기간 한정 프로모션: 올인원 T2T 게놈 어셈블리 솔루션
유전체 시퀀싱 기술과 어셈블리 알고리즘의 급속한 발전으로 텔로미어-투-텔로미어(T2T) 유전체 어셈블리는 고품질 유전체 연구의 표준으로 자리 잡았으며, 기존 유전체 어셈블리의 오랜 난제였던 갭 문제(텔로미어와 센트로미어처럼 반복 서열과 GC 함량이 높은 영역은 성공적으로 어셈블리하기 위해 매우 긴 시퀀싱 데이터가 필요함)를 해결했습니다. 학술 연구에서 T2T 기술의 보급을 촉진하고, 더욱 완전한 유전체 서열을 확보하며, 이전에 알려지지 않았던 유전자와 구조적 변이를 발견할 수 있도록, 본 프로모션을 통해 연구 대상 종에 맞는 비용 효율적인 원스톱 T2T 유전체 어셈블리 솔루션을 제공하여 연구에 필요한 완벽하고 정확한 참조 데이터를 확보할 수 있도록 지원합니다.
서비스 패키지 세부 정보
●시퀀싱
● Illumina 설문조사용 짧은 읽기 횟수: 50배
● PacBio HiFi 초안 조립 읽기 횟수: 50회
● 비계용 Hi-C: 100X
● 나노포어 초장거리 판독을 통한 갭 필링: 2개 셀
● 일루미나 mRNA-seq를 이용한 게놈 주석: 12Gb/1풀
●계층적 분석
● 유전체 특징 평가를 위한 설문조사
● 컨티그 수준 게놈 어셈블리
● 염색체 수준 게놈을 위한 스캐폴딩
● T2T 게놈의 갭 메우기 및 텔로미어 식별
● T2T 게놈 품질 평가
● 유전자 및 유전체 요소 예측을 위한 게놈 주석
● 전문적인 기술 해석이 포함된 종합 분석 보고서
데모 결과
T2T 게놈 어셈블리 서비스의 품질을 더 잘 이해하실 수 있도록 일반적인 프로젝트의 데모 결과를 제공합니다.
•최종 T2T 게놈은 총 길이 491.39Mb, 컨티그 N50 값 26.04Mb의 19개 염색체로 구성됩니다. 총 38개의 텔로미어와 19개의 센트로미어가 확인되었습니다. 19개의 염색체는 텔로미어 간 간격이 없는 염색체입니다.
•어셈블리 평가 결과는 조립된 게놈의 높은 완전성과 정확도를 보여줍니다. OrthoDB 10의 배아식물 데이터베이스를 사용한 BUSCO 평가에서 게놈 완전성은 97.09%로 나타났으며, 게놈 QV 값은 52.36, 게놈 LAI 값은 18.93입니다.
적용 가능성
•적용 가능한 연구 분야기초 유전체 연구, 작물 유전적 개량, 동물 육종 등 고품질 유전체 조립이 필요한 모든 식물 및 동물 분야.
•적용 가능한 종게놈 크기 ≤ 1; 포유류, 일반 작물, 흔한 과일과 멜론, 흔한 산림 수목, 담수어 등. 기타 종에 대해서는 자세한 내용을 참조하십시오.
•프로모션 적용 기간: 6월 30일까지 계약 체결 시.
•추가 지침특수 샘플(예: 반복 서열이 많거나 DNA 품질이 낮은 샘플) 또는 맞춤형 분석이 필요한 경우, 당사 기술팀에서 실제 프로젝트 요구 사항에 따라 가격을 조정하여 맞춤형 솔루션을 제공해 드립니다.
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