BMKCloud Log in
条形banner-03

Products

Rêzkirina Metagenomîk -NGS

Metagenom tê wateya berhevoka maddeya genetîkî ya tevayî ya civakek organîzmayên tevlihev, wek metagenoma jîngehê, metagenoma mirov, hwd. Ew genomên mîkroorganîzmayên çandinî û neçandî dihewîne.Rêzkirina metagenomîk amûrek molekular e ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ku ji nimûneyên hawîrdorê têne derxistin, tê bikar anîn, ku di cûrbecûr û pirbûna cûreyan de, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora pêwendiyê bi faktorên jîngehê re agahdariya berfireh peyda dike.

Rawesta axaftevan:Platforma Illumina NovaSeq


Details Service

Encamên Demo

Lêkolîna Case

Avantajên Service

● Ji bo profîla civaka mîkrobial bê îzolekirin û çandinî

● Di tesbîtkirina cureyên kêm-bilind ên di nimûneyên hawîrdorê de çareseriya bilind

● Fikra "meta-" hemî taybetmendiyên biyolojîkî di asta fonksiyonel, asta celeb û genê de yek dike, ku nêrînek dînamîkî ku nêzîkê rastiyê ye nîşan dide.

● BMK bi zêdetirî 10,000 nimûneyên pêvajoyî di cûrbecûr nimûneyên cihêreng de ezmûnek girseyî berhev dike.

Specifications Service

 Rawesta axaftevan

Rêzkirin

Daneyên pêşniyar kirin

Dema zivirandinê

Platforma Illumina NovaSeq

PE150

6 G/10 G/20 G

45 rojên xebatê

Analîzên biyoinformatics

● Kontrolkirina kalîteya daneya xav

● Meclîsa Metagenome

● Set û annotation gene non-zirav

● Analîzên cihêrengiya cureyan

● Analîzkirina cihêrengiya fonksiyona genetîkî

● Analîzên navbera koman

● Analîza komeleyê li dijî faktorên ceribandinê

liuhengtu11

Sample Requirements û Delivery

Pêdiviyên Nimûne:

BoDerxistina DNA:

Tîpa Nimûne

Biha

Lisersekinî

Paqijiyê

Derxistina DNA

> 30 ng

> 1 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

Ji bo nimûneyên hawirdorê:

Tîpa nimûne

Pêvajoya nimûneyê ya pêşniyar kirin

Erd

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Pêdivî ye ku maddeya hişkbûyî ya mayî ji rûyê erdê were rakirin;Parçeyên mezin hûr bikin û di parzûna 2 mm re derbas bikin;Ji bo veqetandinê di lûleya EP an cyrotube ya sterîl de nimûneyên aliqut.

Feces

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Ji bo veqetandinê di lûleya EP-ya sterîl an çîrûkek sterîl de nimûneyan berhev bikin û veqetînin.

Naveroka rovî

Pêdivî ye ku nimûne di bin şertên aseptîk de bêne çêkirin.Bi PBS tevna berhevkirî bişon;PBS-ê santrîfuj bikin û baranê di lûleyên EP-ê de berhev bikin.

Sludge

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Ji bo veqetandinê di lûleya EP-ê ya sterîl an jî di lûleya krîyoyê de nimûneya lûlê berhev bikin û veqetînin

Waterbody

Ji bo nimûneya bi mîqdarek sînorkirî ya mîkroban, wek ava tîrêjê, ava bîrê, hwd., Bi kêmanî 1 L av berhev bikin û di parzûna 0.22 μm re derbas bikin da ku mîkrobialê li ser membranê dewlemend bikin.Parzûnê di lûleya sterîl de hilînin.

Çerm

Bi baldarî rûbera çerm bi pembûya sterîl an jî lûleya neştergerî biperçiqînin û bixin nav lûleya sterîl.

Pêşniyara Sample Delivery

Nimûneyan di nîtrojena şil de 3-4 demjimêran bicemidînin û di nîtrojena şil de an -80 derece ji bo veqetandina demdirêj hilînin.Veguheztina nimûneyê bi qeşa hişk hewce ye.

Xizmeta Kar Herikîna

teslîmkirina nimûne

Sample delivery

Amadekirina Pirtûkxaneyê

Avakirina pirtûkxaneyê

Rêzkirin

Rêzkirin

Analîzkirina daneyan

Analîzkirina daneyan

Karûbarên piştî firotanê

Xizmetên piştî firotanê


  • Pêşî:
  • Piştî:

  • 1.Histogram: Belavbûna cureyan

    3

    2. Genên fonksiyonel ên ku li ser rêyên metabolê yên KEGG têne şîrove kirin

    4

    3.Nexşeya germê: Fonksiyonên cihêreng li ser bingeha pirbûna genê têkildar54.Circos of CARD genên berxwedana antîbiyotîk

    6

    BMK Case

    Berbelavbûna genên berxwedana antîbiyotîk û pathogenên bakterî yên li ser domdariya root axê-mangrove

    Weşandin:Kovara Materyalên Xeterdar, 2021

    Stratejiya rêzgirtinê:

    Materyal: Derhênanên DNA yên çar perçeyên nimûneyên girêdayî koka mangrove: axa neçandî, rhizosphere, episphere û beşên endosphere.
    Platform: Illumina HiSeq 2500
    Armanc: Metagenom
    16S rRNA gene herêmê V3-V4

    Encamên sereke

    Rêzkirina metagenomîk û profîlên metabarkodkirinê yên li ser domdariya ax-kokê ya şitilên mangrove ji bo lêkolîna belavkirina genên berxwedana antîbiyotîk (ARG) ji axê di nav nebatan de hate xebitandin.Daneyên metagenomîk eşkere kir ku 91.4% ji genên berxwedana antîbiyotîk bi gelemperî di her çar beşên axê yên ku li jor hatine destnîşan kirin de hatine nas kirin, ku moda domdar nîşan didin.Rêzkirina amplikonê ya 16S rRNA 29,285 rêzik çêkirin, ku 346 cureyan temsîl dikin.Bi hevberdana bi profîlên cureyan re bi rêzgirtina amplicon ve, hate dîtin ku ev belavbûn ji mîkrobiota-girêdayî root serbixwe ye, lêbelê, ew dikare ji hêla mobîl a hêmanên genetîkî ve were hêsan kirin.Vê lêkolînê herikîna ARG û pathogenên ji axê di nav nebatan de bi navgîniya domdariya ax-root a bi hev ve girêdayî nas kir.

    Balkêşî

    Wang, C., Hu, R., Strong, PJ, Zhuang, W., & Shu, L.(2020).Berbelavbûna genên berxwedanê yên antîbiyotîk û pathogenên bakterî li ser berdewamiya ax-mangrove root.Kovara Materyalên Xeterdar, 408, 124985.

    quote bistînin

    Peyama xwe li vir binivîse û ji me re bişîne

    Peyama xwe ji me re bişînin: