Têketina BMKCloud

Berhem

Têkiliya Kromatînê ya li ser bingeha Hi-C

Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina mîhengkirina genomîk bi hevberkirina têkiliyên li ser bingeha nêzîkbûnê û rêzkirina rêjeya bilind hatiye çêkirin. Ev rêbaz li ser girêdana kromatîn bi formaldehîdê re ye, dû re jî bihelandin û ji nû ve girêdan bi awayekî ku tenê perçeyên ku bi kovalentî ve girêdayî ne berhemên girêdanê çêdikin. Bi rêzkirina van berhemên girêdanê, gengaz e ku rêxistina 3D ya genomê were lêkolîn kirin. Hi-C belavkirina beşên genomê yên ku bi sivikî pakkirî ne (beşên A, eukromatîn) û îhtîmala ku ji hêla transkrîpsiyonê ve çalak bin, û herêmên ku bi zexmî pakkirîtir in (beşên B, Heterokromatîn) lêkolîn dike. Hi-C di heman demê de dikare were bikar anîn da ku Domainên Topolojîkî yên Bi Hev Ve Girêdayî (TAD), herêmên genomê yên ku avahiyên wan qatkirî ne û îhtîmal e ku şêwazên îfadeyê yên wekhev hebin, destnîşan bike û ji bo destnîşankirina lûpên kromatîn, herêmên DNA yên ku ji hêla proteînan ve bi hev ve girêdayî ne û ku pir caran bi hêmanên rêkûpêk dewlemend in, were destnîşankirin. Xizmeta rêzkirina Hi-C ya BMKGene lêkolîneran hêzdar dike ku aliyên fezayî yên genomîkê bikolin, û rêyên nû ji bo têgihîştina rêziknameya genomê û bandorên wê li ser tenduristî û nexweşiyan vedike.

Paqij bûn

Agahiyên Xizmetê

Bîyoenformatîk

Encamên demo

Weşanên sereke

Taybetmendiyên Xizmetê

● Rêzkirin li ser Illumina NovaSeq bi PE150.

● Xizmet ji bo girêdana bi formaldehîdê re û parastina têkiliyên DNA-proteînê, nimûneyên tevnan, li şûna asîdên nukleîk ên derxistî, hewce dike.

● Ezmûna Hi-C bi bîotînê ve sînordarkirin û sererastkirina dawiya seriyên zeliqok vedihewîne, dû re jî seriyên qalind ên encam diparêzin dema ku têkiliyan diparêzin. Dûv re DNA bi gulokên streptavidin tê kişandin û ji bo amadekirina pirtûkxaneyê ya paşê tê paqijkirin.

Avantajên Xizmetê

●Sêwirana Enzîma Sînorkirinê ya Optîmal: ji bo misogerkirina karîgeriya Hi-C ya bilind li ser cureyên cûda bi heta 93% cotên têkiliyê yên derbasdar.

●Qeydên Pisporî û Weşanê yên Berfireh:BMKGene xwedî ezmûneke berfireh e di zêdetirî 2000 projeyên rêzkirina Hi-C ji 800 cureyên cûda û patentên cûrbecûr de. Zêdetirî 100 dozên weşandî bi faktoreke bandora berhevkirî ya zêdetirî 900.

●Tîma Biyoenformatîkê ya Pispor:bi patentên navxweyî û mafên nivîsbariyê yên nermalavê ji bo ceribandinên Hi-C û analîza daneyan û nermalava daneyên dîtbarîkirinê ya ku ji hêla xwe ve hatî pêşve xistin.

●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.

●Têbînîyeke BerfirehEm gelek databasan bikar tînin da ku genan bi guhertoyên diyarkirî bi awayekî fonksiyonel şîrove bikin û analîza dewlemendkirinê ya têkildar pêk bînin, û têgihiştinan li ser gelek projeyên lêkolînê peyda bikin.

Taybetmendiyên Xizmetê

Pirtûkxane

Stratejiya Rêzkirinê

Derana daneyên pêşniyarkirî

Çareseriya Sînyala Hi-C

Pirtûkxaneya Hi-C

Illumina PE150

Çerxa Kromatînê: 150x

TAD: 50x

Çerxa Kromatînê: 10Kb

TAD: 40Kb

Pêdiviyên Xizmetê

Cureyê nimûneyê	Mîqdara pêwîst
Teşeyên heywanan	≥2g
Xwîna Tevahî	≥2mL
Fungî	≥1g
Teşeya ciwan a nebatan	1g/alîkot, 2-4 alîkot têne pêşniyarkirin
Hucreyên Çandîkirî	≥1x10⁷

Pêşî: Kîta RNA ya Nebatên Magnetîk ên Zîrek ên TGuide

Piştî: Pirtûkxaneyên pêş-çêkirî yên DNBSEQ

Analîza jêrîn vedihewîne:

● QC-ya daneyên xav;

● Nexşerêkirin û QC ya pirtûkxaneya Hi-C: cotên têkiliyê yên derbasdar û Eksponentên Hilweşîna Têkiliyê (IDE);

● Profîla Têkiliya Tevahiya Genomê: analîza cis/trans û nexşeya têkiliya Hi-C;

● Analîza belavkirina beşa A/B;

● Nasîna TAD û xelekên kromatînê;

● Analîza cuda li ser hêmanên avahiya kromatînê ya 3D di navbera nimûneyan de û şîrovekirina fonksiyonel a têkildar a genên têkildar.

Belavbûna rêjeya Cis û trans

Nexşeya germê ya têkiliyên kromozomal ên di navbera nimûneyan de

Belavbûna beşên A/B li seranserê genomê

Belavbûna lûpên kromatînê li seranserê genomê

Dîtbarîkirina TAD-an

Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên lêkolînê yên ku ji hêla karûbarên rêzkirina Hi-C yên BMKGene ve têne hêsankirin, vekolin.

Meng, T. û yên din. (2021) 'Analîzek berawirdî ya yekgirtî ya pir-omîk CA2 wekî hedefek nû ji bo kordomê destnîşan dike',Neuro-Onkolojî, 23(10), rûpel 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.

Xu, L. û yên din (2021) 'Bêserûberkirin û ji nû ve rêzkirina genoma 3D têgihîştinê li ser patogeneza NAFLD bi rêya rêzkirina Hi-C, Nanopore, û RNA ya yekgirtî peyda dike',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), rûpel 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.