게놈 전체 연관 분석
워크플로우
서비스 장점
●폭넓은 전문 지식과 출판 실적BMKGene은 GWAS 분야에서 축적된 경험을 바탕으로 수백 건의 종별 집단 GWAS 연구 프로젝트를 완료했으며, 연구자들이 100편 이상의 논문을 발표하도록 지원했고, 누적 영향력 지수는 500에 달합니다.
● 종합적인 생물정보학 분석워크플로우에는 SNP-형질 연관 분석이 포함되어 후보 유전자 세트와 해당 기능 주석을 제공합니다.
●고도로 숙련된 생물정보학 팀과 짧은 분석 주기BMKGene 팀은 첨단 유전체 분석 분야에서 풍부한 경험을 바탕으로 신속한 처리 시간 내에 종합적인 분석 결과를 제공합니다.
●판매 후 지원:저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
서비스 사양 및 요구 사항
| 시퀀싱 유형 | 권장 인구 규모 | 시퀀싱 전략 | 뉴클레오티드 요구 사항 |
| 전체 게놈 시퀀싱 | 200개 샘플 | 10배 | 농도: ≥ 1 ng/µL 총량 ≥ 30ng 변질이나 오염이 거의 없거나 전혀 없음 |
| 특정 유전자 증폭 단편(SLAF) | 태그 깊이: 10배 태그 개수: 400MB 미만: 전장 유전체 시퀀싱(WGS)을 권장합니다. < 1GB: 100K 태그 1GB > 2GB: 30만 개 태그 최대 50만 개의 태그 | 농도 ≥ 5 ng/µL 총량 ≥ 80 ng 아가로스 겔: 분해 또는 오염이 없거나 매우 제한적임
|
재료 선택
다양한 품종, 아종, 재래종/유전자은행/혼합 계통/야생 자원
다양한 품종, 아종, 재래종
이복형제 가족/친형제 가족/야생 자원
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
다음 분석 내용이 포함됩니다.
- 게놈 전체 연관 분석: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM 모델
- 후보 유전자의 기능적 주석
SNP-형질 연관 분석 - 맨해튼 플롯
SNP-형질 연관 분석 – QQ 플롯
BMKGene의 GWAS 서비스가 가능하게 한 발전 사항들을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요:
Lv, L. 외 (2023) '게놈 전체 연관 연구를 통한 면도날조개(Sinonovacula constricta)의 암모니아 내성 유전적 기반에 대한 통찰'양식, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) '398개 조 품종에 대한 다중 오믹스 분석을 통해 가축화, 대사물 특성 및 항염증 효과와 관련된 유전체 영역을 밝혀냈습니다',분자 식물, 15(8), pp. 1367–1383. 도이: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) '가뭄 환경에서 껍질 없는 보리 표현형의 게놈 전체 연관 매핑',식물 과학의 최첨단 분야, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) '황산전달효소를 암호화하는 GmST1은 대두 모자이크 바이러스 균주 G2 및 G3에 대한 저항성을 부여합니다',식물, 세포 및 환경, 44(8), pp. 2777–2792. 도이: 10.1111/PCE.14066.
