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PacBio-전체 길이 전사체(비참조)
Amplicon(16S/18S/ITS) 플랫폼은 미생물 다양성 프로젝트 분석에 대한 다년간의 경험으로 개발되었으며 표준화된 기본 분석 및 개인화 분석을 포함합니다. 기본 분석은 현재 미생물 연구의 주류 분석 내용을 다루고, 분석 내용은 풍부하고 포괄적이며, 분석 결과는 프로젝트 보고서 형식으로 제공됩니다.개인화 분석의 내용은 다양하다.기본 분석 보고서 및 연구 목적에 따라 샘플을 선택하고 매개변수를 유연하게 설정하여 개인화된 요구 사항을 실현할 수 있습니다.Windows 운영 체제, 간단하고 빠릅니다.
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PacBio-전체 길이 전사체(비참조)
Pacific Biosciences(PacBio) Isoform 시퀀싱 데이터를 입력으로 사용하는 이 앱은 전체 길이의 전사체 시퀀스(조립 없이)를 식별할 수 있습니다.참조 게놈에 대한 전장 서열을 매핑함으로써, 전사체는 공지된 유전자, 전사체, 코딩 영역 등에 의해 최적화될 수 있다. 이 경우, 대체 스플라이싱 등과 같은 mRNA 구조의 보다 정확한 식별이 달성될 수 있다.NGS 전사체 시퀀싱 데이터를 사용한 공동 분석을 통해 전사체 수준에서 발현에서 보다 포괄적인 주석과 보다 정확한 정량화가 가능하므로 다운스트림 차등 발현 및 기능 분석에 큰 이점이 있습니다.
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툴킷
BMKCloud는 게놈 프로그램을 위한 원스톱 솔루션을 제공하는 선도적인 생물정보학 플랫폼으로 의료, 농업, 환경 등 다양한 분야의 연구자들이 널리 신뢰하고 있습니다. BMKCloud는 생물정보학 분석 플랫폼 및 도구를 포함하여 통합되고 안정적이며 효율적인 서비스를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. , 컴퓨팅 자원, 공공 데이터베이스, 생물 정보학 온라인 과정 등 BMKCloud는 유전자 주석, 진화 유전자 도구, ncRNA, 데이터 품질 관리, 조립, 정렬, 데이터 추출, 돌연변이, 통계, 그림 생성기, 시퀀스를 포함하여 자주 사용되는 다양한 생물 정보학 도구를 보유하고 있습니다. 분석 등
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작은 RNA
Small RNA는 miRNA, siRNA 및 piRNA를 포함하여 평균 길이가 18-30 nt인 짧은 비암호화 RNA 유형입니다.이러한 small RNA는 mRNA 분해, 번역 억제, 이질염색질 형성 등과 같은 다양한 생물학적 과정에 관여하는 것으로 대대적으로 보고되었습니다. SmallRNA sequencing 분석은 동식물 발달, 질병, 바이러스 등의 연구에 널리 적용되어 왔습니다. Small RNA 시퀀싱 분석 플랫폼은 표준 분석과 고급 데이터 마이닝으로 구성됩니다.RNA-seq 데이터를 기반으로 표준 분석은 miRNA 식별 및 예측, miRNA 표적 유전자 예측, 주석 및 발현 분석을 달성할 수 있습니다.고급 분석을 통해 맞춤형 miRNA 검색 및 추출, 벤 다이어그램 생성, miRNA 및 표적 유전자 네트워크 구축이 가능합니다.
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NGS-WGS(Illumina/BGI)
NGS-WGS는 Biomarker Technologies의 풍부한 경험을 바탕으로 개발된 whole genome re-sequencing 분석 플랫폼입니다.이 사용하기 쉬운 플랫폼을 사용하면 Illumina 플랫폼과 BGI 시퀀싱 플랫폼에서 생성된 DNA 시퀀싱 데이터에 적합한 몇 가지 기본 매개변수를 설정하기만 하면 통합 분석 워크플로를 빠르게 제출할 수 있습니다.이 플랫폼은 고성능 컴퓨팅 서버에 배포되어 매우 제한된 시간에 매우 효율적인 데이터 분석을 가능하게 합니다.개인화된 데이터 마이닝은 돌연변이 유전자 쿼리, PCR 프라이머 디자인 등을 포함한 표준 분석을 기반으로 가능합니다.
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mRNA(참고)
전사체는 게놈 유전 정보와 생물학적 기능의 프로테옴 사이의 연결 고리입니다.전사 수준 조절은 유기체의 가장 중요하고 가장 널리 연구된 조절 방식입니다.전사체 시퀀싱은 단일 뉴클레오티드에 대한 정확한 분해능으로 임의의 시점 또는 조건에서 전사체를 시퀀싱할 수 있습니다. 이는 유전자 전사 수준을 동적으로 반영하고 희귀 및 정상 전사체를 동시에 식별 및 정량화하고 구조 정보를 제공할 수 있습니다. 샘플 특정 성적표.
현재, 전사체 시퀀싱 기술은 농경학, 의학 및 동물 및 식물 발달 조절, 환경 적응, 면역 상호 작용, 유전자 국재화, 종 유전 진화 및 종양 및 유전 질환 검출을 포함한 기타 연구 분야에서 널리 사용되었습니다.
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메타유전체학(NGS)
이 분석 플랫폼은 다년간의 경험을 바탕으로 샷건 메타게놈 데이터 분석을 위해 설계되었습니다.데이터 처리, 종 수준 연구, 유전자 기능 수준 연구, 메타게놈 비닝 등 일반적으로 필요한 다양한 메타유전체학 분석을 포함하는 통합 워크플로로 구성됩니다. 또한 표준 분석 워크플로에서 유전자 및 종 쿼리를 포함한 맞춤형 데이터 마이닝 도구를 사용할 수 있습니다. , 파라미터 설정, 개인화 도형 생성 등
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LncRNA
Long non-coding RNAs(lncRNA)는 200nt보다 긴 길이를 가진 전사체의 일종으로, 단백질을 암호화할 수 없습니다.축적된 증거에 따르면 대부분의 lncRNA가 기능할 가능성이 매우 높습니다.고처리량 시퀀싱 기술 및 생물정보학 분석 도구를 통해 lncRNA 서열 및 위치 정보를 보다 효율적으로 밝히고 중요한 조절 기능을 가진 lncRNA를 발견할 수 있습니다.BMKCloud는 빠르고 안정적이며 유연한 lncRNA 분석을 달성하기 위해 고객에게 lncRNA 시퀀싱 분석 플랫폼을 제공하게 된 것을 자랑스럽게 생각합니다.
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GWAS
GWAS(Genome-wide Association Study)는 특정 형질(표현형)과 관련된 유전 변이(유전자형)를 식별하는 것을 목표로 합니다.GWA 연구는 많은 개인의 전체 게놈을 가로지르는 유전자 마커를 조사하고 인구 수준에서 통계적 분석을 통해 유전자형-표현형 연관성을 예측합니다.전체 게놈 재배열은 잠재적으로 모든 유전 변이를 발견할 수 있습니다.표현형 데이터와 결합하여 GWAS를 처리하여 표현형 관련 SNP, QTL 및 후보 유전자를 식별할 수 있으며, 이는 현대 동물/식물 육종을 강력하게 뒷받침합니다.SLAF는 자체 개발한 단순화된 게놈 시퀀싱 전략으로, 게놈 전체에 분포된 마커인 SNP를 발견합니다.분자 유전적 마커로서 이러한 SNP는 표적 형질과의 연관성 연구를 위해 처리될 수 있습니다.이는 유전적 변이와 관련된 복잡한 특성을 식별하는 비용 효율적인 전략입니다.
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Nanopore 전장 전사체
유기체의 복잡하고 다양한 대체 이소형은 유전자 발현과 단백질 다양성을 조절하는 중요한 유전 메커니즘입니다.전사 구조의 정확한 식별은 유전자 발현 조절 패턴에 대한 심층 연구의 기초입니다.Nanopore 시퀀싱 플랫폼은 전사체 연구를 isoform 수준으로 성공적으로 가져왔습니다.본 분석 플랫폼은 Nanopore 플랫폼에서 생성된 RNA-Seq 데이터를 reference genome 기반으로 분석할 수 있도록 설계되었으며, 유전자 수준과 transcript 수준 모두에서 정성적, 정량적 분석이 가능합니다.
