page_head_bg

Products

Metagenomic Sequencing-Nanopore

Metagenomics amûrek molekular e ku ji bo analîzkirina materyalên genomîk ên tevlihev ên ku ji nimûneyên hawîrdorê hatine derxistin, tê bikar anîn, ku agahdariya hûrgulî di pirrengî û pirbûna cureyan de, avahiya nifûsê, têkiliya fîlogenetîkî, genên fonksiyonel û tora pêwendiyê bi faktorên jîngehê re, hwd. ji bo lêkolînên metagenomîk.Performansa wê ya berbiçav di dirêjahiya xwendinê de bi giranî analîza metagenomîkî ya jêrîn, nemaze kombûna metagenome zêde kir.Bi sûdwergirtina ji dirêjahiya xwendinê, lêkolîna metagenomîk a li ser bingeha Nanopore dikare li gorî metagenomîkên gulebaranê berhevkirina domdartir bi dest bixe.Hate weşandin ku metagenomîkên bingehîn ên Nanopore bi serfirazî genomên bakterî yên bêkêmasî û girtî ji mîkrobiomeyan hilberandine (Moss, EL, et.Nature Biotech, 2020)

Rawesta axaftevan:Nanopore PromethION P48


Details Service

Encamên Demo

BMK Case

Avantajên Service

ØCivîna kalîteya bilind-Zêdekirina rastbûna nasîna celeb û pêşbîniya genê fonksiyonel

ØVeqetandina genoma bakterî ya girtî

ØSepana bi hêztir û pêbawertir di warên cihêreng de, wek mînak tespîtkirina mîkroorganîzmayên pathogenîk an genên têkildar bi berxwedana antîbiyotîkê.

ØAnalîza metagenome ya berawirdî

Specifications Service

RêzkirinRawesta axaftevan

Pirtûkxane

Hilberîna daneya pêşniyarkirî

Dema zivirîna texmînkirî

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K Tags

30 Roj

Analîzên biyoinformatics

üKontrolkirina kalîteya daneya xav

üMeclîsa Metagenome

üSet û annotation gene non-zirav

üAnalîza cihêrengiya cureyan

üAnalîza cihêrengiya fonksiyona genetîkî

üAnalîza nav-komê

üAnalîza komeleyê li dijî faktorên ceribandinê

2

Sample Requirements û Delivery

Pêdiviyên nimûne û radestkirinê

Pêdiviyên Nimûne:   

BoDerxistina DNA:

Tîpa Nimûne

Biha

Lisersekinî

Paqijiya

Derxistina DNA

> 30 ng

> 1 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

Ji bo nimûneyên hawirdorê:

Tîpa nimûne

Pêvajoya nimûneyê pêşniyar kirin

Erd

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Pêdivî ye ku maddeya hişkbûyî ya mayî ji rûyê erdê were rakirin;Parçeyên mezin hûr bikin û di parzûna 2 mm re derbas bikin;Ji bo veqetandinê di lûleya EP an cyrotube ya sterîl de nimûneyên aliqut.

Feces

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Ji bo veqetandinê di lûleya EP-ya sterîl an çîrûkek sterîl de nimûneyan berhev bikin û veqetînin.

Naveroka rovî

Pêdivî ye ku nimûne di bin şertên aseptîk de bêne çêkirin.Bi PBS tevna berhevkirî bişon;PBS-ê santrîfuj bikin û baranê di lûleyên EP-ê de berhev bikin.

Sludge

Mîqdara nimûneyê: nêzîkî.5 g;Ji bo veqetandinê di lûleya EP-ya sterîl an jî çîrûka çîpekê de nimûneya lûlê berhev bikin û veqetînin

Waterbody

Ji bo nimûneya bi mîqdara mîkrobial a bisînor, wek ava tîrêjê, ava bîrê, hwd., Bi kêmanî 1 L av berhev bikin û di parzûna 0,22 μm re derbas bikin da ku mîkrobialê li ser membranê dewlemend bikin.Parzûnê di lûleya sterîl de hilînin.

Çerm

Bi baldarî rûbera çerm bi pembûya sterîl an jî lûleya neştergerî biperçiqînin û bixin nav lûleya sterîl.

Pêşniyara Sample Delivery

Nimûneyên di nîtrojena şil de 3-4 demjimêran bicemidînin û di nîtrojena şil de an -80 derece ji bo veqetandina demdirêj hilînin.Veguheztina nimûneyê bi qeşa hişk hewce ye.

Xizmeta Kar Herikîna

logo_02

Sample delivery

logo_04

Avakirina pirtûkxaneyê

logo_05

Rêzkirin

logo_06

Analîzkirina daneyan

logo_07

Xizmetên piştî firotanê


  • Pêşî:
  • Piştî:

  • 1.Nexşeya germ: Kombûna dewlemendiya cureyan32. Genên fonksiyonel ên ku li ser rêyên metabolê yên KEGG têne şîrove kirin43.Têra pêwendiya celeb54.Circos of CARD genên berxwedana antîbiyotîk
    6

    BMK Case

    Nanopore metagenomics teşhîsa klînîkî ya bilez a enfeksiyona tansiyona jêrîn a bakterî dihêle

    Weşandin:Biyoteknolojiya Xwezayê, 2019

    Highlights Teknîkî
    Rêzkirin: Nanopore MinION
    Bioinformatics metagenomics klînîkî: Kêmkirina DNA ya mêvandar, analîza WIMP û ARMA
    Tespîtkirina bilez: 6 demjimêr
    Hesasiyeta bilind: 96,6%

    Encamên sereke

    Di sala 2006 de, enfeksiyona nefesa jêrîn (LR) bû sedema mirina 3 mîlyon mirovî li cîhanê.Rêbaza tîpîk ji bo tespîtkirina pathogen LR1 çandinî ye, ku xwedan hestiyariyek qels e, dema zivirîna dirêj e û di terapiya antîbiyotîk a destpêkê de ne rêbernameyek e.Teşhîsek mîkrobîkî ya bilez û rast demek dirêj hewcedariyek lezgîn e.Dr.Li gorî xebata wan, ji sedî 99,99 ADN-ya mêvandar dikare bête qut kirin.Tespîtkirina di pathogen û genên berxwedêr ên antîbiyotîk de dikare di 6 saetan de biqede.

    Balkêşî
    Charalampous, T., Kay, GL, Richardson, H., Aydin, A., & O'Grady, J.(2019).Nanopore metagenomics teşhîsa klînîkî ya bilez a enfeksiyona tansiyona jêrîn a bakterî dihêle.Biyoteknolojiya Xwezayê, 37 (7), 1.

    quote bistînin

    Peyama xwe li vir binivîse û ji me re bişîne

    Peyama xwe ji me re bişînin: