Rêzkirina mRNA ya Dirêjahiya Tevahî - Nanopore
Taybetmendî
● Girtina poly-A mRNA û dû re senteza cDNA û amadekirina pirtûkxaneyê
● Rêzkirina transkrîptên dirêj
● Analîza biyoenformatîkî li ser bingeha hevrêzkirina bi genomek referansê re
● Analîza biyoenformatîkî ne tenê îfadeya li ser asta gen û îzoformê, lê di heman demê de analîza lncRNA, hevgirtina genan, polîadenîlasyon û avahiya genê jî vedihewîne.
Avantajên Xizmetê
●Pîvandina hejmarî ya derbirînê di asta îzoformê de: çalakkirina analîza derbirîna berfireh û rast, eşkerekirina guhertina ku dibe ku di dema analîzkirina tevahiya derbirîna genê de were veşartin
●Daxwazên Daneyên Kêmkirî:Li gorî Rêzkirina Nifşê Nû (NGS), rêzkirina Nanopore hewcedariyên daneyan kêmtir nîşan dide, ku rê dide astên wekhev ên têrbûna pîvandina îfadeya genê bi daneyên piçûktir.
●Rastbûna bilindtir a hejmartina îfadeyê: hem di asta genê de û hem jî di asta îzoformê de
●Nasîna agahiyên transkrîptomîk ên zêde: polîadenîlasyona alternatîf, genên hevgirtinê û lcnRNA û genên wan ên hedef
●Pisporiya BerfirehTîma me, ku zêdetirî 850 projeyên transkrîptomê yên dirêj ên Nanopore temam kirine û zêdetirî 8,000 nimûneyan pêvajo kiriye, xwedî ezmûneke dewlemend e ji bo her projeyekê.
●Piştgiriya Piştî FirotanêPabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
Pêdiviyên Nimûneyan û Radestkirin
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzkirinê | Daneyên pêşniyarkirî | Kontrola Kalîteyê |
| Poly A dewlemendkirî | Nanopore PromethION 48 | 6/12 Gb | Pûana navînî ya kalîteyê: Q10 |
Pêdiviyên Nimûneyê:
Nukleotîd:
| Têkelkirin (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijî | Linavketinî |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gemarîbûna proteîn an DNAyê li ser jelê bi sînor an jî tune ye. | Ji bo nebatan: RIN≥7.0; Ji bo heywanan: RIN≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindahiya bingehîn sînorkirî an tune |
● Nebat:
Kok, Qûn an Petal: 450 mg
Pel an Toxm: 300 mg
Fêkî: 1.2 g
● Heywan:
Dil an Rûvî: 300 mg
Mejî an jî organên zikê: 240 mg
Masûlke: 450 mg
Hestiyên, Por an Çerm: 1g
● Artropod:
Mêşhingiv: 6g
Krustacea: 300 mg
● Xwîna tevahî: 1 lûle
● Xane: 106 şaneyan
Radestkirina Nimûneya Pêşniyarkirî
Qutî: Lûleya santrifûjê ya 2 ml (Foliya teneke nayê pêşniyarkirin)
Nimûneya nîşankirinê: Komkirin+dubarekirin mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Şandin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di nav kîsan de werin pak kirin û di nav qeşaya hişk de werin veşartin.
2. Lûleyên RNA-yê yên stabîl: Nimûneyên RNA-yê dikarin di lûleya stabîlkirina RNA-yê de (mînak RNAstable®) werin hişk kirin û di germahiya odeyê de werin şandin.
Herikîna Karê Xizmetê
Nukleotîd:
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Herikîna Karê Xizmetê
Desmal:
Sêwirana ceribandinê
Radestkirina nimûneyê
Derxistina RNAyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
● Pêvajoya daneyên xav
● Nasnameya transkrîptê
● Girêdana alternatîf
● Kêmkirina îfadeyê di asta genê û asta îzoformê de
● Analîza îfadeya cuda
● Têbînîkirin û dewlemendkirina fonksiyonê (DEG û DET)
Analîza splicinga alternatîf
Analîza Polyadenîlasyonê ya Alternatîf (APA)
Pêşbîniya lncRNA
Têbînîkirina genên nû
Komkirina DETan
Torên Proteîn-Proteîn di DEG-an de
Pêşveçûnên ku ji hêla karûbarên rêzkirina mRNA ya tevahî ya Nanopore ya BMKGene ve bi rêya berhevokek weşanên bijartî têne hêsankirin, vekolin.
Gong, B. û yên din. (2023) 'Aktîvkirina epîgenetîk û transkrîpsiyonî ya kînaza veşartî FAM20C wekî onkojenek di gliomayê de', Kovara Genetics û Genomics, 50(6), r. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
He, Z. û yên din. (2023) 'Rêzkirina transkrîptomên tevahî yên bersiva lîmfosîtan a li hember IFN-γ bersiveke îmmûnî ya Th1-çewt di masiyê ...
Ma, Y. û yên din (2023) 'Analîza berawirdî ya rêbazên rêzkirina RNA ya PacBio û ONT ji bo destnîşankirina jehra Nemopilema Nomurai', Genomics, 115(6), r. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
Yu, D. û yên din. (2023) 'Analîza Nano-seq meyla fonksiyonel a cuda di navbera eksozoman û mîkrovezîkulên ji hUMSC hatine wergirtin de eşkere dike', Lêkolîn û Terapiya Hucreyên Bingehîn, 14(1), r. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
