대사체학
특징
●비-표적 대사체학(발견형 대사체학)
액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS) 기술을 기반으로 하는 비표적 대사체학은 세포, 조직, 장기 또는 체액과 같은 생체 시료에서 가능한 한 많은 저분자 대사 물질을 편향 없이 검출할 수 있도록 합니다. 이 방법은 실험군과 대조군 간의 비교 분석을 수행하고 통계 분석을 통해 차별적으로 발현되는 대사 물질을 선별합니다.
● 지질에 대한 비표적 대사체학
액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS) 기술을 활용하여,n지질 표적 대사체학은 세포, 조직, 장기 또는 체액을 포함한 생물학적 샘플에서 가능한 한 많은 지질 분자를 편향 없이 검출하는 것을 목표로 합니다.
● 넓은-표적 대사체학
이 서비스는 비표적 기술의 고해상도 및 광범위한 분석 범위라는 장점과 표적 MRM(다중 반응 모니터링) 기술의 높은 감도 및 정확한 정량 분석 능력을 완벽하게 결합합니다. 워크플로는 다음과 같습니다. 먼저, 고해상도 질량 분석기를 사용하여 시료에 대한 초고해상도 MS² 스캐닝을 수행하여 모든 대사체의 MS² 스펙트럼을 얻습니다. 그런 다음, 고해상도 MS² 라이브러리(25,000개 이상의 대사체, 각 대사체에 대한 여러 표준 고해상도 MS² 스펙트럼 포함)와 결합하여 정확한 대사체 식별을 수행합니다. 이어서, 질량 스펙트럼에서 MRM 이온 쌍 정보를 추출하여 시료에 특화된 라이브러리를 구축합니다. 마지막으로, MRM 기술이 적용된 삼중 사중극자 질량 분석기를 사용하여 정확한 정량 분석을 수행합니다.
● 표적 대사체학
표적 대사체학은 특정 경로에 관여하는 여러 표적 화합물 또는 전체/부분 대사산물에 초점을 맞춥니다. 표준 물질을 사용하여 표적 화합물의 정량 및 분석을 위한 높은 특이성, 민감도 및 재현성을 갖춘 검출 방법을 확립합니다. 절대 정량을 위해 외부 표준 물질과 내부 표준 물질을 함께 사용하며, 표준 곡선의 선형성은 0.99 이상, 민감도는 ng/mL 수준까지 도달합니다.
장점
●고급 탐지 플랫폼
-최첨단 고해상도 질량 분석기와 삼중 사중극자 질량 분석기를 탑재하여 수천 가지 대사 물질을 동시에 검출 및 분석할 수 있습니다.
●종합 데이터베이스
- 공개 데이터베이스: METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas, Lipidmaps 등을 포함하며 50만 개 이상의 대사물질 정보를 제공합니다.
- 내부식물 특이적 데이터베이스: 1차 및 2차 대사산물을 포함하여 25,000개 이상의 대사산물을 함유하고 있습니다.
- 내부동물/의료 분야 특화 데이터베이스: 12,000개 이상의 대사 물질을 포함합니다.
●엄격한 품질 관리 시스템
-기기 안정성, 물질 잔류물, QC 샘플의 PCA 및 상관 분석을 포함하는 엄격한 품질 관리를 통해 신뢰할 수 있는 데이터 품질을 보장합니다.
●높은 대사물질 검출 능력
- 비-표적 대사체학: 한 번 분석 시 평균 4,200개 이상의 대사체를 검출하여, 시료에서 알려지지 않은 대사체를 탐색하고 복잡한 시료에서 대사체를 식별하는 데 이상적입니다.
- 넓은-표적 대사체 분석(식물): 1차 및 2차 대사 산물을 포함하여 실행당 평균 2,410개 이상의 대사 산물을 검출합니다.
- 넓은-표적 대사체학(동물): 회당 평균 1,250개 이상의 대사체를 검출합니다.
- 표적 대사체학: 패널~을 위한다양한 대사산물 범주.
●종합 분석
-10개 이상의 분석 항목과 20개 이상의 시각화 차트를 제공합니다.
●세심한 사후 서비스
-판매 후 상담 및 최종 보고서 해석 지원을 제공합니다.
서비스 사양
| 해결책 | 플랫폼 | 권장 생물학적 반복 횟수 |
|---|---|---|
| 비표적 대사체학 | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | 식물 및 미생물 샘플: ≥ 6 동물 샘플: ≥ 10 임상 샘플: ≥ 30 모든 생물학적 반복 샘플은 독립적으로 분석되었습니다. |
| 광범위 표적 대사체학 | 워터 제보 G2-XS QTOF + AB 사이엑스 QTRAP 6500+ | 식물 샘플: 3개 이상 |
| 표적 대사체학 | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (애질런트 7890-5977, 애질런트 7820-5977) | 식물 샘플: 3개 이상 동물 샘플: ≥ 6 |
샘플 요구 사항
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서비스 워크플로우
샘플 수집
대사물질 추출
데이터 수집
데이터 분석
데이터 전송
1. 원시 데이터의 배경 잡음 및 저품질 데이터 처리
2. 데이터 품질 평가
2.1 주성분 분석
2.2 재현성 평가
3. 대사산물 주석
3.1 KEGG 데이터베이스 주석
3.2 HMDB 데이터베이스 주석
3.3 리피드맵 데이터베이스 주석
4. 샘플 그룹화 데이터 분석 (생물학적 반복)≥3)
4.1 그룹 주성분 분석
4.2 직교 부분 최소 제곱 판별 분석(OPLS-DA)
4.3 그룹별 차등 대사물질 분석
5. 차별적 대사산물 선택(생물학적 반복)≥3)
5.1 차등 배율 변화 분석
5.2 차등 대사산물 화산 도표
5.3 차별적 대사산물 클러스터링 히트맵
5.4 차등 대사물질 상관관계 도표
5.5 차등 대사체 Z-점수 플롯
5.6 차등 대사체 레이더 플롯 분석
5.7 차등 대사산물 바이올린 플롯
5.8 차등 대사산물 상자 그림
5.9 차등 대사산물 KEGG 기능 주석 및 풍부도 분석
5.10 ROC 곡선 분석
5.11 차등 대사체 k-평균 클러스터링
5.12 차별적 대사산물 벤 다이어그램
1. 데이터 품질 평가
↑C상관관계 분석(시험 샘플/품질 관리 샘플)
↑주성분 분석 ↑대사산물 클러스터링 분석
2. 대사산물 주석
↑KEGG 데이터베이스 주석↑HMDB 데이터베이스 주석
↑지질지도 데이터베이스 주석
3. 샘플 그룹화 데이터 분석 (생물학적 반복)≥3)
↑그룹 주성분 분석(2D/3D)
↑직교 부분 최소 제곱 판별 분석(OPLS-DA)
4. 차별적 대사물질 선택(생물학적 반복)≥3)
↑차등 배율 변화 분석↑차등 대사산물 화산 플롯
↑차등 대사물질 클러스터링 히트맵↑차등 대사물질 상관관계 그래프
↑차등 대사산물 Z-점수 플롯↑차등 대사물질 레이더 플롯 분석
↑차등 대사산물 바이올린 플롯↑차등 대사산물 상자 그림
↑차등 대사산물 KEGG 기능 주석 및 풍부도 분석
↑ROC 곡선 분석↑차등 대사물질 k-평균 클러스터링
↑미분대사물질 벤다이어그램
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. Malus domestica의 BEL1 유사 호메오도메인 전사 인자 SAWTOOTH1(MdSAW1)은 형질전환 사과와 애기장대의 아연 과잉 스트레스 내성을 향상시킨다. Int J Biol Macromol. 2025년 5월;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025년 3월 10일. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. 모링가 올레이페라 매개 녹색 나노입자와 수지상 균근균이 옥수수(Zea mays L.)의 생장, 뿌리 시스템 구조 및 영양분 흡수에 미치는 상호작용 효과. Plant Physiol Biochem. 2025년 9월;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025년 5월 24일. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Jasmonate activates a SlJAZ2/3-SlMYC3-like module regulating K+ uptake in tomato response to low K+ stress. J Integr Plant Biol. 2025 Aug;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 May 28. PMID: 40432500.
