전체 전사체 시퀀싱 – Illumina
특징
● 전체 전사체 시퀀싱을 위한 이중 라이브러리: rRNA 고갈 후 PE150 라이브러리 준비 및 크기 선택 후 SE50 라이브러리 준비
● 별도의 생물정보학 보고서에서 mRNA, lncRNA, circRNA 및 miRNA에 대한 완전한 생물정보학 분석
● ceRNA 네트워크 분석을 포함하여 결합 보고서의 모든 RNA 발현에 대한 공동 분석.
서비스 장점
●규제 네트워크에 대한 심층 분석: ceRNA 네트워크 분석은 mRNA, lncRNA, circRNA 및 miRNA의 공동 시퀀싱과 철저한 생물정보학 워크플로우를 통해 가능합니다.
●포괄적인 주석: 우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적으로 주석을 달고 해당 농축 분석을 수행하여 전사체 반응의 기본이 되는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공합니다.
●광범위한 전문성: 다양한 연구 영역에서 2000개 이상의 전체 전사체 프로젝트를 성공적으로 마무리한 실적을 통해 우리 팀은 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리: 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 제어 지점을 구현합니다.이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 고품질 결과를 제공할 수 있습니다.
● 포괄적인 주석: 우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적으로 주석을 달고 해당 농축 분석을 수행하여 전사체 반응의 기본이 되는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공합니다.
●판매 후 지원: 당사의 약속은 프로젝트 완료 이후 3개월의 판매 후 서비스 기간까지 연장됩니다.이 기간 동안 우리는 결과와 관련된 모든 질문을 해결하기 위해 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q&A 세션을 제공합니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 | 품질 관리 |
| rRNA 고갈 | 일루미나 PE150 | 16 기가 바이트 | Q30≥85% |
| 선택한 사이즈 | 일루미나 SE50 | 1,000만~2,000만 건의 읽기 |
샘플 요구사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물: RIN≥6.5 동물: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
권장 샘플 배송
컨테이너:
2ml 원심분리 튜브(Tin Foil은 권장되지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3);B1, B2, B3... ...
선적:
1.드라이아이스: 샘플을 가방에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
2.RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
RNA 발현 개요
차별적으로 발현되는 유전자
ceRNA 분석
차별적으로 발현되는 miRNA 및 관련 RNA
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 BMKgene의 전체 전사체 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 연구 발전을 살펴보세요.
Dai, Y. et al.(2022) 'RNA 시퀀싱으로 확인된 Kashin-Beck 질병의 mRNA, lncRNA 및 miRNA의 포괄적인 발현 프로필', Molecular Omics, 18(2), pp. 154–166.도이: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N.nanet al.(2022) '겨울철 장백산 Apis cerana의 내한성에 대한 전체 길이 전사체 분석.', Gene, 830, pp. 146503–146503.도이: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
왕(Wang), XJ 외.(2022) '소세포폐암에서 경쟁하는 내인성 RNA 조절 네트워크의 다중 오믹스 통합 기반 우선순위 지정: 분자 특성 및 약물 후보', 종양학의 개척지, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA 발현 프로파일의 통합 분석은 땅콩의 뿌리혹 선충에 반응하는 잠재적 메커니즘에 대한 새로운 통찰력을 보여줍니다', BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al.(2022) '전체 전사체 RNA 시퀀싱은 적색 LED 조사에 의한 브로콜리의 수확 후 품질 유지와 관련된 분자 메커니즘을 강조합니다', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
