16S/18S/ITS 앰플리콘 시퀀싱-PacBio
서비스 특징
● 시퀀싱 플랫폼 : PacBio Revio
● 시퀀싱 모드: CCS(HiFi 읽기)
● HiFi SMRT 벨 라이브러리 준비 전 앰플리콘의 탠덤 연결에 따른 타겟 영역 증폭
서비스 장점
●더 높은 분류학적 해상도: T한 짧은 앰플리콘 시퀀싱,종 수준에서 더 높은 OTU 분류율을 가능하게 합니다.
●매우 정확한 베이스 콜링: PacBio CCS 모드 시퀀싱(HiFi 판독).
●격리 없음: 환경 샘플에서 미생물 구성을 빠르게 식별합니다.
●광범위하게 적용 가능: 다양한 미생물 군집 연구.
●포괄적인 생물정보학 분석: 데이터베이스, 주석, OTU/ASV 측면에서 다양한 분석을 제공하는 최신 QIIME2 패키지(미생물 생태학에 대한 정량적 통찰력)입니다.
●광범위한 전문성: BMKGENE은 매년 수천 건의 앰플리콘 시퀀싱 프로젝트를 수행하며 10년 이상의 경험, 고도로 숙련된 분석 팀, 포괄적인 콘텐츠, 탁월한 애프터 서비스를 제공합니다.
서비스 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 추천 데이터 |
| 앰플리콘 | 팩바이오 레비오 | 10/30/50K 태그(CCS) |
샘플 요구 사항
| 농도(ng/µL) | 총량(µg) | 용량(µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
권장 샘플 배송
샘플을 액체 질소에 3~4시간 동안 동결시킨 후 액체 질소 또는 -80도에서 장기 보관하십시오. 샘플 배송 시 드라이아이스가 필요합니다.
서비스 워크플로
샘플 배송
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 서비스
다음 분석이 포함됩니다.
●원시데이터 품질관리
●OTU 클러스터링/노이즈 제거(ASV)
●OTU 주석
●알파 다양성 분석: 섀넌, 심슨, ACE를 포함한 다양한 지수.
●베타 다양성 분석
●집단 간 분석
●상관관계 분석: 환경요인과 OUT 구성 및 다양성 간
●16S 기능 유전자 예측
분류 분포의 히스토그램
군집 분포 계통수
알파 다양성 분석: ACE
색인
베타 다양성 분석: PCoA
집단 간 분석: ANOVA
PacBio와 함께 큐레이팅된 출판물 컬렉션을 통해 BMKGene의 앰플리콘 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 발전을 살펴보세요.
Gao, X. 및 Wang, H. (2023) '고산 초원에서 두 가지 성장 단계를 거치는 고산 메리노 양의 다른 페놀로지(재녹화 vs. 초지)에 적응하는 동안의 반추위 박테리아 프로필 및 기능의 비교 분석', 발효, 9(1), p. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) '컬투로믹스 기반 메타게놈학과 고해상도 분석을 사용하여 사막 토양의 미생물 암흑 물질 포착', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) '지방산염이 알팔파, 벼짚 및 밀기울로 제조한 혼합 사일리지의 발효 특성, 박테리아 다양성 및 호기성 안정성에 미치는 영향', Journal of the Science of Food and Agriculture, 102(4), pp. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) '성인 얼룩말바리의 옥사졸론 유도 장내 산화 스트레스에서 Sonchus brachyotus DC 추출물의 항산화 효과에 대한 산화 스트레스 바이오마커와 장내 미생물군 간의 상호 작용', Antioxidants 2023, Vol. 12, Page 192, 12(1), p. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
