장쇄 비코딩 시퀀싱-일루미나
서비스 장점
●mRNA와 lncRNA의 공동 분석mRNA 전사체의 정량화와 lncRNA 및 그 표적에 대한 연구를 결합함으로써 세포 반응의 기저에 있는 조절 메커니즘에 대한 심층적인 개요를 얻을 수 있습니다.
●폭넓은 전문 지식저희는 다양한 샘플과 프로젝트 목표에 걸쳐 23만 건 이상의 샘플을 처리해 왔습니다. 모든 프로젝트에 풍부한 전문 지식을 제공합니다.
●mRNA와 lncRNA의 공동 분석우리는 mRNA 전사체의 정량화와 lncRNA 및 그 표적에 대한 연구를 결합하여 세포 반응의 기저에 있는 조절 메커니즘에 대한 심층적인 개요를 얻을 수 있도록 합니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 준비부터 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●종합 주석저희는 여러 데이터베이스를 활용하여 차등 발현 유전자(DEG)의 기능을 분석하고, 이에 상응하는 유전자 발현량 분석을 수행합니다. 이러한 포괄적인 접근 방식을 통해 전사체 반응의 기저에 있는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며, 실험 데이터에 대한 모든 정보를 확보할 수 있도록 지원합니다.
●판매 후 지원저희는 고객과의 지속적인 소통이 얼마나 중요한지 잘 알고 있습니다. daarom 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 플랫폼 | 권장 데이터 | 데이터 QC |
| rRNA 결핍 방향성 라이브러리 | 일루미나 PE150 | 10-16GB | Q30≥85% |
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일: 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 450mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 600mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1.5g
● 절지동물:
곤충: 9g
갑각류: 450mg
● 전혈:튜브 2개
● 세포: 106 세포
● 혈청 및 혈장: 6mL
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
- 원시 데이터
- 데이터 QC
- 게놈 정렬
- 유전자 구조 (대체 스플라이싱, 유전자 구조 최적화 및 신규 유전자 예측)
- 유전자 발현 정량화
- 차등 발현 분석
- DEG 주석 및 풍부도 분석 + 차등 발현 lncRNA 표적 유전자
- 전사본 식별
- lncRNA 식별 (lncRNA 보존 및 알려진 lncRNA)
- lncRNA 표적 유전자 예측
- lncRNA 발현량 정량화
- mRNA 데이터를 이용한 공동 분석
차등 유전자 발현(DEGs) 분석
lncRNA 발현량 정량화 – 클러스터링
lncRNA 표적 유전자의 농축
mRNA와 lncRNA의 위치 공동 분석 – Circos 플롯 (가운데 원은 mRNA, 안쪽 원은 lncRNA)
BMKGene의 lncRNA 시퀀싱 서비스가 가져온 발전상을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Ji, H. et al. (2020) '쥐 간에서 저온 스트레스 관련 lncRNA의 식별, 기능 예측 및 핵심 lncRNA 검증'사이언티픽 리포트2020 10:1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. 외 (2021) '통합 전사체 분석을 통해 CyHV-3 저항성 잉어 균주의 면역 메커니즘을 밝혀냄',면역학의 최전선, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ 외 (2022) '소세포폐암에서 경쟁하는 내인성 RNA 조절 네트워크의 다중 오믹스 통합 기반 우선순위 지정: 분자적 특성 및 약물 후보',종양학의 최전선, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) '포플러의 광합성을 뒷받침하는 유전자 공동 발현 네트워크의 유전적 분석',식물생명공학저널, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) '그레이브스병 및 하시모토 갑상선염의 미세환경 내 면역세포에서 조절 장애 유전자 발현 및 비정상적인 대사 신호 전달을 위한 글로벌 조절 네트워크',면역학의 최전선, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
