Rêzkirina mRNA ya Eukaryotî-Illumina
Avantajên
ØZêdeyî Ezmûnî: Zêdetirî 200,000 nimûne di BMK-ê de hatine pêvajo kirin ku celebên nimûneyên cihêreng, di nav de çanda hucreyê, tevn, şilava laş, hwd. û zêdetirî 7,000 projeyên mRNA-Seq girtî ku deverên cihê lêkolînê vedihewîne.
ØPergala kontrolkirina kalîteyê ya hişk: Xalên kontrolkirina kalîteyê ya bingehîn di nav hemî gavan de, tevî amadekirina nimûneyê, amadekirina pirtûkxaneyê, rêzkirin û biyoinformatics di bin çavdêriyek nêzîk de ne da ku encamên bilind-kalîteyê peyda bikin.
ØGelek databasên ku ji bo vekolînên fonksiyonê û lêkolînên dewlemendkirinê peyda dibin da ku armancên lêkolînê yên cihêreng bicîh bînin.
ØKarûbarên piştî firotanê: Karûbarên piştî firotanê piştî qedandina projeyê 3 mehan derbasdar in, di nav de şopandina projeyan, kişandina pirsgirêkê, encam Q&A, hwd.
Sample Requirements û Delivery
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzgirtinê | Daneyên pêşniyar kirin | Kontrola Kalîteyê |
| Poly A dewlemend kirin | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Pêdiviyên Nimûne:
Nukleotîd:
| Paqijiya | Linavketinî | Biha |
| OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Li ser gêlê bi proteîn an ADN-ê vegirtinek sînorkirî an tune. | Ji bo nebatan: RIN≥6.5;Ji bo heywanan: RIN≥7;28S/18S≥1.0;bilindahiya bingehîn sînorkirî an tune | Conc.≥30 ng/μl;Volume ≥ 10 μl;Bi tevahî ≥ 1,5 μg |
Tîrêj: Giranî (zuwa):≥1 g
*Ji bo tevnek ji 5 mg piçûktir, em pêşniyar dikin ku nimûneya tevnê cemidî (di nîtrojena şil) de bişînin.
Rawestandina hucreyê:Hejmara hucreyan = 3×106- 1×107
*Em pêşniyar dikin ku lîza hucreya cemidî bişînin.Ger şaneyek ji 5 × 105 piçûktir be, di nîtrojena şil de qeşagirtî tê pêşniyar kirin, ku ji bo derxistina mîkro çêtir e.
Nimûneyên xwînê:Volume≥1 ml
Mîkroorganîzma:Girse ≥ 1 g
Pêşniyara Sample Delivery
Konteyner: 2 ml lûleya santrîfujê (Polê tin nayê pêşniyar kirin)
Etîketkirina nimûneyê: Kom+kobar, mînak A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Barkirin:
- Qeşa hişk: Pêdivî ye ku nimûne di torbeyan de bêne pak kirin û di qeşa hişk de bêne veşartin.
- Tîpên RNAstable: Nimûneyên RNA dikarin di lûleya stabîlîzasyona RNA de bêne hişk kirin (mînak RNAstable®) û di germahiya odeyê de bêne şandin.
Xizmeta Kar Herikîna
Design Experiment
Sample delivery
Derxistina RNA
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Bioinformatics
Eukaryotî Xebata analîzkirina rêza mRNAyê
Bioinformatics
ØKontrolkirina kalîteya daneya xav
ØLihevhatina genomê ya referansê
ØAnalîzkirina avahiya transcript
ØHejmara îfadeyê
ØAnalîza îfadeya cihêreng
ØDanasîn û dewlemendkirina fonksiyonê
1.Kûreya Têrbûna Daneyên mRNA
2.Analîzkirina îfadeya cihêreng-Pirtûka volqan
3.Şîrovekirina KEGG li ser DEG
4.Tesnîfkirina GO li ser DEGs
