BMKCloud Log in
条形banner-03

Products

Genomîka Berawirdî

Genomîka berawirdî bi rastî tê wateya berawirdkirina rêzikên genom û strukturên celebên cihêreng.Armanca vê dîsîplînê eşkerekirina pêşkeftina celeb, fonksiyona genê, mekanîzmaya rêziknameya genê di asta genomê de ye bi destnîşankirina strukturên rêzikan û hêmanên ku di nav cûreyên cûda de parastin an cihêreng kirin.Lêkolîna genomîk a berawirdî ya tîpîk analîzên di malbata genê de, pêşkeftina pêşkeftinê, dubarekirina tevahî genomê, zexta bijartî, hwd.


Details Service

Encamên Demo

Lêkolîna Case

Avantajên Service

1 Berawird-jenomîk

● Pakêta analîzên berfereh, ku heşt analîzên ku herî gelemperî hewce ne vedihewîne

● Di analîzê de pêbaweriya bilind bi şirovekirina berfireh û bi hêsanî ya li ser encaman

● fîgurên amade-weşandinê yên baş-dîzaynkirî

● Tîma biyoinformatîk a pir jêhatî daxwazên analîzên kesane yên cihêreng pêk tîne

● Di analîzê de dema zivirîna kurttir bi rastbûna bilindtir

● Bi zêdeyî 90 dozên serketî re bi faktora bandorê ya belavbûyî ya berhevkirî ya ji 900-î zêdetir ezmûnek berbiçav

Specifications Service

Dema zivirîna texmînkirî

Hejmara cureyan

Analîz dike

30 rojên xebatê

6-12

Kombûna malbata genê

Berfirehbûn û kêmbûna malbata genê

Avakirina dara Phylogenetic

Texmîna dema cudabûnê (Pêdivî ye kalîbrasyona fosîlan)

Dema têketina LTR (Ji bo nebatan)

Dubarekirina tevahî genom (Ji bo nebatan)

Zexta hilbijartî

Analîza Synteny

Analîzên Bioinformatics

● Malbata genê

● Fylogenetics

● Dema cudabûnê

● Zexta bijartî

● Analîza Synteny

流程图 Genomics Comparative

Sample Requirements û Delivery

Pêdiviyên Nimûne:

Tissue an DNA ji bo rêzkirin û komkirina genomê

Ji bo Tissue

Cureyên

Desmal

Lêkolîn

PacBio CCS

Teba

tevna visceral

0,5 ~ 1 g

≥ 3,5 g

Masûlk

≥ 5.0g

≥ 5.0mL

Xwîna memikan

≥ 0,5 ml

Mirîşk / Xwîna masî

Karxane

Pelê teze

1 ~ 2 g

≥ 5.0g

 

Petal / Stem

1 ~ 2 g

≥ 10,0 g

 

Rot / Tov

1 ~ 2 g

≥ 20,0 g

Cells

Hucreya çandî

-

≥ 1 x 108

Jimare

Pelên rêza genome (.fasta) û pelên annotasyonê (.gff3) yên cureyên ku ji nêz ve girêdayî ne

Xizmeta Kar Herikîna

Nimûne QC

Design Experiment

teslîmkirina nimûne

Sample delivery

Amadekirina Pirtûkxaneyê

Avakirina pirtûkxaneyê

Rêzkirin

Rêzkirin

Analîzkirina daneyan

Analîzkirina daneyan

Karûbarên piştî firotanê

Xizmetên piştî firotanê


  • Pêşî:
  • Piştî:

  • *Encamên demo ku li vir têne xuyang kirin hemî ji genomên ku bi Biomarker Technologies re hatine weşandin ne

    1.LTR Texmîna wextê têxe: Reqemê di demên têketina LTR-RT de di genoma nîsk a Weining de, li gorî celebên din, dabeşek bimodal ya bêhempa nîşan dide.Lûtkeya herî dawî li dora 0,5 mîlyon sal berê xuya bû.

    3LTR-texmîna-dema-nav-di-Weining-rye

    Li Guang et al.,Genetics Nature, 2021

     

     

    2.Fylogeny û analîza malbata genê ya li ser kayote (Sechium edule): Bi analîzkirina chayote û 13 cureyên din ên girêdayî di malbata genê de, hate dîtin ku Chayote herî nêzik bi gûza maran (Trichosanthes anguina) ve girêdayî ye.Chayote ku li dora 27-45 Mya ji goştê marê hatî çêkirin û tevahî dubendiya genomê (WGD) li chayote di 25±4 Mya de hate dîtin, ku ev bûyera sêyemîn a WGD ye di cucuibitaceae de.

    4Fylogenetic-dare-of-chayote

    Fu A et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

     

     

    3.Analîzasyona Synteny: Hin genên girêdayî phytohormones di pêşveçûna fêkiyan de di chayote, snake gurê û squash de hatin dîtin.Têkiliya di navbera chayote û squash de ji ya di navbera chayote û gurê mar de hinekî zêdetir e.

    4Fylogenetic-dare-of-chayote

    Fu A et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

     

     

    4.Analîzkirina malbata genê: zengînkirina KEGG li ser berfirehbûn û girêbesta malbata genê di genomên G.thurberi û G.davidsonii de destnîşan kir ku biosenteza steroîdan û genên girêdayî biosenteza brassinosteroid berfireh bûne.

    4Fylogenetic-dare-of-chayote

    Yang Z et al.,BMC Biology, 2021

     

     

    5.Analîzasyona dubarekirina genomê ya tevahî: Analîzkirina belavkirina 4DTV û Ks tevahî bûyera dubarekirina genomê nîşan dide.Lûtkeyên hundurîn bûyerên dubarebûnê nîşan didin.Lûtkeya navçewan bûyerên curebûnê nîşan didin.Analîzê destnîşan kir ku li gorî sê celebên din ên ku ji nêz ve girêdayî ne, O. europaea di van demên dawî de di nav dubendiyek genî ya mezin re derbas bû.

    4Fylogenetic-dare-of-chayote

    Rao G et al.,Lêkolîna Baxçevaniyê, 2021

    BMK Case

    Gula bê kulm: nihêrînên genomîk ên bi adaptasyona şilbûnê ve girêdayî ne

    Weşandin: Review Science Neteweyî, 2021

    Stratejiya rêzgirtinê:

    'Basye'sThornless' (R.Wichurainan) genom:
    Approx.93 X PacBio + nêzîkî.90 X Nanopore + 267 X Illumina

    Encamên sereke

    1.High quality R.wichuraiana genome bi karanîna teknîkên rêzgirtinê yên dirêj-xwende hate çêkirin, ku kombûnek 530.07 Mb derdixe (Qebala genomê ya texmînkirî ji hêla sîtometrîya herikînê ve bi qasî 525.9 Mb û ji hêla lêkolîna genomê ve 525.5 bû. Heterozygosity dora 1.03% bû.Pûana texmînkirî ya BUSCO% 93,9 bû.Bi berhevdana bi "Old blush" (haploOB), kalîte û temamiya vê genomê ji hêla rastbûna bingehek yek-bingeh û indexa kombûna LTR (LAI=20.03) ve hate pejirandin.Genoma R.wichuraiana 32,674 genên kodkirina proteînan dihewîne.

    2.Analîzasyona hevpar a pir-omîk, ku ji genomîka berawirdî, transkriptomîk, analîza QTL ya nifûsa genetîkî pêk tê, cûrbecûr girîng di navbera R. wichuraiana û Rosa chinensis de eşkere kir.Di heman demê de, guhertoya vegotina genên têkildar di QTL de dibe ku bi şêwaza stûnê ya stûnê re têkildar be.

    7KEGG-dewlemendkirin-li ser-gene-malbat-berfirehkirin-û-tevlihevkirin

    Analîzên genomîk ên berawirdî di navbera Basye;s Thornless û Rosa chinensis de, tevî analîza synteny, koma malbata genê, analîza berfirehbûn û berhevkirinê, hejmareke mezin ji guhertoyên ku bi taybetmendiyên girîng ên gulan re têkildar in eşkere kirin.Berfirehbûna bêhempa ya di malbata genê NAC û FAR1/FRS de pir gengaz bû ku bi berxwedana li dijî deqê reş re têkildar be.

    81Analîzên berawirdî-jenomîk-navber-BT-û-OB 82Berhev-jenomîk-analîzên-navber-BT-û-OB 83Berhev-jenomîk-analîzên-navber-BT-û-OB

    Di navbera genomên BT û haploOB de analîza genomîk a berawirdî.

    Balkêşî

    Zhong, M., et al."Gulê bê çîçek: nihêrînên genomîkî bi adaptasyona şilbûnê ve girêdayî ne"Review Science Neteweyî, 2021;, nwab092.

    quote bistînin

    Peyama xwe li vir binivîse û ji me re bişîne

    Peyama xwe ji me re bişînin: