비참조 기반 mRNA 시퀀싱-NGS
특징
● 라이브러리 준비 전 폴리 mRNA 캡처
● 모든 참조 게놈과 무관: 전사본의 새로운 조립을 기반으로 여러 데이터베이스(NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)로 주석이 달린 단일 유전자 목록을 생성합니다.
● 유전자 발현 및 전사체 구조에 대한 포괄적인 생물정보학적 분석
서비스 장점
●광범위한 전문성: BMKGENE에서 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 샘플 유형에 걸쳐 60만 개 이상의 샘플을 처리한 경험을 바탕으로, 저희 팀은 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다. 다양한 연구 분야에서 10만 건 이상의 mRNA-Seq 프로젝트를 성공적으로 완료했습니다.
●엄격한 품질 관리: 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구현합니다. 이러한 꼼꼼한 모니터링을 통해 일관되게 고품질의 결과를 제공합니다.
● 포괄적인 주석: 우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적으로 주석을 달고 해당 풍부 분석을 수행하여 전사체 반응의 근간이 되는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공합니다.
●판매 후 지원: 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월의 A/S 기간을 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의에 대한 Q&A 세션을 제공합니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 추천 데이터 | 품질 관리 |
| 폴리 A가 풍부한 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10기가바이트 | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한적이거나 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일 : 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 300mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 450mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1g
● 절지동물:
곤충 : 6g
갑각류: 300mg
● 전혈: 1개의 튜브
● 세포: 106 세포
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리관 (주석 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹화+복제 예: A1, A2, A3; B1, B2, B3.
선적:
1. 드라이아이스: 샘플을 봉지에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
2. RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조하여 실온으로 배송할 수 있습니다.
서비스 워크플로
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 서비스
생물정보학
전사체 조립 및 단일 유전자 선택
유니진 주석
샘플 상관관계 및 생물학적 반복의 평가
차등 발현 유전자(DEG)
DEG의 기능적 주석
DEG의 기능적 강화
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 BMKGene의 진핵생물 NGS mRNA 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 발전을 살펴보세요.
Shen, F. et al. (2020) '아무르 메기(Silurus asotus)의 생식샘에서의 신규 전사체 조립 및 성 편향 유전자 발현', Genomics, 112(3), pp. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) '양파(Allium cepa L.)의 구근 부종 및 발달 중 자당 대사의 전사체 분석', Frontiers in Plant Science, 7(9월), p. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'Sarcocheilichthys sinensis 전사체에 대한 De novo 조립, 특성화 및 주석', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou, L. et al. (2021) '신규 전사체 분석은 염분 스트레스 하에서 Podocarpus macrophyllus의 내염성에 대한 통찰력을 제공합니다', BMC Plant Biology, 21(1), pp. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
