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메타게놈 시퀀싱-TGS

메타게놈은 환경 메타게놈 및 인간 메타게놈과 같이 다양한 유기체 군집의 유전 물질 집합체입니다. 여기에는 배양 가능한 미생물과 배양 불가능한 미생물의 게놈이 모두 포함됩니다. 메타게놈 시퀀싱은 단순한 분류학적 분석을 넘어 생태학적 샘플에 내재된 이러한 복잡한 게놈 환경을 연구할 수 있도록 해줍니다. 또한, 암호화된 유전자와 환경 과정에서의 잠재적 역할을 탐색함으로써 기능 유전체학적 관점을 제공합니다. 일루미나 시퀀싱을 이용한 기존의 샷건 방식이 메타게놈 연구에 널리 사용되어 왔지만, 나노포어 및 팩바이오 장거리 시퀀싱 기술의 등장으로 이 분야는 혁신적으로 변화했습니다. 나노포어와 팩바이오 기술은 특히 메타게놈 어셈블리와 같은 후속 생물정보학 분석을 향상시켜 더욱 연속적인 어셈블리를 보장합니다. 나노포어 및 팩바이오 기반 메타게놈 분석을 통해 복잡한 미생물 군집에서 완전하고 폐쇄적인 세균 게놈을 성공적으로 생성했다는 보고가 있습니다(Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). 나노포어 시퀀싱 데이터와 일루미나 시퀀싱 데이터를 통합하는 것은 오류를 수정하는 전략적 접근 방식으로, 나노포어의 고유한 낮은 정확도를 보완합니다. 이러한 시너지 효과를 통해 각 시퀀싱 플랫폼의 강점을 활용하여 잠재적 한계를 극복하고 메타게놈 분석의 정확성과 신뢰성을 향상시키는 강력한 솔루션을 제공합니다.

플랫폼: Nanopore PromethION 48, Illumia 및 PacBio Revio

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서비스 세부 정보

생물정보학

데모 결과

주요 출판물

서비스 특징

● Nanopore P48(10Kb 라이브러리) 및 PacBio Revio(8Kb 라이브러리)를 이용한 장거리 시퀀싱 분석

● 오류 수정: Illumina NovaSeq(PE150 라이브러리)를 이용한 시퀀싱

서비스 장점

●고품질 메타게놈 어셈블리:연속성이 더 높은 컨티그의 수가 더 적습니다.

●더 높은 정확도:종 식별 및 기능 유전자 예측.

●조립 개선세균 게놈 분리 및 비교 메타게놈 분석을 용이하게 합니다.

●종합적인 생물정보학 분석:우리의 분석은 분류학적 다양성뿐만 아니라 군집의 기능적 다양성에도 초점을 맞추고 있습니다.

●풍부한 경험저희 팀은 다양한 연구 분야에서 다수의 메타게놈 프로젝트를 성공적으로 완료하고 20만 개 이상의 샘플을 처리한 실적을 바탕으로 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다.

서비스 사양

시퀀싱 플랫폼	시퀀싱 전략	데이터 권장 사항
일루미나 노바시크	PE150	6기가바이트
나노포어 P48	10kb	6/10GB
PacBio Revio	8kb	10/20GB

샘플 요구 사항

	농도(ng/µL)	총량(µg)	부피(µL)
일루미나 PE150 라이브러리	≥1	≥0.03	20세 이상
나노포어 10kb 라이브러리	40세 이상	≥2	20세 이상
PacBio 8kb 라이브러리	50세 이상	10 µg/세포	20세 이상