ನಿರ್ದಿಷ್ಟ-ಲೋಕಸ್ ಆಂಪ್ಲಿಫೈಡ್ ಫ್ರಾಗ್ಮೆಂಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (SLAF-Seq)
ಸೇವೆಯ ವಿವರಗಳು
ತಾಂತ್ರಿಕ ಯೋಜನೆ
ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾರ್ಕರ್ ಅನ್ವೇಷಣೆ ದಕ್ಷತೆ- ಹೈ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು SLAF-Seq ಗೆ ಇಡೀ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ನೂರಾರು ಸಾವಿರ ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವಲ್ಲಿ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ಜೀನೋಮ್ ಮೇಲೆ ಕಡಿಮೆ ಅವಲಂಬನೆ- ಇದನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖ ಜಿನೋಮ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲದೆಯೇ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಬಹುದು.
ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಯೋಜನೆ ವಿನ್ಯಾಸ- ಏಕ-ಕಿಣ್ವ, ಡ್ಯುಯಲ್-ಕಿಣ್ವ, ಬಹು-ಕಿಣ್ವ ಜೀರ್ಣಕ್ರಿಯೆ ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಕಿಣ್ವಗಳು, ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಗುರಿ ಅಥವಾ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸಲು ಎಲ್ಲವನ್ನೂ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು.ಸಿಲಿಕೋದಲ್ಲಿ ಪೂರ್ವ-ಮೌಲ್ಯಮಾಪನವನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಕಿಣ್ವ ವಿನ್ಯಾಸವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಎಂಜೈಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಜೀರ್ಣಕ್ರಿಯೆ- ಔಪಚಾರಿಕ ಪ್ರಯೋಗವನ್ನು ಸ್ಥಿರ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹವಾಗಿಸುವ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಲು ಪೂರ್ವ-ಪ್ರಯೋಗವನ್ನು ಕೈಗೊಳ್ಳಲಾಯಿತು.ತುಣುಕು ಸಂಗ್ರಹ ದಕ್ಷತೆಯು 95% ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸಾಧಿಸಬಹುದು.
SLAF ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳನ್ನು ಸಮವಾಗಿ ವಿತರಿಸಲಾಗಿದೆ- SLAF ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳನ್ನು ಎಲ್ಲಾ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸಮವಾಗಿ ವಿತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿ 4 kb ಗೆ ಸರಾಸರಿ 1 SLAF ಅನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ.
ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ತಪ್ಪಿಸುವಿಕೆ- SLAF-Seq ಡೇಟಾದಲ್ಲಿ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅನುಕ್ರಮವು 5% ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಗೋಧಿ, ಜೋಳ, ಇತ್ಯಾದಿ.
ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವಸಸ್ಯಗಳು, ಸಸ್ತನಿಗಳು, ಪಕ್ಷಿಗಳು, ಕೀಟಗಳು, ಆಕ್ವಾ-ಜೀವಿಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ನೂರಾರು ಜಾತಿಗಳ ಮೇಲೆ 2000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮುಚ್ಚಿದ SLAF-Seq ಯೋಜನೆಗಳು.
ಸ್ವಯಂ-ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು- ಅಂತಿಮ ಔಟ್‌ಪುಟ್‌ನ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆ ಮತ್ತು ನಿಖರತೆಯನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು BMKGENE ನಿಂದ SLAF-Seq ಗಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋ ಅನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ವೇದಿಕೆ | Conc.(ng/gl) | ಒಟ್ಟು (ug) | OD260/280 |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ | >35 | >1.6(ಸಂಪುಟ>15μl) | 1.6-2.5 |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ
ಅನುಕ್ರಮ ಆಳ: 10X/ಟ್ಯಾಗ್
| ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರ | SLAF ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ |
| < 500 Mb | 100K ಅಥವಾ WGS |
| 500 Mb- 1 Gb | 100 ಕೆ |
| 1 ಜಿಬಿ -2 ಜಿಬಿ | 200 ಕೆ |
| ದೈತ್ಯ ಅಥವಾ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು | 300 - 400 ಕೆ |
| ಅರ್ಜಿಗಳನ್ನು
| ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಪ್ರಮಾಣ
| ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ ಮತ್ತು ಆಳ
| |
| ಆಳ
| ಟ್ಯಾಗ್ ಸಂಖ್ಯೆ
| ||
| GWAS
| ಮಾದರಿ ಸಂಖ್ಯೆ ≥ 200
| 10X
|
ಈ ಪ್ರಕಾರ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರ
|
| ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್
| ಪ್ರತಿಯೊಂದರ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಉಪಗುಂಪು ≥ 10; ಒಟ್ಟು ಮಾದರಿಗಳು ≥30
| 10X
| |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೇನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್
ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾದರಿಗಳಿಗೆ, ಎಥೆನಾಲ್ನಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸದಂತೆ ನಾವು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಬೇಕು ಮತ್ತು ಸಲ್ಲಿಸಿದ ಮಾದರಿ ಮಾಹಿತಿ ಫಾರ್ಮ್‌ಗೆ ಒಂದೇ ಆಗಿರಬೇಕು.
ಸಾಗಣೆ: ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
ಸೇವೆಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ QC
ಪೈಲಟ್ ಪ್ರಯೋಗ
SLAF-ಪ್ರಯೋಗ
ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ತಯಾರಿ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
1. ನಕ್ಷೆಯ ಫಲಿತಾಂಶದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
2. SLAF ಮಾರ್ಕರ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ
3. ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಟಿಪ್ಪಣಿ
| ವರ್ಷ | ಜರ್ನಲ್ | IF | ಶೀರ್ಷಿಕೆ | ಅರ್ಜಿಗಳನ್ನು |
| 2022 | ಪ್ರಕೃತಿ ಸಂವಹನ | 17.694 | ಗಿಗಾ-ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆಧಾರ ಮತ್ತು ಮರದ ಪಿಯೋನಿಯ ಗಿಗಾ-ಜೀನೋಮ್ ಪಯೋನಿಯಾ ಒಸ್ಟಿ | SLAF-GWAS |
| 2015 | ಹೊಸ ಸಸ್ಯಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞ | 7.433 | ದೇಶೀಯ ಹೆಜ್ಜೆಗುರುತುಗಳು ಕೃಷಿ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಆಂಕರ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಸೋಯಾಬೀನ್ | SLAF-GWAS |
| 2022 | ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಅಡ್ವಾನ್ಸ್ಡ್ ರಿಸರ್ಚ್ | 12.822 | ಜಿ. ಹಿರ್ಸುಟಮ್‌ಗೆ ಗಾಸಿಪಿಯಮ್ ಬಾರ್ಬಡೆನ್ಸ್‌ನ ಜಿನೋಮ್-ವೈಡ್ ಕೃತಕ ಒಳನುಗ್ಗುವಿಕೆ ಹತ್ತಿ ನಾರಿನ ಗುಣಮಟ್ಟ ಮತ್ತು ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಸುಧಾರಿಸಲು ಉನ್ನತ ಸ್ಥಾನವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು | SLAF-ಎವಲ್ಯೂಷನರಿ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ |
| 2019 | ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ | 10.81 | ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯು ವೀಡಿಯ ಮೂಲವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ ವಿಕಸನೀಯ ಆಟವಾಗಿ ಅಕ್ಕಿ | SLAF-ಎವಲ್ಯೂಷನರಿ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ |
| 2019 | ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ | 31.616 | ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಕಾರ್ಪ್, ಸಿಪ್ರಿನಸ್ ಕಾರ್ಪಿಯೊದ ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆ | SLAF-ಲಿಕೇಜ್ ನಕ್ಷೆ |
| 2014 | ನೇಚರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ | 25.455 | ಬೆಳೆಸಿದ ಕಡಲೆಕಾಯಿಯ ಜೀನೋಮ್ ದ್ವಿದಳ ಧಾನ್ಯಗಳ ಕ್ಯಾರಿಯೋಟೈಪ್‌ಗಳು, ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್‌ಗಳ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ವಿಕಾಸ ಮತ್ತು ಬೆಳೆ ಪಳಗಿಸುವಿಕೆ. | SLAF-ಲಿಕೇಜ್ ನಕ್ಷೆ |
| 2022 | ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್ | 9.803 | ST1 ನ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಬೀಜ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದ ಹಿಚ್ಹೈಕಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸೋಯಾಬೀನ್ ಸಾಕಣೆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ತೈಲ ಅಂಶ | SLAF-ಮಾರ್ಕರ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ |
| 2022 | ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್ | 6.208 | ಗೋಧಿ-ಲೇಮಸ್ ಮೊಲ್ಲಿಸ್ 2Ns (2D) ಗಾಗಿ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು DNA ಮಾರ್ಕರ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಡಿಸೊಮಿಕ್ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಪರ್ಯಾಯ | SLAF-ಮಾರ್ಕರ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ |
