರಿಗಳೊಂದಿಗೆ), ಮಾದರಿಗಳ ನಡುವಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ವೆನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪಿಸಿಎ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ);
(5) ಭೇದಾತ್ಮಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಎರಡು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾದರಿಗಳೊಂದಿಗೆ);
(6) ಜೀನ್ ಸೆಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ವೆನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಫಂಕ್ಷನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (COG, GO, KEGG), ಫಂಕ್ಷನ್ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (GO, KEGG), ಫಂಕ್ಷನ್ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ಸ್ವರಮೇಳದ ಗ್ರಾಫ್, ಐಪಾತ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ;
(7) sRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: sRNA ಭವಿಷ್ಯ, sRNA ಟಿಪ್ಪಣಿ (ಬ್ಲಾಸ್ಟ್, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಷನ್, sRNA ಗುರಿ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ;
(8) ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರಚನೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಒಪೆರಾನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭ ಮತ್ತು ಅಂತಿಮ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಭವಿಷ್ಯ, UTR ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪ್ರವರ್ತಕ ಅನುಕ್ರಮ ಭವಿಷ್ಯ, SNP/InDel ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (SNP/InDel ಟಿಪ್ಪಣಿ, SNP/InDel ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ವಿತರಣೆ, SNP ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು).
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
