-
Rêzkirina Immunoprecipitation Chromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq ji bo guheztina hîstone, faktorên veguheztinê, û proteînên din ên girêdayî DNA-yê profîlên genom-berfireh ên armancên DNA peyda dike.Ew hilbijartî ya immuno-barînê ya kromatînê (ChIP) vedigire da ku kompleksên proteîn-DNA-ya taybetî vegerîne, bi hêza rêzkêşana nifşê pêşeroj (NGS) ji bo rêzgirtina bilind-rêveber a ADN-ya hatî vegerandin.Wekî din, ji ber ku kompleksên proteîn-ADN-ê ji hucreyên zindî têne derxistin, cîhên girêdanê dikarin di celeb û tevnên cûda yên hucreyê de, an di bin şert û mercên cûda de werin berhev kirin.Serlêdan ji rêziknameya transkrîpsiyonê bigire heya rêyên pêşkeftinê heya mekanîzmayên nexweşiyê û pê ve.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Rêzkirina bisulfîtê ya tevaya genomê
Methylasyona ADN-ê di pozîsyona pêncemîn de di cytosine (5-mC) de bandorek bingehîn li ser vegotina genê û çalakiya hucreyî heye.Nimûneyên methylasyonê yên ne normal bi gelek şert û nexweşiyan re, wek kanserê, ve girêdayî ne.WGBS bûye standarda zêr ji bo lêkolîna metilasyonê ya genomê ya bi çareseriya bingehîn.
Platform: Illumina NovaSeq6000
-
Assay ji bo Kromatîna Transposase-Gihîn bi Rêzkirina Rêjeya Bilind (ATAC-seq)
ATAC-seq ji bo analîzkirina gihîştina kromatînê ya li seranserê genomê, rêbazek rêzgirtinê ya bilind-rêveber e, ku ji bo kontrolkirina epigenetîk a gerdûnî ya vegotina genê girîng e.Adapterên rêzgirtinê ji hêla transposaza Tn5 ya hîperaktîf ve di nav deverên kromatîn ên vekirî de têne danîn.Piştî zêdekirina PCR, pirtûkxaneyek rêzgirtinê tê çêkirin.Hemî herêmên kromatînê yên vekirî dikarin di bin şertek cîh-dem-demê ya taybetî de werin bidestxistin, ne tenê bi deverên girêdanê yên faktorek veguheztinê, an herêmek hin guhezbar a hîstone re sînordarkirî ne.
-
Rêzkirina Bisulfitê ya Nûnertiya Kêmkirî (RRBS)
Lêkolîna methylasyonê ya DNA di lêkolîna nexweşiyê de her gav mijarek germ e, û ji nêz ve bi vegotina genê û taybetmendiyên feno-tîpîk re têkildar e.RRBS ji bo lêkolîna methylasyonê ya DNA rêbazek rast, bikêr û aborî ye.Dewlemendkirina herêmên promotor û girava CpG bi perçebûna enzîmatîk (Msp I), ku bi rêzgirtina Bisulfite re têkildar e, tespîtkirina methylasyonê ya DNA-ya rezîliya bilind peyda dike.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
