프로테오믹스
특징
●정성 단백질 분석: LC-MS/MS를 사용하여 복잡한 시료(SDS-PAGE 젤 스트립, 면역침전, 공동면역침전, 풀다운)의 단백질 구성을 식별합니다. 장점: 시료 수 제한 없음, 빠른 검출, 간단한 시료 처리, 높은 처리량, 저농도 단백질 검출 가능.
● 라벨 없는 정량 단백질 분석: 개별 샘플 검출이 가능한 비표지 기술. 질량 분석 데이터에서 펩타이드 신호 강도를 비교하여 단백질을 정량화합니다. 장점: 간단한 조작, 높은 처리량(샘플 수 제한 없음), 폭넓은 적용 가능성(종간 "존재/부재" 단백질 차이 비교에 적합).
● DIA 정량 단백질 분석: 데이터 독립적 획득(DIA) 모드를 채택하여 분할된 창에서 모든 이온을 스캔함으로써 완전한 이온 정보를 획득합니다. 장점: DDA 모드(TMT/라벨 프리)보다 재현성이 우수하고 단백질 커버리지가 높으며 정량 분석 정확도가 높아 대규모 샘플 연구에 적합합니다.
● 4D-라벨 프리 정량 단백질 분석/4D-DIA 정량 단백질 분석: Bruker timsTOF 질량 분석기를 기반으로 기존 3D 분리에 이온 이동도(충돌 단면적)를 추가한 분석법입니다. 장점: 이온 활용도 및 정확도 향상, 분석 범위, 감도 및 처리량의 전반적인 개선, 기존 3D 방식보다 높은 단백질 식별 깊이를 제공합니다.
● Astral 라벨 프리 정량 단백질 분석/Astral DIA 정량 단백질 분석: Orbitrap™ Astral™ 고해상도 질량 분석기를 기반으로 합니다. 장점: 높은 처리량(8분 그라디언트 사용 시 하루 100개 이상의 샘플), 더 넓은 범위의 분석(8분 만에 Hela 세포에서 8,000개 이상의 단백질 검출), 더 높은 감도(더 적은 샘플 필요).
● TMT 정량 단백질 분석: 18개의 동위원소 표지자를 사용하여 펩타이드를 표지하고 18개의 샘플을 동시에 검출합니다. 장점: 높은 안정성(기기 안정성 간섭 최소화, 시스템 오류 최소화) 및 높은 감도(분획화를 통해 샘플 복잡성을 줄여 저농도 단백질 검출 향상).
● PRM 표적 단백질체학: 표적 단백질/펩타이드를 선택적으로 검출하는 고해상도 표적 기술. 장점: 상대적/절대적 정량화 및 정량 단백질체학 결과 검증이 가능하며, 항체 제한이 없고 웨스턴 블롯 및 ELISA보다 적용 범위가 넓습니다.
장점
● 첨단 장비: 기존 단백질체학 플랫폼과 첨단 고심도 질량 분석기(예: 4D, Astral)를 모두 갖추고 있습니다.
● 안정적인 검출: 엄격한 품질 관리 시스템을 통해 일관되고 안정적인 테스트 프로세스를 보장합니다.
● 신뢰할 수 있는 결과: 동시 정성 및 정량 분석을 통해 각 그룹에 대한 상대적 발현량, 분자량, 풍부도 및 기타 주요 데이터를 제공합니다.
● 높은 자동화 수준: 자동화된 LC-MS 시스템은 빠른 분석과 뛰어난 분리 성능을 제공합니다.
서비스 사양
| 비표적 단백질체학 기법 비교 | ||||
| 라벨 없음 | DIA | 티무트 | ||
| 라벨링 | NO | NO | 예 | |
| 데이터 스캔 모드 | 디다 | 디다 | DIA | 디다 |
| 재현성 | 낮추다 | 높은 | 높은 | |
| 감광도 | 낮추다 | 높은 | 높은 | |
| 멀티플렉싱 | NO | 예 | NO | 예 |
| 애플리케이션 | 단백질 존재/부재 비교 | 대규모 샘플 | 서로 다른 배치 샘플 분석 | 차등 단백질 발현 비교 같은 종 및 조직에서 |
| 정확성 | ★ | ★★(4D/아스트랄 DlA ★★★) | ★★ | |
| 탐지 횟수 | ★ | ★★(4D/아스트랄 D|A★★★) | ★★ | |
샘플 요구 사항
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서비스 워크플로우
샘플 수집
단백질 추출
효소 소화
분리
데이터 수집
데이터 분석
데이터 전송
정성적 단백질체학
1. 단백질 용액/겔: 정성적 결과표
2. 데이터베이스 검색 결과
2.1 데이터베이스 검색에서 일치하는 펩타이드 세그먼트 목록
2.2 데이터베이스 검색에서 일치하는 단백질 목록
2.3 데이터베이스 검색에서 일치하는 변형 목록 (인산화, 유비퀴틴화 등)
3. 원시 데이터
정량적 단백질체학(라벨 프리/DIA/TMT)
1. 데이터 전처리
1.1 단백질 데이터베이스 검색
2. 단백질 발현 분석
2.1 주성분 분석(PCA)
2.2 상대 표준 편차(RSD)
2.3 K-평균 추세 분포
2.4 재현성 평가
2.5 단백질 발현 히트맵
3. 기능 주석
3.1 GO 기능 주석
3.2 KEGG 기능 주석
3.3 COG 기능 주석
3.4 GOslim 기능 주석
3.5 Pfam 단백질 구조 도메인 주석
4. 단백질 차등 분석 (생물학적 반복 실험 3회 이상)
4.1 단백질 차등 분석 결과
4.2 단백질 발현량 변화(FC) 분포
4.3 단백질량 차이에 대한 통계적 분석
4.4 차등 단백질 화산 플롯
4.5 차등 단백질 클러스터링 히트맵
4.6 단백질 GO 기능 주석 및 풍부도 분석
4.7 차등 단백질 KEGG 기능 주석 및 풍부도 분석
4.8 차별적 단백질 COG 기능 주석
4.9 차등 단백질 GOslim 주석 및 풍부도 분석
4.10 단백질 구조 도메인 주석 및 풍부도 분석
5. 단백질 네트워크 상호작용 분석
6. 단백질 리액톰 경로 주석
7. 신호 펩타이드 예측
8. 단백질의 세포 내 위치
정량적 단백질체학(PRM)
1. PRM 단백질 정량 결과
1.1 정량 분석 결과 개요
1.2 펩타이드 조각에 대한 단편 이온 피크 면적 분포
정량적 단백질체학
1.단백질 발현 분석
↑주성분 분석(PCA)↑상대 표준 편차(RSD)
↑K-평균 추세 분포 ↑상관관계A분석P단백질E표현L이블스
↑ 단백질 발현 히트맵
2. 기능 주석
↑GO 기능 주석↑KEGG 기능 주석
↑ COG 기능 주석 ↑ GOslim 기능 주석
↑ Pfam 단백질 구조 도메인 주석
3.단백질 네트워크 상호작용 분석
↑ 단백질 네트워크 상호작용 분석
4.신호 펩타이드 예측
↑ 신호 펩타이드 예측
5. 단백질의 세포 내 위치
↑단백질의 세포 내 위치
| 2025 | 중간엽 줄기세포에서 유래한 세포사멸 소포가 과민반응을 완화시킨다 칼슘 과부하 및 미토콘드리아 기능 장애를 통한 CD8+ T 세포 사멸 유도 | 첨단 과학 |
| 2024 | 통합 다중 오믹스 분석을 통해 향상된 항종양 효능을 입증했습니다. | 중개 종양학 |
| 2024 | 다중 오믹스 분석을 통해 대사 경로의 고유한 특징이 밝혀졌습니다. 대형 호박의 과일 크기와 색상 변화 | 국제 분자 과학 저널 |
| 2024 | 전사체 및 대사체 프로파일링을 통해 사용하지 않아 발생하는 근육 위축에 대한 새로운 통찰력을 얻을 수 있습니다. 닭고기에서 속근 섬유의 잠재적 역할 | 국제 분자 과학 저널 |
| 2023 | 다중 오믹스 분석을 통해 테트라사이클린이 라이그래스 뿌리 생장에 미치는 영향을 밝혀냈다. | 유해물질 저널 |
