원핵생물 RNA 시퀀싱
특징
● RNA 샘플 처리 과정에는 rRNA 제거 후 방향성 RNA 라이브러리 준비가 포함되었습니다.
● 참조 게놈과의 정렬에 기반한 생물정보학 분석
● 분석에는 유전자 발현 및 차등 발현 유전자(DEGs)뿐만 아니라 전사체 구조 및 소형 RNA(sRNA) 분석도 포함됩니다.
서비스 장점
●엄격한 품질 관리우리는 시료 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구현합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●가닥 특이적 시퀀싱 데이터RNA 라이브러리 준비가 방향성을 가지므로 안티센스 전사체를 식별할 수 있기 때문입니다.
●원핵생물 전사체에 맞춘 완벽한 분석생물정보학 파이프라인은 유전자 발현 분석뿐만 아니라 오페론, UTR 및 프로모터 식별을 포함한 전사체 구조 분석도 포함합니다. 또한 sRNA 분석, 즉 주석 달기 및 2차 구조와 표적 예측도 포함합니다.
●판매 후 지원저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 서비스 기간을 제공하여 고객 만족을 최우선으로 생각합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| rRNA 결핍 방향성 라이브러리 | 일루미나 PE150 | 1-2GB | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | RIN≥6.5 |
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
샘플 배송
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학 분석 워크플로우
다음 분석 내용이 포함됩니다.
● 원시 데이터 품질 관리
● 참조 게놈과의 정렬
● 라이브러리 품질 평가: RNA 단편화 무작위성, 삽입 크기 및 시퀀싱 포화도
● 예측된 코딩 유전자의 기능적 주석
● 발현 분석: 상관관계 분석 및 주성분 분석(PCA)
● 차등 유전자 발현(DEGs)
● 차등 발현 유전자의 기능적 주석 및 풍부도 분석
● sRNA 분석: 예측, 주석, 표적 및 이차 구조 예측
● 전사체 구조 분석: 오페론, 시작 및 종료 위치, 비번역 영역(UTS), 프로모터, SNP/삽입/결실 분석
시퀀싱 포화
코딩 유전자의 기능적 주석
샘플 간의 상관관계
차등 발현 유전자(DEGs) 분석
기능적 풍부도 분석
sRNA 주석
본 특집 기사에서는 BMKGene의 나노포어 전장 mRNA 시퀀싱 서비스가 가능하게 한 발전 사항들을 살펴보세요.
Guan, CP 외 (2018) 'Sophorea alopecuroides의 총 알칼로이드에 반응하는 바이오필름 형성 Staphylococcus epidermidis의 글로벌 전사체 변화',폴란드 미생물학 저널, 67(2), p. 223. 도이: 10.21307/PJM-2018-024.
