● RRNA 고갈과 방향성 mRNA 라이브러리 제조.
● Illumina Novaseq에서 시퀀싱.
●복잡한 미생물 공동체의 변화를 연구하십시오.이것은 전사 수준에서 발생하며 잠재적 인 새로운 유전자를 탐색합니다.
●호스트 또는 환경과의 미생물 커뮤니티 상호 작용을 설명합니다.
●포괄적 인 생물 정보 분석: 이것은 지역 사회 분류 및 기능 구성에 대한 통찰력과 차등 유전자 발현 분석에 대한 통찰력을 제공합니다.
●광범위한 유전자 주석 :미생물 군집의 유익한 유전자 발현 정보를위한 최신 유전자 기능 데이터베이스 사용.
●판매 후 지원 :우리의 약속은 프로젝트 완료를 넘어 3 개월간의 사후 서비스 기간으로 확장됩니다. 이 기간 동안 우리는 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q & A 세션을 제공하여 결과와 관련된 쿼리를 해결합니다.
시퀀싱 플랫폼 | 시퀀싱 전략 | 데이터가 권장됩니다 | 데이터 품질 관리 |
Illumina novaseq | PE150 | 12GB | Q30 ≥85% |
농도 (NG/µL) | 총량 (µg) | 볼륨 (µL) | OD260/280 | OD260/230 | 린 |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
다음 분석을 포함합니다.
● 데이터 품질 관리 시퀀싱
● 성적표 어셈블리
● 분류 학적 주석 및 풍요
● 기능성 주석 및 풍요
● 발현 정량화 및 차등 분석
각 샘플의 분류 학적 분포 :
베타 다양성 분석 : UPGMA
기능성 주석 - 풍요 로움
차등 분류법 풍부함 - lefse
선별 된 출판물 모음을 통해 BMKGENE의 Meta Transcriptomics 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 발전을 탐구하십시오.
Lu, Z. et al. (2023) '세트 바테로이드의 락 테이트에 활용 박테리아의 산성 내성은 고기질식이 요법에 적응 된 염소에서 반추 동물 산증의 예방에 기여한다',동물 영양, 14, pp. 130–140. doi : 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
노래, Z. et al. (2017) '고 처리량 앰플 리콘 및 Metatranscriptomics 시퀀싱에 의한 전통적인 고형 상태 발효에서'핵심 기능성 미생물을 풀고있다 ',미생물학의 국경, 8 (7 월). doi : 10.3389/fmicb.2017.01294/full.
Wang, W. et al. (2022) 'Phytopathogenic Alternaria Fungus의 Metatranscriptomics 조사에서 발견 된 소설 Mycovirus'바이러스, 14 (11), p. 2552. doi : 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) '평행 한 메타 트란 스크립 롬 분석은 딱정벌레와 장내 공생체에 의한 식물 2 차 대사 산물의 분해를 보여준다',분자 생태학, 31 (15), pp. 3999–4016. doi : 10.1111/Mec.16557.