CircRNA 시퀀싱 - 일루미나
특징
● rRNA 제거 후 방향성 라이브러리 준비를 통해 가닥 특이적 시퀀싱 데이터를 얻을 수 있습니다.
● 생물정보학 워크플로우를 통해 circRNA 예측 및 발현량 정량화가 가능합니다.
서비스 장점
●폭넓은 전문 지식저희는 다양한 유형의 샘플을 포함하여 2만 건 이상의 샘플을 처리해 왔으며, 모든 프로젝트에 풍부한 전문 지식을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 준비부터 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●더욱 포괄적인 RNA 라이브러리:저희는 라이브러리 전처리 과정에서 선형 RNA 제거 대신 rRNA 제거 방식을 사용하여 시퀀싱 데이터에 circRNA뿐만 아니라 mRNA 및 lncRNA도 포함되도록 함으로써 이러한 데이터 세트의 공동 분석이 가능하도록 합니다.
●경쟁적 내인성 RNA(ceRNA) 네트워크의 선택적 분석세포 조절 메커니즘에 대한 더 심층적인 통찰력을 제공합니다.
● 판매 후 지원저희는 고객과의 지속적인 소통이 얼마나 중요한지 잘 알고 있습니다. daarom 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 플랫폼 | 권장 데이터 | 데이터 QC |
| rRNA 결핍 방향성 라이브러리 | 일루미나 PE150 | 16-20GB | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일: 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 450mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 600mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1.5g
● 절지동물:
곤충: 9g
갑각류: 450mg
● 전혈:튜브 2개
● 세포: 106 세포
● 혈청 및 혈장: 6mL
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
- 데이터 QC
- 게놈 정렬
- CircRNA 식별
- CircRNA 발현
- 차등 발현 분석
circRNA 예측: 염색체 분포
차등 발현 circRNA – 화산 도표
차등 발현 circRNA – 계층적 클러스터링
circRNA의 숙주 유전자의 기능적 풍부화
BMKGene의 circRNA 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 연구 발전을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4는 간세포암에서 circRNA 형성 및 microRNA 매개 유전자 침묵을 조절한다',종양유전자2021 40:25, 40(25), pp. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'X oo-반응성 전사체는 벼에서 OsARAB 발현을 조절함으로써 질병 저항성에 있어 원형 RNA133의 역할을 밝혀낸다'식물병리학 연구, 5(1), pp. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3는 간세포암에서 원형 및 선형 전사체의 균형을 조절합니다'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. 외 (2023) '간 이식 전후 간경변성 심근병증에서 circRNA의 종합적 평가'국제 면역약리학, 114, p. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
