전체 길이 mRNA 시퀀싱-나노포어
특징
● 폴리-A mRNA 포획 후 cDNA 합성 및 라이브러리 준비
● 전체 길이 전사본의 시퀀싱
● 참조 게놈과의 정렬에 기반한 생물정보학 분석
● 생물정보학적 분석에는 유전자 및 이소형 수준에서의 발현뿐만 아니라 lncRNA, 유전자 융합, 폴리아데닐화 및 유전자 구조 분석도 포함됩니다.
서비스 장점
●아이소폼 수준에서의 발현량 정량화상세하고 정확한 발현 분석을 가능하게 하여 전체 유전자 발현 분석 시 가려질 수 있는 변화를 밝혀냅니다.
●데이터 요구량 감소:차세대 염기서열 분석(NGS)과 비교했을 때, 나노포어 염기서열 분석은 데이터 요구량이 적어 더 적은 데이터로도 동등한 수준의 유전자 발현 정량 분석을 수행할 수 있습니다.
●발현량 정량화의 정확도 향상유전자 수준과 아이소폼 수준 모두에서
●추가적인 전사체 정보 식별대체 폴리아데닐화, 융합 유전자 및 lcnRNA와 그 표적 유전자
●폭넓은 전문 지식저희 팀은 850건 이상의 나노포어 전체 길이 전사체 프로젝트를 완료하고 8,000개 이상의 샘플을 처리한 풍부한 경험을 바탕으로 모든 프로젝트에 임합니다.
●판매 후 지원저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 서비스를 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| 폴리 A 강화 | 나노포어 프로메션 48 | 6/12GB | 평균 품질 점수: Q10 |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥7.0; 동물의 경우: RIN≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일: 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 300mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 450mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1g
● 절지동물:
곤충: 6g
갑각류: 300mg
● 전혈: 튜브 1개
● 세포: 106 세포
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
뉴클레오티드:
샘플 배송
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
서비스 워크플로우
조직:
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
● 원시 데이터 처리
● 성적증명서 확인
● 대체 스플라이싱
● 유전자 수준 및 아이소폼 수준에서의 발현량 정량화
● 차등 발현 분석
● 기능 주석 및 풍부도 분석 (차등 발현 유전자 및 차등 발현 유전자)
대체 스플라이싱 분석
대체 폴리아데닐화 분석(APA)
lncRNA 예측
새로운 유전자 주석
DET의 클러스터링
차등 발현 유전자(DEGs)의 단백질-단백질 네트워크
BMKGene의 나노포어 전장 mRNA 시퀀싱 서비스가 가능하게 한 발전 사항들을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Gong, B. et al. (2023) '신경교종에서 종양유전자로서의 분비 키나제 FAM20C의 후성유전적 및 전사적 활성화', 유전학 및 유전체학 저널, 50(6), pp. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
He, Z. et al. (2023) 'IFN-γ에 반응하는 림프구의 전체 길이 전사체 시퀀싱은 가자미(Paralichthys olivaceus)에서 Th1 편향 면역 반응을 나타냅니다', 어류 및 조개류 면역학, 134, p. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
Ma, Y. et al. (2023) 'Nemopilema Nomurai 독 식별을 위한 PacBio 및 ONT RNA 시퀀싱 방법의 비교 분석', Genomics, 115(6), p. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
Yu, D. et al. (2023) 'Nano-seq 분석은 hUMSC에서 유래한 엑소좀과 미세소포 사이의 다른 기능적 경향을 보여줍니다', 줄기세포 연구 및 치료, 14(1), pp. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
