-
PacBio-Transkriptoma tevahî dirêj (ne-referans)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) di analîza projeya cihêrengiya mîkrobial de bi ezmûnek salan ve hatî pêşve xistin, ku analîza bingehîn a standardkirî û analîza kesane vedihewîne: analîza bingehîn naveroka analîza sereke ya lêkolîna mîkrobîkî ya heyî vedigire, naveroka analîzê dewlemend û berfireh e, û encamên analîzê di forma raporên projeyê de têne pêşkêş kirin;Naveroka analîzên kesane cihêreng e.Nimûne dikarin bêne hilbijartin û pîvan dikarin li gorî rapora analîza bingehîn û mebesta lêkolînê bi nermî werin danîn, da ku daxwazên kesane bicîh bînin.Pergala xebitandinê ya Windows-ê, hêsan û bilez.
-
PacBio-Transkriptoma tevahî dirêj (ne-referans)
Daneyên rêzgirtina îsoformên Pacific Biosciences (PacBio) wekî têketinê digire, ev App dikare rêzikên transkriptê yên tev-dirêj (bêyî kombûnê) nas bike.Bi xêzkirina rêzikên tev-dirêj li dijî genoma referansê, transkrîpt dikare ji hêla genên naskirî, transkrîpt, herêmên kodkirinê, hwd ve were xweşbîn kirin.Analîza hevpar a bi daneya rêzgirtina transkriptomeya NGS re di asta transkriptê de şîrovekirina berfirehtir û pîvandina rasttir di derbirînê de dike, ku bi piranî sûd werdigire îfadeya cihêreng a jêrîn û analîza fonksiyonel.
-
Toolkits
BMKCloud platformek biyoinformatîk a pêşeng e ku ji bo bernameyên genomîk çareseriya yek-stop peyda dike, ku bi berfirehî ji hêla lêkolîneran ve di warên cihêreng de di nav de bijîjkî, çandinî, jîngeh, hwd. pê bawer e. , çavkaniyên komputerê, databasa giştî, qursên serhêl ên biyoinformatîk, hwd. BMKCloud xwedan amûrên biyoinformatîk ên cihêreng ên ku pir caran têne bikar anîn hene ku di nav wan de annotasyona genê, amûrên genetîk ên pêşkeftî, ncRNA, kontrolkirina kalîteya daneyê, kombûn, berhevkirin, derxistina daneyan, mutasyon, statîstîk, hilberînerê jimaran, rêzik. analîz û hwd.
-
RNA biçûk
ARN-yên piçûk celebek ARN-ya kurt a ne-kodkirî ne ku dirêjahiya navînî 18-30 nt e, di nav de miRNA, siRNA û piRNA.Van RNAyên piçûk bi girseyî hatine ragihandin ku di pêvajoyên biyolojîkî yên cihêreng ên wekî hilweşandina mRNA, astengkirina wergerandinê, çêbûna heterokromatin, hwd. Platforma analîzê ya rêzikan ji analîza standard û derxistina daneya pêşkeftî pêk tê.Li ser bingeha daneyên RNA-seq, analîza standard dikare nasname û pêşbîniya miRNA, pêşbîniya genê hedefa miRNA, şirovekirin û analîza derbirînê bi dest bixe.Analîzek pêşkeftî lêgerîn û derxistina miRNA-ya xwerû, hilberîna diagrama Venn, miRNA û avakirina tora genê armanc dike.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS platformek analîzê ya ji nû ve rêzgirtina genomê ye, ku li ser bingeha ezmûna dewlemend a di Biomarker Technologies de hatî pêşve xistin.Vê platforma hêsan a-karanîna bi hêsanî bi danîna çend parametreyên bingehîn, ku ji bo daneyên rêzkirina DNA-yê ku hem ji platforma Illumina û hem jî ji platforma rêzgirtina BGI-yê hatî hilberandin, veguhezîne bilez a xebata analîzek yekbûyî dihêle.Vê platformê li ser servera hesabkeriya performansa bilind tête bicîh kirin, ku di demek pir tixûb de analîza daneya pir bikêr hêz dike.Kevirkirina daneya kesane li ser bingeha analîzên standard peyda dibe, di nav de pirsa genê mutated, sêwirana primer PCR, hwd.
-
mRNA (Çavkanî)
Transcriptome girêdana di navbera agahdariya genetîkî ya genomîk û proteoma fonksiyona biyolojîkî de ye.Rêzkirina asta transkripsiyonê awayê rêziknameya organîzmayan a herî girîng û herî berfireh e ku tê lêkolîn kirin.Rêzkirina transkrîptomê dikare di her kêliyek dem de an di bin her şert û mercî de, bi çareseriyek rast ji yek nukleotîdê re, transkrîptomê rêz bike. Ew dikare bi dînamîk asta transkrîpsiyona genê nîşan bide, hemdem transkrîptên kêm û normal nas bike û bihejmêre, û agahdariya strukturel peyda bike. nimûneyên tîpên taybetî.
Heya nuha, teknolojiya rêzgirtina transkrîptomê bi berfirehî di agronomî, derman û warên din ên lêkolînê de, di nav de rêziknameya pêşkeftina heywan û nebatan, adaptasyona hawîrdorê, danûstendina belengaz, herêmîkirina genê, pêşkeftina genetîkî ya cureyan û tespîtkirina nexweşiya tîmor û genetîkî bi berfirehî tê bikar anîn.
-
Metagenomics (NGS)
Ev platforma analîzê ji bo analîzkirina daneya metagenomîk a gulebaranê li ser bingeha ezmûna salan hatî çêkirin.Ew ji xebata yekgirtî pêk tê ku di nav wan de pêvajokirina daneyê, lêkolînên asta cûrbecûr, lêkolînên asta fonksiyona genê, binavkirina metagenome, hwd. Digel vê yekê, amûrên hilberandina daneya xwerû li ser xebata analîza standard, di nav de lêpirsîna gene û cureyan, hene. , mîhengkirina parametreyê, hilberîna jimareya kesane, hwd.
-
LncRNA
ARN-yên ne-kodker ên dirêj (lncRNA) celebek transkrîptê ye ku dirêjahiya wan ji 200 nt dirêjtir e, ku nikaribin proteînan kod bikin.Delîlên berhevkirî destnîşan dikin ku pirraniya lncRNA pir bikêr in.Teknolojiyên rêziknameya bilind û amûrên analîzkirina biyoinformatîk me hêz dide ku em rêzikên lncRNA û agahdariya cîhê bi bandortir eşkere bikin û me rê li ber vedîtina lncRNAyên bi fonksiyonên birêkûpêk ên girîng vedike.BMKCloud serbilind e ku ji xerîdarên me platforma analîzkirina rêza lncRNA peyda dike da ku bigihîje analîza lncRNA ya bilez, pêbawer û maqûl.
-
GWAS
Lêkolîna komeleya berfireh a genomê (GWAS) armanc dike ku celebên genetîkî (jenotip) yên ku bi taybetmendiyên taybetî (fenotip) re têkildar in nas bike.Lêkolînên GWA vekolînên nîşankerên genetîkî li seranserê genoma hejmareke mezin a kesan derbas dikin û ji hêla analîzên statîstîkî ve di asta nifûsê de têkiliyên genotype-fenotip pêşbînî dikin.Veguheztina tevahiya genomê bi potansiyel dikare hemî cûreyên genetîkî kifş bike.Bi daneyên fenotîpîk re, GWAS dikare were pêvajo kirin da ku SNP, QTL û genên berendam ên têkildar bi fenotîpê nas bike, ku bi hêz piştgirî dide çandiniya heywanan / nebatan a nûjen.SLAF stratejiyek rêkûpêkkirina genomê ya hêsankirî-xwe-pêşkeftî ye, ku nîşankerên belavbûyî yên genomê, SNP, kifş dike.Van SNP, wekî nîşankerên genetîkî yên molekulî, dikarin ji bo lêkolînên komeleyê yên bi taybetmendiyên armanckirî werin pêvajoyê kirin.Ew stratejiyek lêçûn-bandor e di naskirina taybetmendiyên tevlihev ên cûrbecûr genetîkî de.
-
Nanopore Transcriptomics Full-length
Îzoformên alternatîf ên tevlihev û guhêrbar ên di organîzmayan de mekanîzmayên genetîkî yên girîng in ji bo birêkûpêkkirina îfadeya genê û cihêrengiya proteînê.Nasnameya rast a strukturên transkriptê bingehek ji bo lêkolîna kûr a şêwazên rêziknameya vegotina genê ye.Platforma rêzgirtina Nanopore bi serfirazî lêkolîna transkrîptomîkî gihand asta isoformê.Ev platforma analîzê ji bo analîzkirina daneyên RNA-Seq ku li ser platforma Nanopore hatî çêkirin li ser bingeha genoma referansê hatî çêkirin, ku hem di asta genê û hem jî di asta transkriptê de analîzên kalîteyî û jimareyî bi dest dixe.
