●Analîza hevpar a mRNA û lncRNA: Bi berhevkirina mîqdarkirina transkriptên mRNA bi lêkolîna lncRNA û armancên wan re, mimkun e ku meriv li ser mekanîzmaya rêziknameyê ya ku di binê bersiva hucreyî de ye nêrînek kûr bigire.
●Pisporê Berfireh: Tîma me ji her projeyê re gelek ezmûnek bi xwe re tîne, digel tomarkirina şopandina zêdetirî 23,000 nimûneyan li BMK ku cûrbecûr cûrbecûr nimûne û projeyên lncRNA vedigire.
●Kontrola Kalîteyê ya hişk: Em xalên kontrolê yên bingehîn di hemî qonaxan de bicîh dikin, ji amadekirina nimûne û pirtûkxaneyê bigire heya rêzkirin û biyoinformatics. Vê çavdêriya berbiçav peydakirina encamên domdar ên bi kalîte misoger dike.
●Piştgiriya Post-Firotinê: Peymana me ji temamkirina projeyê bi heyama karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî re dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.
Pirtûkxane | Rawesta axaftevan | Daneyên pêşniyar kirin | Daneyên QC |
Pirtûkxaneya rênîşander a rRNA hilweşiya | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Pevçûn (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijiyê | Linavketinî |
≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Li ser gêlê bi proteîn an ADN-ê bi sînorkirî an tune. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindbûna bingehîn ya sînorkirî an tune |
● Nebat:
Root, Stem an Petal: 450 mg
Pel an tov: 300 mg
Fêkî: 1,2 g
● Heywan:
Dil an rûvî: 450 mg
Viscera an Mejî: 240 mg
Masûlk: 600 mg
Hestî, por an çerm: 1,5 g
● Arthropods:
Kêzik: 9g
Crustacea: 450 mg
● Xwîna tevayî:2 tubes
● Hucreyên: 106 hucreyan
● Serum û Plasma: 6 ml
Pêşniyara Sample Delivery
Konteyner: 2 ml lûleya santrîfujê (Polê tin nayê pêşniyar kirin)
Etîketkirina nimûneyê: Kom+kobar, mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Barkirin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di torbeyan de bêne pakkirin û di qeşa hişk de bêne veşartin.
2. Tîpên RNAstable: Nimûneyên RNA dikarin di lûleya stabîlîzasyona RNA de bêne hişk kirin (mînak RNAstable®) û di germahiya odeyê de bêne şandin.
Bioinformatics
Analîzkirina Genê Daxuyaniya Ciyawaz (DEGs).
Hêjdarkirina îfadeya lncRNA - komkirin
Dewlemendkirina genên hedefa lncRNA
Analîzkirina pozîsyona mRNA û lncRNA ya hevbeş - Plana Circos (xeleka navîn mRNA ye û cicrlceya hundurîn lncRNA ye)
Pêşketinên ku ji hêla karûbarên hevberdana lncRNA ya BMKGene ve têne hêsan kirin bi navgîniya berhevokek belavokan vekolin.
Ji, H. et al. (2020) 'Nasname, pêşbîniya fonksiyonel, û verastkirina lncRNA ya sereke ya lncRNA-yên girêdayî stresa sar di kezeba mişkan de', Raporên Zanistî 2020 10:1, 10 (1), rûp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analîzkirina Transkrîptomîkî ya Yekgirtî Mekanîzmaya Xweparastinê ji bo Kûrek Kevirê Hevbeş a Berxwedêr a CyHV-3' eşkere dike', Frontiers in Immunology, 12, r. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Pêşîtkirina Bingeha Yekbûna Pir-Omics ya Tora Rêvebiriya RNA ya Endogenous a Pêşbaz di Penceşêra Pişikê ya Hucreya Piçûk de: Taybetmendiyên Molekular û Namzetên Dermanan', Sînorên di Onkolojiyê de, 12, r. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Dabeşkirina genetîkî ya tora hevîfadekirina genê ya ku di binê fotosentezê de di Populus de ye', Kovara Biyoteknolojiya Nebatê, 18 (4), rûpel 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Torek Rêkûpêk a Gerdûnî ji bo Vebijandina Genê ya Birêkûpêk û Nîşana Metabolîk a Nenormal di Hucreyên Xweparastinê de Di Mîkrohawirdora Nexweşiya Graves' û Thyroiditisê Hashimoto' de, Sînorên di Immunolojiyê de, 13, r. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.