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제품

원핵생물 RNA 서열분석

원핵생물 RNA 시퀀싱은 차세대 시퀀싱(NGS)을 사용하여 변화하는 세포 전사체를 분석하여 특정 순간에 RNA의 존재와 양을 밝혀냅니다.당사의 원핵생물 RNA 시퀀싱은 특히 참조 게놈을 가진 원핵생물을 대상으로 전사체 프로파일링, 유전자 구조 분석 등을 제공합니다. 이는 기초 과학 연구, 약물 연구 및 개발 등에 널리 적용되었습니다.

플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼


서비스 내용

서비스 사양

플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼, PE150

라이브러리 유형: 350bp 삽입 cDNA 라이브러리(피크 분포에 따라 다름)

시퀀싱 전략: 페어드 엔드 150bp

권장 데이터 양: 2Gb 원시 데이터/샘플

생물정보학

(1) 시퀀싱 데이터 품질 관리: 뉴클레오티드 분포, 기본 품질 분포, rRNA 비율 평가;

(2) 서열 정렬 분석: 정렬 결과 통계, 서열화 포화도, 서열화 범위;

(3) 참조 게놈 주석(NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) 발현 분석: 발현 분포(2개 이상의 샘플 포함), 샘플 간 발현 분석(Venn 분석, 상관 분석, PCA 분석);

(5) 차등 발현 분석(2개 이상의 샘플 사용);

(6) 유전자 세트 분석: Venn 분석, 클러스터 분석, 기능 주석 분석(COG, GO, KEGG), 기능 강화 분석(GO, KEGG), 기능 강화 화음 그래프, Ipath 분석;

(7) sRNA 분석: sRNA 예측, sRNA 주석(Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA 2차 구조 예측, sRNA 표적 유전자 예측;

(8) 전사체 구조 분석: 오페론 분석, 전사 시작 및 종료 부위 예측, UTR 주석 및 분석, 프로모터 서열 예측, SNP/InDel 분석(SNP/InDel 주석, SNP/InDel 지역 분포, SNP 통계).

서비스 작업 흐름

샘플 배송

샘플 배송

도서관 준비

도서관 건립

시퀀싱

시퀀싱

데이터 분석

데이터 분석

판매 서비스 후

판매 후 서비스


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