ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮ (WGBS)
ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟೋಸಿನ್ಗಳನ್ನು ಯುರಾಸಿಲ್ (C ನಿಂದ U) ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು DNA ಯ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಈ ತಂತ್ರವು, ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟೋಸಿನ್ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಗದೆ ಬಿಡುತ್ತಾ, DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಆಳವಾದ ಪರಿಶೋಧನೆಗೆ ಚಿನ್ನದ-ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಸೈಟೋಸಿನ್ (5-mC) ನಲ್ಲಿ ಐದನೇ ಸ್ಥಾನ, ಇದು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಪ್ರಮುಖ ನಿಯಂತ್ರಕವಾಗಿದೆ.
ಈ ತಂತ್ರವು ಏಕ-ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಮೀಥೈಲೋಮ್ ಅನ್ನು ಸಮಗ್ರವಾಗಿ ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಅಸಹಜ ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. WGBS ಅನ್ನು ಬಳಸುವುದರ ಮೂಲಕ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸಾಟಿಯಿಲ್ಲದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು, ಇದು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ.
● ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
● ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಪರಿವರ್ತನೆ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಲು ಲ್ಯಾಂಬ್ಡಾ ಡಿಎನ್ಎ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಡಿಎನ್ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಚಿನ್ನದ ಮಾನದಂಡ: ಈ ಪ್ರಬುದ್ಧ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ಉತ್ತಮ ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ವ್ಯಾಪ್ತಿ ಮತ್ತು ಏಕ-ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್:ಮೆತಿಲೀಕರಣ ತಾಣಗಳ ಪತ್ತೆ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿದೆ.
● ● ದಶಾಸಂಪೂರ್ಣ ವೇದಿಕೆ:ನಾವು ಮಾದರಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆ, ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ, ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯವರೆಗೆ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಸೇವೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಯೋಜನೆಗಳ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ನಾವು ಹೊಂದಿದ್ದೇವೆ. BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಸೇರುವ ಸಾಧ್ಯತೆ: RNA-seq ನಂತಹ ಇತರ ಓಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ WGBS ನ ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಮಾದರಿ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ ಔಟ್ಪುಟ್ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸಂಸ್ಕರಿಸಲಾಗಿದೆ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 | 30x ಆಳ | ಕ್ಯೂ30 ≥ 85% ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಪರಿವರ್ತನೆ > 99% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಪ್ರಮಾಣ (µg) | ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು | |
| ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ | ≥ 5 | ≥ 400 ಎನ್ಜಿ | ಸೀಮಿತ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ |
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಡಿಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಡೇಟಾ ವಿತರಣೆ
ಸೇವೆಯು ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಕಚ್ಚಾ ಅನುಕ್ರಮ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ;
● ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್;
● 5mC ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಬೇಸ್ಗಳ ಪತ್ತೆ;
● ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ;
● ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (DMR ಗಳು);
● DMR ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ.
5mC ಮಿಥೈಲೇಷನ್ ಪತ್ತೆ: ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ತಾಣಗಳ ವಿಧಗಳು
ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ನಕ್ಷೆ. 5mC ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ವಿತರಣೆ
ಹೆಚ್ಚು ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು: ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್ಗಳು
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು: ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ (ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ)
BMKGene ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಫ್ಯಾನ್, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2020) 'ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕುರಿ ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯು ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ',BMC ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 21(1), ಪುಟಗಳು. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
ಝಾವೋ, ಎಕ್ಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ವಿನೈಲ್ ಕ್ಲೋರೈಡ್ಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಂಡ ಕಾರ್ಮಿಕರಲ್ಲಿ ಕಾದಂಬರಿ ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಅಡಚಣೆಗಳು',ವಿಷಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ಕೈಗಾರಿಕಾ ಆರೋಗ್ಯ, 38(7), ಪುಟಗಳು. 377–388. ದೂ: 10.1177/07482337221098600
ಜುವೊ, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2020) 'ಟೊಮ್ಯಾಟೊ ಹಣ್ಣುಗಳನ್ನು ಮಾಗಿಸುವುದರಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣ, ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡದ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಮಟ್ಟಗಳು, ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಮತ್ತು ಮೆಟಾಬಾಲೈಟ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧಗಳು',ಸಸ್ಯ ಜರ್ನಲ್, 103(3), ಪುಟಗಳು. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
