비참조 기반 mRNA 시퀀싱-NGS
특징
● 라이브러리 준비 전 폴리 mRNA 포착
● 참조 게놈에 구애받지 않음: 전사체의 de novo 어셈블리를 기반으로 하며, 여러 데이터베이스(NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)로 주석이 달린 유니진 목록을 생성합니다.
● 유전자 발현 및 전사체 구조에 대한 종합적인 생물정보학 분석
서비스 장점
●폭넓은 전문 지식BMKGENE은 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 유형의 샘플 60만 개 이상을 처리한 실적을 바탕으로, 풍부한 경험을 모든 프로젝트에 제공합니다. 다양한 연구 분야에서 10만 건 이상의 mRNA-Seq 프로젝트를 성공적으로 완료했습니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구현합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
● 포괄적인 주석우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적 주석을 달고 해당 풍부도 분석을 수행하여 전사체 반응의 기저에 있는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공합니다.
●판매 후 지원저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 서비스 기간을 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| 폴리 A 강화 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10GB | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일: 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 300mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 450mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1g
● 절지동물:
곤충: 6g
갑각류: 300mg
● 전혈: 튜브 1개
● 세포: 106 세포
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
전사체 조립 및 유니진 선택
유니진 주석
샘플 상관관계 및 생물학적 반복 평가
차등 발현 유전자(DEGs)
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 주석
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 풍부도
BMKGene의 진핵세포 NGS mRNA 시퀀싱 서비스가 가져온 발전상을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Shen, F. et al. (2020) '아무르 메기(Silurus asotus) 생식선의 새로운 전사체 조립 및 성별 편향 유전자 발현', Genomics, 112(3), pp. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) '양파(Allium cepa L.)의 구근 팽창 및 발달 중 수크로스 대사의 전사체 분석', Frontiers in Plant Science, 7(9월), p. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'Sarcocheilichthys sinensis 전사체의 De novo 조립, 특성화 및 주석', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou, L. et al. (2021) 'De novo 전사체 분석은 염분 스트레스 하에서 Podocarpus macrophyllus의 염분 내성에 대한 통찰력을 제공합니다', BMC Plant Biology, 21(1), pp. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
