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식물/동물 드 노보 게놈 시퀀싱
드 노보시퀀싱은 참조 게놈이 없는 상태에서 PacBio, Nanopore, NGS 등과 같은 시퀀싱 기술을 사용하여 종의 전체 게놈을 구성하는 것을 말합니다.3세대 시퀀싱 기술의 리드 길이의 현저한 개선은 높은 이형접합, 높은 비율의 반복 영역, 배수체 등과 같은 복잡한 게놈을 조립하는 새로운 기회를 가져왔습니다. 수십 킬로베이스 수준의 리드 길이로 이러한 시퀀싱 리드는 반복 요소, 비정상적인 GC 함량이 있는 영역 및 기타 고도로 복잡한 영역의 해결.
플랫폼: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
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Hi-C 기반 게놈 어셈블리
Hi-C는 근접 기반 상호 작용과 높은 처리량 시퀀싱을 결합하여 염색체 구성을 캡처하도록 설계된 방법입니다.이러한 상호 작용의 강도는 염색체의 물리적 거리와 음의 상관 관계가 있는 것으로 믿어집니다.따라서 Hi-C 데이터는 초안 게놈에서 조립된 서열의 클러스터링, 정렬 및 방향을 안내하고 이들을 특정 수의 염색체에 고정할 수 있습니다.이 기술은 인구 기반 유전자 지도가 없을 때 염색체 수준의 게놈 조립을 가능하게 합니다.모든 단일 게놈에는 Hi-C가 필요합니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
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진화 유전학
진화 유전학은 SNP, InDels, SV 및 CNV를 포함한 유전적 변이를 기반으로 주어진 물질의 진화 정보에 대한 포괄적인 해석을 제공하기 위해 설계된 패킹된 시퀀싱 서비스입니다.인구 구조, 유전적 다양성, 계통 발생 관계 등과 같은 집단의 진화적 변화 및 유전적 특징을 설명하는 데 필요한 모든 기본 분석을 제공합니다. 또한 유효 집단 크기, 발산 시간의 추정을 가능하게 하는 유전자 흐름에 대한 연구도 포함합니다.
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비교유전체학
비교 유전체학은 말 그대로 다른 종의 완전한 유전체 염기서열과 구조를 비교하는 것을 의미합니다.이 분야는 다른 종에 걸쳐 보존되거나 분화된 서열 구조와 요소를 식별하여 게놈 수준에서 종의 진화, 유전자 기능, 유전자 조절 메커니즘을 밝히는 것을 목표로 합니다.대표적인 비교유전체학 연구에는 유전자군 분석, 진화발달, 전체유전체 복제, 선택압 등의 분석이 포함된다.
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대량 분리 분석
대량 분리 분석(BSA)은 표현형 관련 유전자 마커를 빠르게 식별하는 데 사용되는 기술입니다.BSA의 주요 작업 흐름에는 극도로 반대되는 표현형을 가진 두 그룹의 개인을 선택하고 모든 개인의 DNA를 풀링하여 두 벌크의 DNA를 형성하고 두 풀 사이의 차등 서열을 식별하는 작업이 포함됩니다.이 기술은 식물/동물 게놈에서 표적 유전자와 강하게 연관된 유전자 마커를 식별하는 데 광범위하게 사용되었습니다.
