Nanopore transkrîptoma tevahî-dirêj

Rêzkirina transkrîptomê ya nanopore rêbazek bihêz e ji bo rêzkirina cDNA-yên dirêjahiya tevahî, bi awayekî rast nasandin û hejmartina îzoformên transkrîptê. Boriya Transkrîptomê ya Dirêjahiya Tevahî ya BMKCloud Nanopore ji bo analîzkirina daneyên RNA-Seq ên li ser platforma Nanopore li dijî genomek referansê ya bi kalîte bilind-baş-şîrovekirî hatî çêkirin, ku analîza kalîteyî û hejmarî hem di asta gen û hem jî di asta transkrîptê de peyda dike. Piştî kontrola kalîteyê, rêzikên ne-kîmerîk ên dirêjahiya tevahî (FLNC) têne bidestxistin û rêzikên lihevhatî li ser genoma referansê têne nexşandin da ku transkrîptên zêde werin rakirin. Ji vê koma transkrîptê, îfade tê hejmartin û gen û transkrîptên bi awayekî cûda hatine îfadekirin têne destnîşankirin û bi fonksiyonel têne şîrovekirin. Borî di heman demê de analîza polîadenîlasyona alternatîf (APA), analîza splicing-a alternatîf, analîza dubarekirina rêzika hêsan (SSR), pêşbîniya lncRNA û hedefên têkildar, pêşbîniya rêzikên kodkirinê (CDS), analîza malbata genê, analîza faktora transkrîpsiyonê, pêşbîniya genên nû û şîrovekirina fonksiyonel a transkrîptan vedihewîne.