[복사] 진핵세포 mRNA 시퀀싱-NGS
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특징
● 라이브러리 준비 전 폴리 mRNA 포획
● 선택적으로 방향성 mRNA 라이브러리 준비를 통해 가닥 특이적 시퀀싱 데이터를 얻을 수 있습니다.
● 유전자 발현 및 전사체 구조에 대한 생물정보학적 분석
장점
●폭넓은 전문 지식저희 BMKgene 팀은 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 유형의 샘플 60만 개 이상을 처리해 왔습니다. 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 바탕으로 다양한 연구 분야에서 10만 건 이상의 mRNA-Seq 프로젝트를 성공적으로 완료했습니다.
●엄격한 품질 관리저희는 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공하며, 고객님의 프로젝트가 신뢰할 수 있는 전문가의 손에 맡겨졌음을 보장합니다.
●종합 주석저희는 다양한 데이터베이스를 활용하여 차등 발현 유전자(DEG)의 기능을 분석하고, 이에 상응하는 유전자 발현량 분석을 수행합니다. 이러한 포괄적인 접근 방식을 통해 전사체 반응의 기저에 있는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며, 프로젝트 결과에 대한 완벽한 이해를 보장합니다.
●판매 후 지원저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 서비스를 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| 폴리 A 강화 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10GB | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
최소 샘플 요구 사항:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 | |
| 표준 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
| 방향 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
| 식물 | 동물 | 절지동물 | 전혈 | 세포 |
| 뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg 잎 또는 씨앗: 300mg 과일: 1.2g | 심장 또는 장: 300mg 내장 또는 뇌: 240mg 근육: 450mg 뼈, 머리카락 또는 피부: 1g | 곤충: 6g 갑각류: 300mg | 튜브 1개 | 106개의 세포 |
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3...)
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
샘플 요구사항 및 납품
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생물정보학
진핵생물 mRNA 시퀀싱 분석 워크플로우
생물정보학
Ø원시 데이터 품질 관리
Ø참조 게놈 정렬
Ø전사 구조 분석
Ø발현량 정량화
Ø차등 발현 분석
Ø함수 주석 및 보강
참조 게놈 정렬
데이터 포화
샘플 상관관계 및 생물학적 반복 평가
차등 발현 유전자(DEGs)
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 주석
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 풍부도
BMKGene의 진핵세포 NGS mRNA 시퀀싱 서비스가 가져온 발전상을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Huang, L. et al. (2023) '트리클로산과 트리클로카르반은 냄새 인식을 제한하고, 후각 신호 전달을 방해하고, 후각 정보 처리를 방해함으로써 금붕어의 후각 능력을 약화시킨다', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus는 인간 p11을 이용하여 곰팡이를 포함하는 식포를 비분해 경로로 전환합니다', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) '마대나무(Dendrocalamus latiflorus Munro)의 순 발달에 관련된 TCP 전사 인자', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) '국화(Chrysanthemum lavandulifolium) 게놈과 다양한 꽃차례 유형의 분자 메커니즘', 원예 연구, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) '시너지 효과를 내는 ROS 증강 및 자가포식 차단을 통해 대장암에 대한 초음파역동치료를 강화하기 위한 캐스케이드 나노반응기', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
