Pacbio 전체 길이 전사체

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing(Isoseq)은 전사체 이형체를 정확하게 식별하여 대체 폴리아데닐화 및 스플라이싱을 밝히고 보다 정확한 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome 파이프라인은 Circular Consensus Sequencing(CCS) 모드로 시퀀싱된 cDNA 라이브러리를 분석하고, 중복되지 않는 전사체로 클러스터링되는 Full-Length Non-Chimeric(FLNC) 서열을 식별하도록 설계되었습니다. 이후 BUSCO 분석을 통해 전사체 어셈블리의 완전성을 평가합니다. 어셈블된 전사체를 기반으로 대체 스플라이싱, 단순 반복 서열(SSR), lncRNA 및 해당 표적 유전자 예측, 신규 유전자 예측, 유전자 패밀리 분석, 전사 인자 분석, 전사체 기능 주석 등 다양한 분석을 수행합니다.