나노포어 전체 길이 전사체

나노포어 전사체 시퀀싱은 전장 cDNA를 시퀀싱하고 전사체 이형체를 정확하게 식별 및 정량화하는 강력한 방법입니다. BMKCloud 나노포어 전장 전사체 파이프라인은 나노포어 플랫폼에서 생성된 RNA-Seq 데이터를 고품질의 잘 주석된 참조 게놈과 비교하여 유전자 및 전사체 수준에서 정성적 및 정량적 분석을 제공하도록 설계되었습니다. 품질 관리 후, 전장 비키메라(FLNC) 시퀀스를 얻고, 중복 전사체를 제거하기 위해 컨센서스 시퀀스를 참조 게놈에 매핑합니다. 이 전사체 세트에서 발현량을 정량화하고, 차등 발현 유전자 및 전사체를 식별하고 기능적으로 주석을 달습니다. 이 파이프라인에는 대체 폴리아데닐화(APA) 분석, 대체 스플라이싱 분석, 단순 반복 서열(SSR) 분석, lncRNA 및 해당 표적 예측, 코딩 서열(CDS) 예측, 유전자 패밀리 분석, 전사 인자 분석, 신규 유전자 예측 및 전사체의 기능적 주석도 포함됩니다.