Komkirina Genomê ya Li Ser Bingeha Hi-C
Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina mîhengkirina kromozoman bi hevberkirina têkiliyên li ser bingeha nêzîkbûnê û rêzkirina bi rêjeya bilind hatiye sêwirandin. Bawer dibe ku şiddeta van têkiliyan bi dûrbûna fîzîkî ya li ser kromozoman re bi awayekî neyînî têkildar e. Ji ber vê yekê, daneyên Hi-C têne bikar anîn da ku komkirin, rêzkirin û rêwerzkirina rêzikên komkirî di genomek pêşnûmeyê de û girêdana wan li ser hejmarek diyarkirî ya kromozoman rêber bikin. Ev teknoloji di nebûna nexşeyek genetîkî ya li ser bingeha nifûsê de, civînek genomê ya asta kromozomê hêzdar dike. Her genomek hewceyê Hi-C-yek e.
Taybetmendiyên Xizmetê
● Rêzkirin li ser Illumina NovaSeq bi PE150.
● Xizmet ji bo girêdana bi formaldehîdê re û parastina têkiliyên DNA-proteînê, nimûneyên tevnan, li şûna asîdên nukleîk ên derxistî, hewce dike.
● Ezmûna Hi-C bi bîotînê ve sînordarkirin û sererastkirina dawiya seriyên zeliqok vedihewîne, dû re jî seriyên qalind ên encam diparêzin dema ku têkiliyan diparêzin. Dûv re DNA bi gulokên streptavidin tê kişandin û ji bo amadekirina pirtûkxaneyê ya paşê tê paqijkirin.
Avantajên Xizmetê
Pêşgotina Hi-C
(Lieberman-Aiden E û yên din,Zanist, 2009)
●Jiholêrakirina Pêdiviya Daneyên Gelheyî yên Genetîkî:Hi-C agahdariya bingehîn a pêwîst ji bo lengerkirina contig diguhezîne.
●Densiya nîşankerên bilind:dibe sedema rêjeyek bilind a girêdana contig a li jor 90%.
●Qeydên Pisporî û Weşanê yên Berfireh:BMKGene xwedî ezmûneke berfireh e bi zêdetirî 2000 dozên Kombûna Genoma Hi-C ji 1000 cureyên cûda û patentên cûrbecûr. Zêdetirî 200 dozên weşandî xwedî faktoreke bandora berhevkirî ya zêdetirî 2000 in.
●Tîma biyoenformatîkê ya pir jêhatî:Digel patentên navxweyî û mafên nivîsbariyê yên nermalavê ji bo ceribandin û analîza daneyan a Hi-C, nermalava daneyên dîtbarîkirinê ya ku bi xwe hatiye pêşxistin, veguheztina blokê bi destan, berevajîkirin, betalkirin û ji nû ve kirinê gengaz dike.
●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
●Têbînîyeke BerfirehEm gelek databasan bikar tînin da ku genan bi guhertoyên diyarkirî bi awayekî fonksiyonel şîrove bikin û analîza dewlemendkirinê ya têkildar pêk bînin, û têgihiştinan li ser gelek projeyên lêkolînê peyda bikin.
Taybetmendiyên Xizmetê
| Amadekariya pirtûkxaneyê | Stratejiya rêzkirinê | Derana daneyên pêşniyarkirî | Kontrola kalîteyê |
| Pirtûkxaneya Hi-C | Illumina NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
Pêdiviyên Nimûneyê
| Desmal | Mîqdara pêwîst |
| Rîska heywanan | ≥ 2 g |
| Masûlkeya Heywanan | |
| Xwîna memikan | ≥ 2 mL |
| Xwîna mirîşk/masî | |
| Nebat - Pelê Teze | ≥ 3 g |
| Hucreyên Çandîkirî | ≥ 1x107 |
| Mêşik | ≥ 2 g |
Herikîna Karê Xizmetê
Sêwirana ceribandinê
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
1) QC-ya daneyên xav
2) QC ya pirtûkxaneya Hi-C: texmîna têkiliyên Hi-C yên derbasdar
3) Komkirina Hi-C: komkirina kontîgan di koman de, piştre rêzkirina kontîgan di nav her komê de û destnîşankirina arasteya kontîgan
4) Nirxandina Hi-C
QC ya Pirtûkxaneya Hi-C - texmîna cotên têkiliyê yên derbasdar ên Hi-C
Meclîsa Hi-C - statîstîk
Nirxandina piştî-komkirinê - nexşeya germê ya şîdeta sînyalê di navbera qutiyan de
Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên ku ji hêla xizmetên montajkirina Hi-C yên BMKGene ve têne hêsankirin, vekolin.
Tian, T. û yên din (2023) 'Civandina genomê û parçekirina genetîkî ya germoplazmayek ceh a berxwedêr a ziwabûnê ya berbiçav', Nature Genetics 2023 55:3, 55(3), r. 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
Wang, ZL û yên din. (2020) 'Civînek li gorî Pîvana Kromozomê ya Genoma Apis cerana ya Mêşa Hingivîn a Asyayî', Frontiers in Genetics, 11, r. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
Zhang, F. û yên din (2023) 'Eşkerekirina pêşveçûna bîyosenteza alkaloidên tropanê bi analîzkirina du genomên di malbata Solanaceae de', Nature Communications 2023 14:1, 14(1), pp. 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zhang, X. û yên din. (2020) 'Genomên Dara Banyan û Mizgefta Tozker Têgihîştinê li ser Hev-Pêşveçûna Mîzgeft-Hêjîrê Pêşkêş Dikin', Cell, 183(4), pp. 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
