전체 게놈 바이설파이트 시퀀싱(WGBS)
이 기술은 DNA를 아황산염 처리하여 메틸화되지 않은 시토신을 우라실로(C에서 U로) 변환시키면서 메틸화된 시토신은 그대로 유지하는 방식으로, 유전자 발현과 세포 활동의 핵심 조절자인 시토신 5번째 위치(5-mC)의 메틸화를 심층적으로 연구하는 데 있어 표준적인 방법론으로 자리매김하고 있습니다.
이 기술은 단일 염기 해상도를 제공하여 연구자들이 메틸롬을 종합적으로 조사하고 샘플 내의 비정상적인 메틸화 패턴을 밝혀낼 수 있도록 합니다. WGBS를 활용함으로써 과학자들은 게놈 전체의 메틸화 양상에 대한 탁월한 통찰력을 얻을 수 있으며, 이를 통해 다양한 생물학적 과정과 질병의 기저에 있는 후성유전학적 메커니즘을 더욱 심층적으로 이해할 수 있습니다.
서비스 특징
● Illumina NovaSeq를 이용한 시퀀싱.
● 참조 게놈이 필요합니다.
● 아황산염 전환 효율을 모니터링하기 위해 람다 DNA를 첨가합니다.
서비스 장점
●DNA 메틸화 연구의 금 표준이 성숙한 기술은 정확도가 높고 재현성이 뛰어납니다.
●넓은 커버리지와 단일 기지 해상도:메틸화 부위 검출은 게놈 전체 수준에서 이루어집니다.
●완벽한 플랫폼:저희는 시료 처리, 라이브러리 구축, 시퀀싱부터 생물정보학 분석까지 원스톱 서비스를 제공합니다.
●폭넓은 전문 지식BMKGENE은 다양한 종에 걸쳐 폭넓은 프로젝트를 성공적으로 완료해 왔습니다. 10년 이상의 경험, 뛰어난 분석팀, 포괄적인 콘텐츠, 그리고 탁월한 사후 지원을 제공합니다.
●전사체 분석과의 결합 가능성WGBS를 RNA-seq와 같은 다른 오믹스 데이터와 통합 분석할 수 있도록 합니다.
샘플 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장 데이터 출력 | 품질 관리 |
| 아황산염 처리됨 | 일루미나 PE150 | 30배 깊이 | Q30 ≥ 85% 아황산염 전환율 > 99% |
샘플 요구 사항
| 농도(ng/µL) | 총량(ng) | 추가 요구 사항 | |
| 게놈 DNA | ≥ 1.25 | ≥ 100 | 제한적인 분해 또는 오염 |
서비스 워크플로우
샘플 배송
DNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
데이터 전송
이 서비스에는 다음과 같은 분석이 포함됩니다.
● 원시 시퀀싱 품질 관리;
● 참조 게놈에 대한 매핑;
● 5mC 메틸화 염기 검출;
● 메틸화 분포 및 주석 분석;
● 차등 메틸화 영역(DMR) 분석;
● DMR과 관련된 유전자의 기능적 주석.
5mC 메틸화 검출: 메틸화 부위 유형
메틸화 지도. 5mC 메틸화의 게놈 전체 분포
고도로 메틸화된 영역의 주석
차등 메틸화 영역: 관련 유전자
차등 메틸화 영역: 관련 유전자 주석(유전자 온톨로지)
BMKGene의 전체 게놈 바이설파이트 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 연구 발전을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Fan, Y. et al. (2020) '전체 게놈 비설파이트 시퀀싱을 이용한 양 골격근 발달 중 DNA 메틸화 프로파일 분석',BMC Genomics, 21(1), 1~15페이지. 도이: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) '염화비닐에 노출된 작업자에서 나타나는 새로운 데옥시리보핵산 메틸화 교란',독성학 및 산업 보건, 38(7), pp. 377–388. 도이: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) '숙성 중인 토마토 열매의 게놈 메틸화, 비코딩 RNA, mRNA 및 대사산물 수준 간의 관계'식물 저널, 103(3), 980-994페이지. 도이: 10.1111/TPJ.14778.
