BMKCloud Têkeve

Products

Rêzkirina Metatranscriptome

Metatranscriptome Sequencing Wêne Taybetmendî

Bi karanîna teknolojiya rêziknameya Illumina, karûbarê rêzgirtina metatranscriptome ya BMKGENE vebêja genê dînamîkî ya cûrbecûr mîkroban, ku eukaryotan heya prokaryotes û vîrusan vedihewîne, di nav hawîrdorên xwezayî yên wekî ax, av, derya, stû û rûvî de vedike. Karûbarê meya berfereh hêz dide lêkolîneran ku li profîlên bêkêmasî yên îfadeya genê ya civakên mîkrobîkî yên tevlihev bigerin. Ji analîza taksonomîkî wêdetir, karûbarê meya rêzgirtina metatranscriptome vekolîna di dewlemendkirina fonksiyonel de hêsantir dike, ronahiyê dide genên bi rengek cûda û rola wan. Gava ku hûn li perestgehên tevlihev ên vegotina genê, cihêrengiya taksonomî, û dînamîkên fonksiyonel ên di nav van cihêrengên hawîrdorê yên cihêreng de rêve dibin, gelek têgihîştina biyolojîkî derxînin holê.

Paqij bûn

Details Service

Bioinformatics

Encamên Demo

weşanên diyarkirî

Taybetmendiyên Xizmetê

● Kêmkirina rRNA li dûv amadekirina pirtûkxaneya mRNA ya arasteyî.

● Rêzkirin li ser Illumina NovaSeq.

Avantajên Service

●Guhertinên Civakên Microbial Tevlihev bixwînin:Ev di asta transkripsiyonê de çêdibe û genên nû yên potansiyel lêkolîn dike.

●Ravekirina Têkiliyên Civaka Mîkrobial bi Mêvandar an Jîngehê re.

●Analîza Bioinformatîk a Berfireh: Ev li ser pêkhateyên taksonomî û fonksiyonel ên civakê, û her weha analîza vegotina genê ya cihêreng têgihiştinan peyda dike.

●Annotation Gene Berfireh:Bikaranîna databasên fonksiyona genê ya nûjen ji bo agahdariya vegotina genê ya agahdar ên civakên mîkrobîkî.

●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi serdemek karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.

Specifications Service

Platforma rêzgirtinê	Stratejiya Sequencing	Daneyên pêşniyar kirin	Kontrola Kalîteya Daneyê
Illumina NovaSeq	PE150	12 Gb	Q30≥85%

Sample Requirements

Konsantrekirin (ng/µL)	Mîqdara giştî (μg)	Volume (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Xizmeta Kar Herikîna

Sample delivery

Avakirina pirtûkxaneyê

Rêzkirin

Analîzkirina daneyan

Xizmetên piştî firotanê

Pêşî: De novo Meclîsa Genome Fungal

Piştî: Rêzkirina RNAya Prokaryotî

Di nav de analîzên jêrîn hene:

● Rêzkirina Kontrola Kalîteya Daneyê

● Meclisa Transcript

● Annotation û Pirrbûna Taxonomîk

● Annotation û Pirrbûna Fonksiyonel

● Hêjdarkirin û Analîza Cudabûnê ya Îfadeyê

Dabeşkirina taksonomî ya her nimûne:

Analîza cihêrengiya betayê: UPGMA

Annotation fonksîyonel - GO pirbûna

Pirbûna taksonomiya cihêreng - LEFSE

Pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzgirtina meta transkriptomîk ên BMKGene ve bi navgîniya berhevokek weşanan ve hatî hêsan kirin vekolin.

Lu, Z. et al. (2023) 'Tolerasyona asîdê ya bakteriyên laktat-bikarhêner ên ji rêza Bacteroidales beşdarî pêşîlêgirtina acidoza ruminal di bizinên ku bi parêzek bi konsantreya bilind ve hatî adaptekirin dike',Xwarina Heywanan, 14, rûp 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. et al. (2017) 'Rakirina mîkrobiota fonksiyonel a bingehîn di fermentasyona kevneşopî ya hişk a bi amplikonên berbi bilind û rêzgirtina metatranscriptomîk de',Sînorên di Mîkrobiolojiyê de, 8 (JUL). doi: 10.3389 / FMICB.2017.01294 / FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Mycovirusên Nû Ji Lêkolînek Metatranskriptomîkî ya Kîçê Alternaria Phytopathogenic Hat Vedîtin',Vîrûs, 14(11), r. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Analîzkirina metatranskriptomeya paralel hilweşîna metabolîtên duyemîn ên nebatê ji hêla mêş û hevrêzên wan ên rûvî ve diyar dike',Molecular Herêmparêzî, 31 (15), rûpel 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.