Rêzkirina mRNA ya Eukaryotîk-NGS
Taybetmendî
● Amadekirina pirtûkxaneya mRNA ya arasteyî ya vebijarkî ji bo bidestxistina daneyên rêzkirina taybetî ya zincîrê
● Analîzên BI yên cuda hemû hewcedariyên xerîdarên me vedihewînin
Awantaj
●Pisporiya BerfirehMe zêdetirî 600,000 nimûne pêvajo kirine, ku ji celebên nimûneyên cûrbecûr ên wekî kulturên şaneyan, tevn û şilavên laş pêk tên. Em dewlemendiya pisporiyê tînin her projeyekê.
●Kontrola Kalîteyê ya Bi HişkîEm xalên kontrolê yên bingehîn li seranserê hemî qonaxan bicîh dikin, ji amadekirina nimûneyê bigire heya amadekirina pirtûkxaneyê, rêzkirin û biyoenformatîkê. Çavdêriya me ya baldar radestkirina encamên bi kalîteya bilind a domdar misoger dike.
●Têbînîyeke BerfirehEm ji bo şîrovekirina fonksiyonel a Genên Cûda yên Derbirandî (DEG) û pêkanîna analîzên dewlemendkirinê yên têkildar, gelek databasan bikar tînin. Ev rêbaza berfireh têgihîştinê li ser pêvajoyên şaneyî û molekulî yên di bin bersiva transkrîptomê de peyda dike, û piştrast dike ku hûn hemî agahdariya gengaz li ser daneyên ceribandina xwe bistînin.
●Piştgiriya Piştî FirotanêEm fêm dikin ku amadebûn çiqas girîng e, ji ber vê yekê pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi heyamek xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
Pêdiviyên Nimûneyan û Radestkirin
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzkirinê | Daneyên pêşniyarkirî | Kontrola Kalîteyê |
| Poly A dewlemendkirî | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
Pêdiviyên Nimûneyê:
Nukleotîd:
Pêdiviyên Nimûneya Kêmtirîn:
| Têkelkirin (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijî | Linavketinî | |
| Pirtûkxaneya Standard | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gemarîbûna proteîn an DNAyê li ser jelê bi sînor an jî tune ye. | Ji bo nebatan: RIN≥4.0; Ji bo heywanan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindahiya bingehîn sînorkirî an tune |
| Pirtûkxaneya Rêberî | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gemarîbûna proteîn an DNAyê li ser jelê bi sînor an jî tune ye. | Ji bo nebatan: RIN≥4.0; Ji bo heywanan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindahiya bingehîn sînorkirî an tune |
| Nebat | Teba | Artropod | Xwîna tevahî | Xaneyan |
| Kok, Qûn an Petal: 450 mg Pel an Toxm: 300 mg Fêkî: 1.2 g | Dil an Rûvî: 300 mg Mejî an jî organên zikê: 240 mg Masûlke: 450 mg Hestiyên, Por an Çerm: 1g | Mêşhingiv: 6g Krustacea: 300 mg | 1 lûle | 106 xane |
Radestkirina Nimûneya Pêşniyarkirî
Qutî: Lûleya santrifûjê ya 2 ml (Foliya teneke nayê pêşniyarkirin)
Nimûneya nîşankirinê: Komkirin+dubarekirin mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Şandin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di nav kîsan de werin pak kirin û di nav qeşaya hişk de werin veşartin.
2. Lûleyên tabloya RNAyê: Nimûneyên RNAyê dikarin di lûleya stabîlîzasyona RNAyê de (mînak RNAstable®) werin hişkkirin û di germahiya odeyê de werin şandin.
Pêdiviyên Nimûneyan û Radestkirin
Sêwirana ceribandinê
Radestkirina nimûneyê
Derxistina RNAyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Bîyoenformatîk
Ji bo nimûneyên ku genomek referansê ya berdest heye, analîza BI wiha ye:
ØKontrolkirina kalîteya daneyên xav
ØHevrêzkirina genoma referansê
ØAnalîza avahiya transkrîptê
ØKêmkirina îfadeyê
ØAnalîza îfadeya cûda
ØTêbînîkirin û dewlemendkirina fonksiyonê
Ji bo nimûneyên bêyî genoma referansê, ev vebijarka berdest e:
• Kontrolkirina kalîteya daneyên xav
•Meclîs bi optimîzasyona avahiyê
•Analîza îfadeya cûda
•Têbînîkirin û dewlemendkirina fonksiyonê
Hevrêzkirina Genomê ya Referansê
Têrbûna Daneyan
Têkiliya nimûneyan û nirxandina dubarekirinên biyolojîkî
Genên Bi Cûda Derbirî (DEG)
Têbînîkirina Fonksiyonel a DEG-an
Dewlemendkirina Fonksiyonel a DEG-an
Pêşveçûnên ku ji hêla karûbarên rêzkirina mRNA ya NGS ya eukaryotîk a BMKGene ve bi rêya berhevokek weşanên bijartî têne hêsankirin, vekolin.
Huang, L. û yên din (2023) 'Trîklosan û trîklokarban kapasîteya bêhnkirinê ya masiyên zêrîn qels dikin bi sînordarkirina naskirina bêhnê, têkbirina veguhestina sînyala bêhnkirinê, û têkbirina pêvajoya agahdariya bêhnkirinê',Lêkolîna Avê, 233, r. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ û yên din (2023) 'Aspergillus fumigatus p11 ya mirovan direvîne da ku fagozomên ku fungî tê de hene ber bi rêça ne-hilweşînê ve bibe',Xaneya Mêvandar û Mîkrob, 31 (3), rûpel 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. û yên din (2022) 'Faktorên Veguheztina TCP-ê yên ku di Pêşveçûna Gula Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro) de Têkildar in',Sînorên Zanista Nebatan, 13, r. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. û yên din (2022) 'Genoma Chrysanthemum lavandulifolium û mekanîzmaya molekulî ya bingehîn a celebên cûrbecûr ên capitulum',Lêkolîna Baxçevaniyê, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie û yên din. (2023) 'Nanoreaktoreke kaskadê ji bo baştirkirina terapiya sonodînamîk li ser kansera kolon û rektûmê bi rêya zêdekirina ROS ya sînerjîk û astengkirina otofajiyê',Nano Îro, 49, rûp. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
