소형 RNA 시퀀싱 - 일루미나
특징
● 크기 선택 라이브러리 준비.
● miRNA 예측 및 표적을 중심으로 한 생물정보학 분석.
서비스 장점
●폭넓은 전문 지식저희는 다양한 유형의 샘플을 포함하여 300개 이상의 샘플을 처리해 왔습니다. 모든 프로젝트에 풍부한 전문 지식을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 준비부터 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●종합적인 생물정보학 분석:이 도구는 알려진 miRNA와 새로운 miRNA 모두를 식별하고, miRNA 표적을 식별하며, 다양한 데이터베이스(KEGG, GO)를 사용하여 해당 기능에 대한 주석 및 풍부도 분석을 수행할 수 있도록 합니다.
●판매 후 지원저희는 고객과의 지속적인 소통이 얼마나 중요한지 잘 알고 있습니다. daarom 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 플랫폼 | 권장 데이터 | 데이터 QC |
| 선택한 사이즈 | 일루미나 SE50 | 1000만~2000만 조회수 | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일: 1.2g
● 동물:
심장 또는 장: 450mg
내장 또는 뇌: 240mg
근육: 600mg
뼈, 머리카락 또는 피부: 1.5g
● 절지동물:
곤충: 9g
갑각류: 450mg
● 전혈튜브 2개
● 세포: 106 세포
● 혈청 및 혈장:6mL
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
● 원시 데이터 품질 관리
● 소형 RNA 분류
● miRNA 발현 및 차등 발현 분석
● miRNA 표적 유전자 및 차등 발현 miRNA 표적 유전자 주석
● 표적 유전자 주석 및 차등 발현 miRNA 유전자 기능 풍부도 분석
miRNA 식별: 구조 및 심층 분석
miRNA의 차등 발현 – 계층적 클러스터링
차등 발현 miRNA의 표적에 대한 기능적 주석
BMKGene의 sRNA 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 연구 발전을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Chen, H. et al. (2023) '바이러스 감염은 삼칠의 사포닌 생합성 및 광합성을 억제한다',식물 생리학 및 생화학, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) '식물 FYVE 도메인 함유 단백질 FREE1은 마이크로프로세서 구성 요소와 연관되어 miRNA 생합성을 억제합니다',EMBO 보고서, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) '꿀벌(Apis mellifera)에서 다중 상피 성장 인자 유사 도메인 8 유전자(megf8)를 표적으로 하는 마이크로RNA Ame-Bantam-3p는 유충 번데기 발달을 제어합니다',국제 분자 과학 저널, 24(6), p. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) '육질과 관련된 miRNA 및 유전자의 통합 분석을 통해 Gga-MiR-140-5p가 닭의 근육 내 지방 축적에 영향을 미친다는 사실이 밝혀졌다',세포 생리학 및 생화학, 46(6), pp. 2421–2433. 도이: 10.1159/000489649.
