Products

Plant / Animal Tevahiya Genom Sequencing

Rêzkirina Nebat/Animal Tevahiya Genome Wêneyê Taybetmendî

Ji nû ve rêzgirtina tevaya genomê, ku wekî WGS jî tê zanîn, hem mutasyonên hevpar û hem jî yên nadir li ser tevahiya genomê di nav wan de Polîmorfîzma Yekane Nukleotide (SNP), Jêbirina Tevgerê (InDel), Guhertoya Strukturê (SV), û Guherîna Hejmara Kopî (CNV) dide xuyakirin. ).SV ji SNP-an beşek mezin a bingeha guherînê pêk tînin û bandorek mezin li ser genomê dikin, ku bandorek girîng li ser organîzmayên zindî dike.Veguhastina dirêj-xwendin rê dide naskirina rasttir a perçeyên mezin û guheztinên tevlihev ji ber ku xwendina dirêj derbaskirina kromozomî li ser deverên tevlihev ên wekî dûbarekirina hevdemî, herêmên dewlemend-GC/AT, û herêmên hîper-guhêrbar pir hêsantir dike.

Platform: Illumina, PacBio, Nanopore

Paqij bûn

Details Service

Encama Demo

Weşana Taybetmendî

1.Awantajên Xizmetê

Tecrûbeya berfereh di rêzgirtina genomê de ji bo zêdetirî 1000 cureyan.

Zêdetirî 800 dozên hatine weşandin ku bi faktorek bandorek berhevkirî ji 4000 zêdetir e.

Li ser gazîkirina guheztinê û analîza fonksiyonê vekolîna biyoinformatîk a berfireh.

2. Specifications Service

Rawesta axaftevan		Pirtûkxane	Kûrahiya seqê pêşniyar kirin
Illumina		PE 150	Ji bo SNP, InDel ≥ 10x bang dike Ji bo SV, CNY ≥ 30x bang dike
Nanopore		8 kb	Ji bo SV, CNY ≥ 20x bang dike
Pacbio	CCS	15 kb	Ji bo banga SNP, InDel, SV, CNY ≥ 10x

3. Pêdiviyên Sample

Rawesta axaftevan		Conc.(ng/μL)	Mîqdar (ng)	Paqijiyê		Gel agarose
				OD260/280	OD260/230	1. band sereke Clear bi no an bi sînorhilweşîna li ser gel tê dîtin. 2. ARN an jî proteîn gemarî tune an bi sînor
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopore		≥30	Bi hilberîna daneyê ve girêdayî ye 10 μg/hucre	1.7-2.2	≥1.5
Pacbio	CCS	≥50		1.7-2.2	1,8-2,5

4. Analysis Bioinformation

5. Herikîna Karê Xizmetê

Sample delivery

derxistina DNA

Avakirina pirtûkxaneyê

Rêzkirin

Analîzkirina daneyan

Radestkirina daneyan

Pêşî: BMKMANU S1000 Transcriptome Cihanî

Piştî: Rêzkirina ARNyê ya yek-nok

1) Statîstîkên Nexşeya Genome

Tablo 1 Statîstîkên encama nexşeyê

Figure 1 Dabeşkirina mezinahiya têxê û vegirtina xwendinê.

2) Vebijêrk Variate

Figure 2 Amar û ravekirina SNP/INDEL/SV di nav Nimûneyan de

Wêne 3 Dabeşkirina vateyan li seranserê genomê

3) Şîrovekirina fonksiyonel a variations

2019	Têkiliyên xwezayê	Veguheztina tevahiya genomê eslê Brassica napus û cîhên genetîkî yên ku di başkirina wê de beşdar in eşkere dike.
2020	PNAS	Dîroka pêşveçûn û kedîkirina masiyên zêrîn (Carassius auratus)
2021	Plant Biotechnology Journal	Genomên referansê yên du celebên jute yên çandinî
2021	Plant Biotechnology Journal	Nîşaneyên genomîkî yên allopolyploid Brassicajuncea yên nebatî û tovên rûn û cîhên genetîkî ku kombûna glucosinolates kontrol dikin.
2019	Plant Molecular	Veguheztina tevahiya genomê ya berhevokek gerdûnî ya tevlêbûna tovên tecawizê bingeha genetîkî ya cihêrengiya ekotîpa wan eşkere dike.
2022	Lêkolîna Baxçevaniyê	Analîzkirina komeleyê ya li seranserê genomê di derheqê guheztina xwezayî ya mezinahiya tovê zebeşê de nihêrînên molekulî peyda dike
2021	Kovara Ceribandinên Botanê	Lêkolîna komeleyê ya li seranserê genomê guhertoyên GhSAD1 destnîşan dike ku di pembû de tolerasyona sermayê dide
2021	Kovara Ceribandinên Botanê	Lêkolîna komeleyê ya li seranserê genomê û berhevdana transkrîptomê QTL-ya nû û genên berendam eşkere dikin ku mezinahiya petalê di tovê raçavê de kontrol dikin.