단일핵 RNA 서열 분석

단일 세포 포획 및 높은 처리량 시퀀싱과 결합된 개별 라이브러리 구축 기술의 발전으로 세포별 유전자 발현 연구가 가능해졌습니다.이를 통해 복잡한 세포 집단에 대한 더 깊고 완전한 시스템 분석이 가능하며, 모든 세포의 평균을 취하여 이질성이 가려지는 것을 대부분 방지합니다.

그러나 일부 세포는 단세포 현탁액으로 만들기에 적합하지 않으므로 다른 시료 준비 방법, 즉 조직에서 핵 추출이 필요합니다. 세포 시퀀싱.

BMK는 10× Genomics ChromiumTM 기반 단일 세포 RNA 시퀀싱 서비스를 제공합니다.본 서비스는 면역세포 분화, 종양 이질성, 조직 발달 등 질병 관련 연구에 널리 활용되어 왔습니다.

공간 전사체 칩: 10× Genomics

플랫폼: Illumina NovaSeq 플랫폼

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서비스 내용

생물정보학

데모 결과

기술원리

핵 분리는 이중 교차가 있는 8채널 미세유체 시스템으로 구성된 10× Genomics ChromiumTM을 통해 이루어집니다.이 시스템에서는 바코드와 프라이머, 효소 및 단일 핵이 포함된 젤 비드가 나노리터 크기의 오일 방울에 캡슐화되어 GEM(Gel Bead-in-Emulsion)을 생성합니다.GEM이 형성되면 각 GEM에서 세포 용해 및 바코드 방출이 수행됩니다.mRNA는 10× 바코드와 UMI를 사용하여 cDNA 분자로 역전사되며, 이는 표준 시퀀싱 라이브러리 구성의 대상이 됩니다.

단일 세포 현탁액 제조에 적합하지 않은 조직

세포/조직	이유
신선하지 않은 냉동 조직	새로운 조직이나 오랫동안 저장된 조직을 가져올 수 없습니다.
근육세포, 거핵세포, 지방…	셀 직경이 너무 커서 기기에 들어갈 수 없습니다.
간…	부서지기에는 너무 약해서 단일 세포를 구별할 수 없습니다.
뉴런 세포, 뇌…	더 민감하고 스트레스를 받기 쉬우며 시퀀싱 결과가 변경됩니다.
췌장, 갑상선…	내인성 효소가 풍부하여 단세포 현탁액 생산에 영향을 미침

단일 핵과 단일 세포

단일핵	단세포
무제한 셀 직경	세포 직경: 10-40μm
재료는 냉동 조직일 수 있습니다.	재료는 신선한 조직이어야 합니다.
냉동 세포의 낮은 스트레스	효소 처리는 세포 스트레스 반응을 일으킬 수 있습니다
적혈구를 제거할 필요가 없습니다.	적혈구를 제거해야 합니다.
핵은 생물정보를 표현한다	전체 세포는 생물 정보를 표현합니다