전체 전사체 시퀀싱 – 일루미나
특징
● 전체 전사체를 시퀀싱하기 위한 이중 라이브러리 생성: rRNA 제거 라이브러리 및 소형 RNA 라이브러리 준비.
● mRNA, lncRNA, circRNA 및 miRNA에 대한 종합적인 생물정보학 분석을 개별 생물정보학 보고서에 제공하며, 모든 RNA 발현을 종합적으로 분석한 내용과 ceRNA 네트워크 분석도 포함합니다.
서비스 장점
●폭넓은 전문 지식저희는 다양한 샘플 유형을 아우르는 2,100건 이상의 전체 전사체 분석 프로젝트를 수행해 왔습니다. 모든 프로젝트에 풍부한 전문 지식을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 준비부터 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●종합 주석저희는 여러 데이터베이스를 활용하여 차등 발현 유전자(DEG)의 기능을 분석하고, 이에 상응하는 유전자 발현량 분석을 수행합니다. 이러한 포괄적인 접근 방식을 통해 전사체 반응의 기저에 있는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며, 실험 데이터에 대한 모든 정보를 확보할 수 있도록 지원합니다.
●규제 네트워크에 대한 심층 분석ceRNA 네트워크 분석은 mRNA, lncRNA, circRNA 및 miRNA의 공동 시퀀싱과 포괄적인 생물정보학 워크플로우를 통해 가능해집니다.
●판매 후 지원저희는 고객과의 지속적인 소통이 얼마나 중요한지 잘 알고 있습니다. daarom 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| rRNA가 고갈됨 | 일루미나 PE150 | 16GB | Q30≥85% |
| 선택한 사이즈 | 일루미나 SE50 | 1000만~2000만 조회수 |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3).
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
서비스 워크플로우
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
각각의 RNA에 대한 분석 외에도, 4가지 유형의 RNA를 모두 종합하여 공동 분석을 진행합니다.
- 모든 종류의 RNA 데이터 간의 공동 발현 분석
- RNA 발현 개요
- 미분 표현 개요
- CeRNA 네트워크
- 해당 경로에 통합된 핵심 유전자
- 보존 분석
- 타겟팅 관계
RNA 발현 개요
차등 발현 유전자
ceRNA 분석
차등 발현 miRNA 및 관련 RNA
BMKGene의 전체 전사체 시퀀싱 서비스를 통해 이루어진 연구 발전을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Dai, Y. et al. (2022) 'RNA 시퀀싱을 통해 확인된 카신-벡병의 mRNA, lncRNA 및 miRNA의 종합적인 발현 프로파일'분자 오믹스, 18(2), pp. 154–166. 도이: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan 외 (2022) '창바이산에서 월동 기간 동안 Apis cerana의 내한성에 대한 전체 길이 전사체 분석',유전자, 830, pp. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ 외 (2022) '소세포폐암에서 경쟁하는 내인성 RNA 조절 네트워크의 다중 오믹스 통합 기반 우선순위 지정: 분자적 특성 및 약물 후보',종양학의 최전선, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) '땅콩 뿌리혹선충에 대한 반응의 잠재적 메커니즘에 대한 새로운 통찰력을 보여주는 lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA 발현 프로파일의 통합 분석'BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al. (2022) '전체 전사체 RNA 시퀀싱을 통해 적색 LED 조사에 의한 브로콜리의 수확 후 품질 유지와 관련된 분자 메커니즘을 밝혀냄'수확 후 생물학 및 기술, 188, p. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
