16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Taybetmendiyên Xizmetê
● Platforma rêzkirinê: Illumina NovaSeq.
● Zêdekirina herêmên kurt ên 16S, 18S û ITS, di nav armancên din ên zêdekirinê de.
● Hilbijartinên nerm ên amplîkonê.
● Ezmûna projeyên berê bi gelek hedefên amplîfîkasyonê re.
Avantajên Xizmetê
●Bê tecrîd:Nasîna bilez a pêkhateya mîkrobî di nimûneyên jîngehê de.
●Çareseriya BilindDi pêkhateyên kêm-zêde di nimûneyên jîngehê de.
●Bi awayekî berfireh tê sepandinLêkolînên cihêreng ên li ser civaka mîkrobî.
●Analîza Biyoenformatîkî ya BerfirehPakêta herî dawî ya QIIME2 (têgihîştina hejmarî ya ekolojiya mîkrobî) bi analîzên cihêreng di warê databasa, şîrovekirin, OTU/ASV de.
●Pisporiya BerfirehBMKGENE bi 150 hezar projeyên rêzkirina amplîkonan ku salane têne lidarxistin, zêdetirî deh sal ezmûn, tîmek analîzê ya pir jêhatî, naveroka berfireh û piştgiriya piştî firotanê ya hêja tîne.
Taybetmendiyên Xizmetê
| Pirtûkxane | Stratejiya Rêzkirinê | Daneyên pêşniyarkirî |
| Amplîkon | Illumina PE250 | 50/100/300K tag (Cotên Xwendinê) |
Pêdiviyên Xizmetê
| Têkelbûn (ng/µL) | Tevahî mîqdar (ng) | Qebare (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Ax/çilmisî: 1-2g
● Naveroka rûvî-ajalan: 0.5-2g
● Naveroka rûvî-kêzik: 0.1-0.25g
● Rûyê nebatan (sedîmenta dewlemendkirî): 0.1-0.5g
● Sedîmenta dewlemendkirî ya bi ava fermentasyonê): 0.1-0.5g
● Feq (ajalên mezin): 0.5-2g
● Feq (mişk): 3-5 den
● Şileya şuştina alveolar a pişikê: kaxiza parzûnê
● Şopa vajînal: 5-6 şop
● Paşgira çerm/zayendî/tuf/tevnên nerm ên devkî/paşgira qirikê/paşgira rektûmê: 2-3 paşgir
● Mîkroorganîzmayên rûberî: kaxiza parzûnê
● Av/hewa/biyofîlm: kaxiza parzûnê
● Endofît: 1-2g
● Plaka Diranan: 0.5-1g
Herikîna Karê Xizmetê
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Analîza jêrîn vedihewîne:
- Kontrolkirina kalîteya daneyên xav
- Komkirina OTU /De-deng (ASV)
- Têbînîkirina OTU
- Analîza cihêrengiya alfa: gelek endeks, di nav de Shannon, Simpson û ACE.
- Analîza cihêrengiya betayê
- Analîza navbera koman
- Analîza têkiliyê: di navbera faktorên hawîrdorê û pêkhate û cihêrengiya OUT de
- Pêşbîniya gena fonksiyonel a 16S
Hîstograma belavbûna taksonomîk
nexşeya germê ya komkirina pirbûna taksonomîk
Analîza cihêrengiya alfa: xêza kêmbûnê
analîza cihêrengiya beta: NMDS
Analîza nav-komî: Vedîtina nîşankerên biyolojîk ên LEFSE
Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzkirina amplîkonên BMKGene ve bi Illumina re têne hêsankirin, vekolin.
Dong, C. û yên din. (2022) 'Civandin, Mîkrobiotaya Bingehîn, û Fonksiyona Mîkrobiotaya Ax û Qalikê Rîzosferê di Eucommia ulmoides de', Frontiers in Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. û yên din. (2023) 'Veguheztina konsorsiyûmên bakterî yên sentetîk ji bo dermankirina vaginoza bakterî ya ji ber Gardnerella vaginalis di mişkan de', Microbiome, 11(1), pp. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. û Liu, H. (2022) 'Mîkrobiomên toza hewayê ya ku di dema ceribandina piştgiriya jiyanê ya biyorejenerasyonê ya girtî ya li ser erdê "Lunar Palace 365" de hatiye berhevkirin', Mîkrobiomên Jîngehê, 17(1), r. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. û yên din. (2022) 'Pirbûna genên fonksiyonel ên girêdayî madeya xav a têkildarî veguherîna nîtrojenê windabûna nîtrojenê di kompostkirinê de kontrol dike', Bioresource Technology, 361, r. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
