16S/18S/ITS 앰플리콘 시퀀싱 - PacBio
서비스 특징
● 시퀀싱 플랫폼: PacBio Revio
● 시퀀싱 모드: CCS (고해상도 판독)
● HiFi SMRT 벨 라이브러리 준비 전, 목표 영역 증폭 후 증폭된 산물의 직렬 연결
서비스 장점
●더 높은 분류학적 해상도: T한 쇼트앰플리콘 시퀀싱,이를 통해 종 수준에서 더 높은 OTU 분류율을 달성할 수 있습니다.
●매우 정확한 베이스 콜링PacBio CCS 모드 시퀀싱(HiFi 판독).
●격리 없음환경 시료의 미생물 구성 성분을 신속하게 식별합니다.
●널리 적용 가능다양한 미생물 군집 연구.
●종합적인 생물정보학 분석최신 QIIME2 패키지(미생물 생태에 대한 정량적 분석)는 데이터베이스, 주석, OTU/ASV 측면에서 다양한 분석 기능을 제공합니다.
●폭넓은 전문 지식BMKGENE은 매년 수천 건의 앰플리콘 시퀀싱 프로젝트를 수행하며 10년 이상의 경험, 고도로 숙련된 분석팀, 포괄적인 콘텐츠 및 탁월한 사후 지원을 제공합니다.
서비스 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 |
| 앰플리콘 | PacBio Revio | 10/30/50 K 태그(CCS) |
샘플 요구 사항
| 농도(ng/µL) | 총량(µg) | 부피(µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | 20세 이상 |
권장 샘플 배송
시료를 액체 질소에 3~4시간 동안 얼린 후 액체 질소 또는 -80도에서 장기간 보관하십시오. 시료 운송 시에는 드라이아이스를 사용해야 합니다.
서비스 워크플로우
샘플 배송
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
다음 분석 내용이 포함됩니다.
●원시 데이터 품질 관리
●OTU 클러스터링/잡음 제거(ASV)
●OTU 주석
●알파 다양성 분석: 섀넌, 심슨, ACE를 포함한 다양한 지표 사용.
●베타 다양성 분석
●그룹 간 분석
●상관 분석: 환경 요인과 OUT 구성 및 다양성 간의 상관관계
●16S 기능 유전자 예측
분류학적 분포 히스토그램
군집 분포 계통 발생 트리
알파 다양성 분석: ACE
색인
베타 다양성 분석: PCoA
집단 간 분석: 분산 분석
엄선된 논문 모음을 통해 BMKGene의 PacBio 앰플리콘 시퀀싱 서비스가 가져온 발전상을 살펴보세요.
Gao, X. 및 Wang, H. (2023) '알파인 초원의 두 성장 단계를 가진 알파인 메리노 양의 다른 생태학적 적응(녹화 vs. 풀밭) 동안 반추위 세균 프로필 및 기능의 비교 분석', 발효, 9(1), p. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) '배양체학 기반 메타게놈 및 고해상도 분석을 사용하여 사막 토양의 미생물 암흑물질 포착', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) '알팔파, 벼짚, 밀기울로 만든 혼합 사일리지의 발효 특성, 세균 다양성 및 호기성 안정성에 대한 지방산염의 영향', 식품 및 농업 과학 저널, 102(4), pp. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) '성체 제브라피쉬의 옥사졸론 유도 장내 산화 스트레스에서 Sonchus brachyotus DC. 추출물의 항산화 효과에 대한 산화 스트레스 바이오마커와 장내 미생물군 간의 상호작용', Antioxidants 2023, Vol. 12, Page 192, 12(1), p. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
