mRNA-seq(NGS) – 데 노보

mRNA 시퀀싱은 특정 조건에서 세포 내 모든 mRNA 전사체를 분석할 수 있게 해주는 기술로, 다양한 연구 분야에서 널리 사용되고 있습니다. BMKCloud De novo mRNA-seq 파이프라인은 참조 게놈이 없는 경우 폴리-A가 풍부한 시퀀싱 라이브러리를 분석하도록 설계되었습니다. 이 파이프라인은 품질 관리로 시작하여,데 노보전사체 조립 및 유니진 세트 선택. 유니진 구조 분석을 통해 코딩 서열(CDS)과 단순 반복 서열(SSR)을 예측합니다. 이후, 차등 발현 분석을 통해 실험 조건 간 차등 발현 유전자(DEG)를 찾아내고, DEG의 기능 주석 및 풍부도 분석을 통해 생물학적 통찰력을 추출합니다.