circRNA 시퀀싱-Illumina
특징
● rRNA 고갈 후 방향성 라이브러리 준비를 통해 가닥별 시퀀싱 데이터가 가능합니다.
● 생물정보학 워크플로를 통해 circRNA 예측 및 발현 정량화가 가능합니다.
서비스 장점
●보다 포괄적인 RNA 라이브러리:우리는 사전 라이브러리 준비에서 선형 RNA 고갈 대신 rRNA 고갈을 사용하여 시퀀싱 데이터에 circRNA뿐만 아니라 mRNA 및 lncRNA도 포함되도록 하여 이러한 데이터 세트에 대한 공동 분석을 가능하게 합니다.
●경쟁적 내인성 RNA(ceRNA) 네트워크의 선택적 분석: 세포 조절 메커니즘에 대한 더 깊은 통찰력 제공
●광범위한 전문성: BMK에서 다양한 샘플 유형과 lncRNA 프로젝트에 걸쳐 20,000개 이상의 샘플을 처리한 실적을 보유한 우리 팀은 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리: 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 제어 지점을 구현합니다.이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 고품질 결과를 제공할 수 있습니다.
● 판매 후 지원: 당사의 약속은 프로젝트 완료 이후 3개월의 판매 후 서비스 기간까지 연장됩니다.이 기간 동안 우리는 결과와 관련된 모든 질문을 해결하기 위해 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q&A 세션을 제공합니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 플랫폼 | 권장 데이터 | 데이터 QC |
| 폴리A 농축 | 일루미나 PE150 | 16~20GB | Q30≥85% |
샘플 요구사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥6.5; 동물의 경우: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일 : 1.2g
● 동물:
심장 또는 내장: 450mg
내장 또는 뇌: 240 mg
근육: 600mg
뼈, 머리카락, 피부: 1.5g
● 절지동물:
곤충 : 9g
갑각류: 450mg
● 전혈:튜브 2개
● 셀: 106 세포
● 혈청 및 혈장: 6mL
권장 샘플 배송
용기: 2 ml 원심분리 튜브 (Tin Foil은 권장하지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3);B1, B2, B3... ...
선적:
1. 드라이아이스: 샘플을 가방에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
2. RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
circRNA 예측: 염색체 분포
차등적으로 표현된 circRNA – 화산 플롯
차등적으로 발현되는 circRNA – 계층적 클러스터링
circRNA 숙주 유전자의 기능적 강화
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 BMKGene의 circRNA 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 연구 발전을 살펴보세요.
Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4는 간세포 암종에서 circRNA 형성 및 마이크로RNA 매개 유전자 침묵을 조절합니다', Oncogene 2021 40:25, 40(25), pp. 4338-4351.도이: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K.et al.(2023) 'X oo-반응성 전사체는 쌀에서 OsARAB의 발현을 조절함으로써 질병 저항성에서 원형 RNA133의 역할을 드러냅니다', Phytopathology Research, 5(1), pp. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al.(2023) 'CPSF3은 간세포 암종에서 원형 및 선형 전사체의 균형을 조절합니다.'doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) '간 이식 전후의 간경변성 심근병증에서 circRNA의 종합 평가', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
